ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 40

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016371	CT	6	7	17	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016371	TCTT	3	133	144	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016371	TC	6	910	920	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016371	CTTT	3	1185	1196	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016371	TTC	4	1861	1871	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016371	TCA	4	2588	2598	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016371	TC	7	2966	2979	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016371	CTT	4	3233	3244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016371	AAATT	3	5763	5778	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016371	AGCT	3	7675	7685	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016371	AGT	4	8549	8560	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016371	TAT	4	11512	11523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016371	GCTA	4	11704	11718	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016371	TAG	4	11785	11795	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016371	TCTT	3	13488	13499	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016371	A	12	14195	14206	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016371	TTA	4	14809	14821	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016371	CAAG	3	15898	15908	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016371	TTCT	3	17278	17290	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016371	CTTT	3	17468	17479	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016371	TTTC	3	17705	17716	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016371	TGAG	3	18543	18553	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016371	A	14	19019	19032	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016371	GCTA	3	19298	19309	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016371	TTCC	3	22902	22913	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016371	CGAGT	3	22947	22961	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016371	TAAT	3	24869	24880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016371	CTAC	3	25439	25451	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016371	AAAG	3	29526	29537	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016371	ATTG	3	30317	30328	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016371	AGGC	3	32650	32660	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016371	GAA	4	33441	33452	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016371	AGA	4	34930	34941	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016371	ATA	5	35089	35102	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016371	AAG	4	36205	36215	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016371	TTAT	3	38664	38675	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016371	TCT	4	40021	40031	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016371	TTA	4	42408	42419	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016371	TAA	4	42540	42552	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016371	CTT	4	43891	43901	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016371	GTCA	3	43925	43935	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016371	AGCT	3	44573	44584	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016371	CT	6	46338	46348	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016371	TATAAT	3	47867	47883	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_016371	GA	6	48316	48326	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016371	TCT	4	48904	48915	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016371	TGTC	3	49614	49624	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016371	AAAAG	3	52285	52298	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016371	ACTT	3	52381	52392	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016371	TCTCT	3	52547	52560	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016371	TCT	4	52800	52810	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016371	AATT	3	54171	54183	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016371	T	13	54334	54346	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016371	A	22	55487	55508	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
55	NC_016371	TTTC	3	56273	56283	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016371	CTTTT	3	58004	58018	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016371	TTTC	3	58039	58049	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016371	GATT	3	58214	58225	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016371	T	14	58332	58345	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016371	CAAA	3	60010	60020	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016371	AATG	3	60342	60353	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016371	TAT	5	60469	60482	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016371	ATC	4	60854	60866	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016371	CTT	4	61173	61184	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016371	TGT	4	61793	61804	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016371	AATTC	3	62386	62400	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016371	GT	6	62512	62523	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016371	T	19	62840	62858	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016371	TTAG	3	63083	63094	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016371	A	13	63412	63424	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016371	AAAG	3	64303	64314	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016371	TA	6	65620	65630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016371	CTA	4	66195	66206	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016371	TCT	4	66859	66870	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016371	AAGAA	3	67955	67969	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016371	AGGT	3	67987	67997	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016371	CCAA	3	68285	68295	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016371	GAAA	3	68427	68437	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016371	ACA	4	71836	71846	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016371	AACC	3	71922	71933	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016371	AT	6	72103	72113	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016371	GGGC	3	72460	72471	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016371	ATGAA	3	72520	72534	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016371	CTT	4	74260	74272	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016371	TCTT	3	74485	74495	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016371	T	17	75268	75284	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016371	AGTT	3	75387	75399	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016371	CAA	4	75541	75552	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016371	AAG	4	75566	75578	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016371	ATT	4	75628	75639	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016371	ACT	4	76081	76093	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016371	AAAGA	3	76250	76263	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016371	CTA	4	76426	76437	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016371	TGA	4	76612	76623	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016371	CATA	3	76723	76735	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016371	TAG	4	77346	77358	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016371	AT	6	77637	77647	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016371	AAAG	3	80012	80023	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016371	ATTTTA	3	80304	80321	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016371	CTTT	3	81245	81255	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016371	TTCA	3	81824	81834	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016371	AGCT	3	82500	82511	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016371	AAAGT	3	82528	82541	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016371	AAG	4	82847	82857	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016371	CTTT	3	84601	84613	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016371	TA	6	85488	85499	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016371	CTT	4	85900	85910	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016371	AATC	3	86746	86756	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016371	AT	6	86783	86794	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016371	TA	6	86860	86870	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016371	CTTG	3	87288	87299	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016371	GAAA	3	87969	87984	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016371	AAG	4	88281	88292	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016371	TAT	4	88623	88633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016371	T	14	88971	88984	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016371	TTAC	3	89796	89807	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016371	TAAA	3	90240	90251	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016371	TCT	4	90565	90575	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016371	TAAA	3	91103	91113	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016371	AACT	3	91335	91345	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016371	AAG	4	92829	92840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016371	A	13	94948	94960	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016371	CTTT	3	96109	96119	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016371	GTTTT	3	97385	97398	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016371	ATTTT	3	97444	97457	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016371	TTA	4	98484	98495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016371	CTA	4	99860	99871	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016371	TA	7	100223	100235	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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