Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 52

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016367CTT45263120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
2NC_016367CTTA3951061225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
3NC_016367CTTC3200211120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
4NC_016367CCTC323132323110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
5NC_016367GTCC333253336120 %25 %25 %50 %0 %Non-Coding
6NC_016367A134224423613100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016367TAAG3516251731250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
8NC_016367TTGC353305340110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
9NC_016367TTTC353595370120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
10NC_016367AAT4555955701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016367TTCC375917602120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
12NC_016367TTTA3760576161225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016367T1478407853140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_016367ACTTT3871087231420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
15NC_016367CGAA3874787581250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
16NC_016367CTTT391909201120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
17NC_016367AAAG3972997401275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
18NC_016367A129882989312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016367A13103431035513100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_016367T121093610947120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_016367TTC41189311903110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
22NC_016367CTT41225012261120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_016367TAG412687126971133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_016367TC61334113351110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
25NC_016367T121362113632120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_016367A14148131482614100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_016367CTAT416026160411625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
28NC_016367AAAG316088160981175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
29NC_016367CTT41771117721110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_016367ACA418190182001166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
31NC_016367CTT42036620376110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
32NC_016367TTAC320617206281225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
33NC_016367TAA421409214201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016367AGC422667226771133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
35NC_016367GCAA323227232371150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
36NC_016367AAG423595236061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
37NC_016367TAT724532245532233.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_016367TTATGG325201252181816.67 %50 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
39NC_016367TCTT32666526675110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
40NC_016367AAG426891269021266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
41NC_016367CTTT32891328923110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
42NC_016367T123032130332120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_016367CTT43111331124120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
44NC_016367ATC431358313701333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
45NC_016367TCTATA331689317071933.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
46NC_016367CATA432108321221550 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
47NC_016367TTC43418034191120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
48NC_016367TTTA334739347501225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_016367A12348573486812100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016367TTA435405354151133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
51NC_016367ATCG335685356951125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
52NC_016367AGCG335929359401225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
53NC_016367CTTA336323363341225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
54NC_016367ATA436540365511266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016367CTA437854378651233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
56NC_016367ACTT338162381731225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
57NC_016367CA638179381891150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
58NC_016367A14386223863514100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_016367TCT43969439705120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
60NC_016367TCA440733407451333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
61NC_016367GATT341185411971325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
62NC_016367AAAAG442462424812080 %0 %20 %0 %10 %Non-Coding
63NC_016367CAAT343681436911150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
64NC_016367TCT44571945731130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
65NC_016367T124611946130120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_016367AGA448222482331266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
67NC_016367TCAT349350493611225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
68NC_016367TTC45038850400130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
69NC_016367TCTT35135751368120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
70NC_016367T165164151656160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
71NC_016367TACT353598536091225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
72NC_016367GCTT45377153786160 %50 %25 %25 %6 %Non-Coding
73NC_016367TCCA354987549971125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
74NC_016367CTT45508655098130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
75NC_016367TTAG355210552211225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016367TTTC35541555425110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
77NC_016367AGA455473554831166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
78NC_016367TCT45560155612120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
79NC_016367T155575755771150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
80NC_016367GAA556462564761566.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
81NC_016367GTAG357283572941225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016367GAAC357594576061350 %0 %25 %25 %7 %Non-Coding
83NC_016367ACT459029590391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
84NC_016367TCTT36043560446120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
85NC_016367CT66054860559120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
86NC_016367GCTT36092960939110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
87NC_016367AT763393634061450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_016367TAG463852638631233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
89NC_016367TACT364665646761225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
90NC_016367GAAA366029660401275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
91NC_016367AGA467804678151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
92NC_016367GTAA368609686201250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
93NC_016367TCAC372420724311225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
94NC_016367CTTA373596736081325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
95NC_016367TTTC37370273713120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
96NC_016367GA673725737361250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
97NC_016367GAAA374410744211275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
98NC_016367TCA475450754611233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
99NC_016367TTC47555475565120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
100NC_016367A14770457705814100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
101NC_016367AACG377202772131250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
102NC_016367TCT47754177552120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
103NC_016367CTTG37761277623120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
104NC_016367CTTTT37774777761150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
105NC_016367ATC480898809091233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
106NC_016367CCTT38174781757110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
107NC_016367CT68284982860120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
108NC_016367CTTC38360683617120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
109NC_016367ATA484208842191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
110NC_016367GA784513845251350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
111NC_016367CTT48474584755110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
112NC_016367TTCT38531285323120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
113NC_016367AGAA389264892751275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
114NC_016367GAAA389733897441275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
115NC_016367AGAAT390086901001560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
116NC_016367CTTT39134591355110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding