ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 37

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016370	AGT	4	265	277	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016370	A	12	886	897	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016370	AT	6	914	924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016370	A	12	1597	1608	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016370	T	15	2198	2212	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016370	AGAA	3	2358	2369	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016370	CA	6	3040	3050	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016370	A	12	3141	3152	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016370	AG	6	3773	3784	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016370	TAT	4	5638	5649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016370	TCA	4	5665	5676	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016370	AT	6	5911	5921	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016370	TAA	4	8102	8113	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016370	T	12	8206	8217	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016370	GAAG	3	8384	8395	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016370	AACT	3	9371	9382	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016370	CCTT	3	9509	9520	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016370	CCG	4	10517	10528	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016370	CTAG	3	10974	10984	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016370	TA	6	11081	11092	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016370	TTA	4	11367	11379	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016370	TAG	4	11625	11635	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016370	AT	7	11739	11751	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016370	AGC	4	12345	12356	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016370	TCT	4	12939	12950	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016370	A	15	13769	13783	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016370	AGTA	3	14250	14260	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016370	TATATT	3	15563	15581	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_016370	GCTA	3	16324	16334	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016370	TTAAA	3	17471	17484	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016370	TTA	4	17886	17896	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016370	TA	6	17920	17930	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016370	TCTT	3	18533	18544	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016370	AGT	4	19521	19531	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016370	A	14	22103	22116	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016370	TTC	4	22760	22771	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016370	CTG	4	23349	23360	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016370	TTA	4	23646	23657	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016370	CAGC	3	23782	23794	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016370	CTTA	3	23795	23806	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016370	AAAG	3	23870	23881	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016370	GATG	3	23934	23946	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016370	AAAG	3	23957	23968	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016370	CGAA	3	24785	24796	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016370	CCAA	3	24931	24942	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016370	CTT	4	25323	25333	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016370	GA	6	27146	27156	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016370	TCT	4	27634	27644	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016370	ATT	4	27861	27872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016370	TTCCTC	3	28887	28905	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
51	NC_016370	TCT	4	29104	29114	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016370	ATT	4	29398	29408	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016370	TAAAG	3	30823	30837	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016370	AAAT	3	30873	30883	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016370	AATTT	3	31479	31494	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016370	ATA	4	31571	31581	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016370	GTT	4	32156	32167	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016370	CTAA	3	32996	33006	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016370	ATA	4	33016	33028	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016370	TTC	4	34669	34680	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016370	ATTT	3	34698	34709	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016370	TTA	4	34711	34722	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016370	CTTT	3	35026	35036	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016370	ACT	4	35968	35978	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016370	AGA	4	36598	36609	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016370	GTA	4	38800	38810	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016370	TAAA	3	40472	40483	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016370	TCT	4	40642	40653	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016370	ACTC	3	41388	41399	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016370	AATG	3	44189	44200	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016370	GGA	4	44342	44353	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016370	TAG	5	44610	44624	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016370	T	13	47681	47693	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016370	TCAG	3	48820	48830	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016370	TTCTA	5	50289	50313	25	20 %	60 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016370	AAT	4	50786	50797	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016370	GTTT	3	52873	52884	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016370	TC	7	53959	53972	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016370	TAA	4	54892	54902	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016370	TAGC	3	55260	55270	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016370	CATT	3	55781	55792	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016370	CT	6	56426	56436	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016370	AGTG	3	57932	57943	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016370	GAAA	3	58183	58194	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016370	TAA	4	58792	58803	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016370	CTGG	3	59152	59163	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016370	T	12	59883	59894	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016370	TATTT	3	59914	59928	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016370	AGA	4	60293	60303	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016370	GCAT	3	61328	61339	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016370	TGA	4	62317	62328	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016370	A	12	62516	62527	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016370	GTT	4	63121	63132	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016370	CTA	4	63224	63234	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016370	T	13	63468	63480	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016370	TGCT	4	64015	64030	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016370	GA	6	64036	64048	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016370	TCTT	4	64490	64504	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016370	TAAA	3	64902	64913	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016370	GTA	4	64935	64945	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016370	ATTTT	3	64979	64992	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016370	CTAA	3	65040	65051	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016370	TTTA	3	65937	65948	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016370	TA	6	65949	65959	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016370	T	12	66334	66345	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016370	A	16	66424	66439	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016370	TTTG	3	67647	67658	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016370	AAGA	3	68362	68374	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016370	CTTA	3	69808	69820	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016370	AAGTC	3	70166	70180	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016370	AGAA	4	70946	70961	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016370	CTT	4	71166	71176	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016370	AAAAG	3	71351	71365	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016370	CTTT	3	71543	71553	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016370	GAGG	3	71754	71765	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016370	A	12	72231	72242	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016370	CTT	6	72317	72335	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
118	NC_016370	AGCT	3	74379	74389	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016370	AAAG	3	74519	74531	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016370	TTAAA	4	74810	74830	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016370	AT	6	75346	75356	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016370	AGA	4	75804	75816	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016370	AAAGA	3	77358	77371	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016370	TAGA	3	77907	77917	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016370	ACT	4	78430	78440	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016370	CTT	4	78559	78570	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016370	GAAT	3	78609	78619	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016370	TTGG	3	79933	79944	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016370	GCGT	3	81449	81460	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016370	A	13	81652	81664	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016370	CTT	4	81669	81679	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016370	AAGC	3	82037	82048	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016370	ATC	4	83055	83065	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016370	AT	7	84280	84292	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016370	TA	8	85430	85445	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016370	AAAG	3	86857	86867	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016370	AAG	4	86886	86897	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016370	CTTT	3	87087	87097	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016370	GGTAG	4	87508	87526	19	20 %	20 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
140	NC_016370	ATCT	3	89477	89487	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016370	TA	6	89517	89527	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016370	AGAA	4	91034	91050	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
143	NC_016370	AGT	7	91319	91337	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
144	NC_016370	A	15	92942	92956	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016370	TA	6	94187	94197	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016370	TCT	4	94615	94627	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016370	AATT	3	95110	95122	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_016370	TTAG	3	95231	95241	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016370	TA	6	95635	95646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016370	AGAA	3	95791	95802	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016370	ACCT	3	96737	96749	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
152	NC_016370	GAA	4	97409	97420	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
153	NC_016370	AAAGAA	3	97439	97456	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
154	NC_016370	TAAGA	4	97934	97952	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
155	NC_016370	TTA	4	100179	100189	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016370	GAA	4	100552	100562	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016370	TTTG	3	101002	101013	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
158	NC_016370	CTTT	3	101396	101406	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
159	NC_016370	CTTTT	3	102416	102431	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 37