Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 5

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016372CTT415421555140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
2NC_016372CAT4193219421133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_016372GAT4208820991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
4NC_016372TAA4488448951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016372CTG465276538120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
6NC_016372TCT41453914550120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_016372ATA417732177421166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016372AGA418845188561266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
9NC_016372ATA419324193351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_016372CTG42042020431120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
11NC_016372TAA421265212751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_016372TTC42198821999120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
13NC_016372CTT42632026330110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
14NC_016372ATA529774297871466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
15NC_016372CTT43142431434110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
16NC_016372AAG432373323831166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
17NC_016372ATT432415324251133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016372GTT43465534666120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016372AAG441690417011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016372AAG444749447611366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
21NC_016372CTA549925499401633.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
22NC_016372ATC451150511611233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_016372GAT452193522031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_016372TAT455125551351133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_016372ACA456429564401266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_016372TGG45874058751120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
27NC_016372CAT458947589571133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
28NC_016372AGT560574605871433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
29NC_016372ACT465756657661133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_016372ATA566042660551466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_016372TAT466688667001333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_016372TCT46691566927130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
33NC_016372ATA467391674021266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016372GAA468319683291166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_016372ATA472116721271266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_016372CAG472553725631133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
37NC_016372GTC47500375013110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
38NC_016372TTC47584075851120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
39NC_016372TCG47795777969130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
40NC_016372CTT47955579566120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
41NC_016372TTA481036810471233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_016372TAG481573815831133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016372TTA483978839901333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
44NC_016372CGC48454284552110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
45NC_016372GAT486626866361133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
46NC_016372TAG487638876481133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016372CTT48966489674110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
48NC_016372AGA491109911201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
49NC_016372ATA696470964861766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
50NC_016372CTA596546965591433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
51NC_016372TAA41009791009901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_016372TCT4104359104370120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
53NC_016372CTT4104978104990130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
54NC_016372TGA41092241092341133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016372AAG41099491099591166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
56NC_016372GAA41105631105731166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
57NC_016372GAA41106071106171166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
58NC_016372CTT4112103112113110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
59NC_016372ATA61173071173241866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
60NC_016372GAG41190041190141133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
61NC_016372GAA41190871190981266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
62NC_016372AGC41196111196221233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
63NC_016372TAA41235771235881266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016372TTA41259841259961333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
65NC_016372TTA41272251272351133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
66NC_016372GCT4128931128942120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
67NC_016372ATC41317521317631233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
68NC_016372CGG4131862131872110 %0 %66.67 %33.33 %9 %Non-Coding
69NC_016372TAT41336351336461233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
70NC_016372CTA41338651338751133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
71NC_016372AAC41365091365201266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
72NC_016372CTT4141552141564130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
73NC_016372ACT41415821415931233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
74NC_016372TTA41450831450931133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
75NC_016372ATA41468501468611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016372ATC41483391483491133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
77NC_016372CTT4148490148500110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding