ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 57

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016373	TCCT	3	51	62	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016373	CTT	4	189	201	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016373	CTC	4	603	613	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016373	TTTGT	3	661	675	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016373	AGAA	3	944	955	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016373	CT	6	3005	3015	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016373	ATTC	4	5041	5056	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016373	CGCT	3	5556	5566	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016373	AT	6	8447	8457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016373	AGA	4	8839	8851	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016373	TAGA	3	9334	9346	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016373	AGA	4	9913	9924	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016373	TAGA	3	10017	10028	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016373	AT	6	10037	10048	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016373	ATT	4	10436	10446	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016373	ACTATT	3	10854	10871	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016373	TAC	4	11062	11072	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016373	ATTAT	3	11303	11317	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016373	TTA	4	12026	12036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016373	AT	6	12229	12240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016373	AAG	4	12241	12252	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016373	AG	6	12551	12562	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016373	TGA	4	12929	12939	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016373	AAG	4	13654	13664	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016373	GAA	4	14268	14278	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016373	GAA	4	14312	14322	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016373	AAAG	3	14331	14342	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016373	AG	6	14606	14616	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016373	AAAG	3	15382	15393	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016373	AG	6	15510	15520	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016373	AAAGA	3	16688	16702	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016373	TCA	4	16950	16960	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016373	ACT	4	17200	17210	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016373	A	12	17529	17540	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016373	T	12	18107	18118	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016373	A	12	18329	18340	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016373	CCTT	3	19435	19446	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016373	TCGG	3	20064	20076	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016373	AAGGC	3	20465	20479	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016373	TC	6	20824	20834	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016373	AAGAAA	3	20979	20996	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_016373	GAAAG	3	21202	21215	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016373	GCTG	3	21508	21519	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016373	TTTC	3	24868	24878	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016373	A	14	30739	30752	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016373	CCTT	3	33341	33353	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016373	TTCT	3	34476	34487	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016373	TAGG	3	36294	36304	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016373	TTAC	3	36913	36923	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016373	AGT	4	38880	38892	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016373	A	12	39900	39911	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016373	GTTC	3	40311	40321	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016373	T	15	42529	42543	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016373	TA	6	42563	42573	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016373	AATA	3	42617	42628	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016373	CTT	4	42856	42868	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016373	TA	6	43854	43864	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016373	TCTA	3	44077	44087	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016373	GAA	4	44933	44945	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016373	TA	6	45340	45350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016373	CAC	4	45373	45383	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016373	AGTAA	3	45485	45498	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016373	TA	6	46071	46081	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016373	CTATAA	3	46848	46865	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016373	CTT	4	47070	47080	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016373	GAA	4	47093	47103	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016373	ATAA	3	47287	47298	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016373	TCT	4	47455	47467	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016373	GCC	4	48538	48548	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016373	TG	6	49066	49076	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016373	CTTT	3	49313	49323	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016373	TCACA	3	49341	49354	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016373	ATA	4	50216	50228	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016373	TA	7	50977	50989	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016373	ACCATA	3	51243	51261	19	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
76	NC_016373	ATCT	3	51731	51741	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016373	TA	7	51750	51762	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016373	AGT	4	51904	51914	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016373	ACTA	3	52301	52311	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016373	TTGAA	3	53713	53726	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016373	TTTG	3	54293	54303	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016373	CTTT	3	54512	54522	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016373	TCTT	4	55153	55168	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016373	A	13	55363	55375	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016373	ATT	4	55427	55438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016373	T	18	56239	56256	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016373	GAAA	3	56631	56642	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016373	TGA	4	57114	57125	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016373	AGA	4	58053	58064	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016373	TAGT	3	58789	58799	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016373	T	29	59263	59291	29	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016373	GAAA	3	59482	59493	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016373	ACTT	3	59545	59557	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016373	GTAA	3	59940	59952	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016373	AAAG	3	60309	60320	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016373	AGAT	3	60790	60801	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016373	AGTG	3	60873	60884	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016373	A	16	61668	61683	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016373	AAG	4	63588	63599	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016373	CTT	4	63864	63874	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016373	CT	6	64119	64129	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016373	CCT	4	64211	64221	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016373	GCATA	3	65469	65482	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016373	GAT	4	67357	67367	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016373	A	15	68455	68469	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016373	AAGAAA	3	68660	68677	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_016373	CTT	4	69221	69232	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016373	G	13	70196	70208	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016373	TAT	4	70433	70444	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016373	TAA	4	70592	70603	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016373	TAC	4	70738	70749	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016373	TTAA	3	72999	73009	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016373	TA	9	73509	73526	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_016373	TTA	5	73598	73612	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016373	TAT	4	73704	73714	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016373	TTCT	3	74543	74553	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

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