ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 40

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016371	TTC	4	1861	1871	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016371	TCA	4	2588	2598	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016371	CTT	4	3233	3244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016371	AGT	4	8549	8560	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016371	TAT	4	11512	11523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016371	TAG	4	11785	11795	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016371	TTA	4	14809	14821	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016371	GAA	4	33441	33452	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016371	AGA	4	34930	34941	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016371	ATA	5	35089	35102	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016371	AAG	4	36205	36215	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016371	TCT	4	40021	40031	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016371	TTA	4	42408	42419	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016371	TAA	4	42540	42552	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016371	CTT	4	43891	43901	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016371	TCT	4	48904	48915	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016371	TCT	4	52800	52810	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016371	TAT	5	60469	60482	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016371	ATC	4	60854	60866	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016371	CTT	4	61173	61184	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016371	TGT	4	61793	61804	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016371	CTA	4	66195	66206	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016371	TCT	4	66859	66870	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016371	ACA	4	71836	71846	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016371	CTT	4	74260	74272	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016371	CAA	4	75541	75552	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016371	AAG	4	75566	75578	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016371	ATT	4	75628	75639	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016371	ACT	4	76081	76093	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016371	CTA	4	76426	76437	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016371	TGA	4	76612	76623	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016371	TAG	4	77346	77358	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016371	AAG	4	82847	82857	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016371	CTT	4	85900	85910	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016371	AAG	4	88281	88292	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016371	TAT	4	88623	88633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016371	TCT	4	90565	90575	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016371	AAG	4	92829	92840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016371	TTA	4	98484	98495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016371	CTA	4	99860	99871	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 40