ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 5

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016372AAAT3202320341275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_016372CAAT3317531861250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
3NC_016372ACTT3325732681225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
4NC_016372TATT3931893301325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_016372TGAA3941194211150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
6NC_016372CTTA311621116311125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
7NC_016372CTTT31223712247110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
8NC_016372TATC313977139891325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
9NC_016372GTAG314044140551225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
10NC_016372TTTC31683016841120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
11NC_016372AAGT317158171691250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
12NC_016372TCTT31790317914120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
13NC_016372AATG318691187021250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
14NC_016372TTGC31903919050120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
15NC_016372CTTA319873198841225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
16NC_016372AGAA321776217861175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
17NC_016372AGAA321864218741175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016372CTAG322490225011225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
19NC_016372AGCC324834248451225 %0 %25 %50 %0 %Non-Coding
20NC_016372TCCC32659626607120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
21NC_016372TCTT33194131952120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
22NC_016372CTTT33286132872120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
23NC_016372GACA333533335451350 %0 %25 %25 %7 %Non-Coding
24NC_016372ATTA334447344591350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_016372GAAA334463344741275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
26NC_016372GCTC33527235282110 %25 %25 %50 %9 %Non-Coding
27NC_016372AAAG337453374631175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
28NC_016372CAAG337596376071250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
29NC_016372AAAT338176381871275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016372ACTT338604386161325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
31NC_016372AGCA345241452531350 %0 %25 %25 %7 %Non-Coding
32NC_016372AATA347089470991175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
33NC_016372CTTT34831048321120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
34NC_016372TTTC34940149411110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
35NC_016372ATTC349800498121325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
36NC_016372GTTG35641356424120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
37NC_016372TATT356779567891125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_016372TCAA363672636841350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
39NC_016372TAAG364912649231250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016372CGGT36609366104120 %25 %50 %25 %0 %Non-Coding
41NC_016372AAAG366145661561275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
42NC_016372TTGA368438684481125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016372AAGG369357693681250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
44NC_016372TTTG37848678496110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
45NC_016372TCCT37868278692110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
46NC_016372ACAT381559815701250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
47NC_016372AAAG382145821551175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
48NC_016372GAAT387484874951250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
49NC_016372TTCA388931889421225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
50NC_016372AAGA389062890731275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
51NC_016372GTAA391548915591250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
52NC_016372AAGA392108921191275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016372ACTT395141951511125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_016372CTTT39562995640120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
55NC_016372GCAT396381963921225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
56NC_016372TTTG39673196741110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
57NC_016372GTAA397109971191150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
58NC_016372CTTT39976199772120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
59NC_016372GAAA31031061031171275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
60NC_016372TTTC3103986103996110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
61NC_016372GTAA31044481044581150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
62NC_016372TTCC3106011106021110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
63NC_016372CTTT3107029107039110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
64NC_016372TTTA31071221071331225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016372AAAG31081031081131175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
66NC_016372AAAG31106261106371275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
67NC_016372AAAG31116771116881275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
68NC_016372TTTA31128271128381225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
69NC_016372TTTC3114918114929120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
70NC_016372AATA31201161201271275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
71NC_016372CTAA31225351225461250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
72NC_016372TTGA31245961246071225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
73NC_016372TCAA31263781263891250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
74NC_016372AAAG31269701269801175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
75NC_016372TTTC3129382129393120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
76NC_016372CGAA31295681295791250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
77NC_016372AAGT31312181312281150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
78NC_016372CTTT3132310132321120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
79NC_016372TAAA31338101338201175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016372TTAA31340871340981250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
81NC_016372ATAG31362831362941250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016372CTTC3136982136993120 %50 %0 %50 %0 %Non-Coding
83NC_016372GACA31385281385381150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
84NC_016372TTTG3144427144438120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
85NC_016372GATT31466081466181125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
86NC_016372CCTT3147227147238120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding