ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 33

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016366	TCC	4	62	72	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016366	CTAT	3	578	589	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016366	GCA	4	3941	3952	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016366	ATCCT	3	4369	4382	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016366	TTTA	3	4678	4689	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016366	G	13	6229	6241	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016366	CTTT	3	6440	6450	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016366	ACTT	3	6872	6883	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016366	AAGT	3	7023	7034	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016366	CAGG	3	8168	8178	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016366	CCT	4	8460	8472	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016366	ATGG	3	8541	8552	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016366	AAGC	3	9841	9852	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016366	GATT	3	10768	10778	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016366	AGA	4	12289	12300	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016366	TAA	4	12924	12934	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016366	TAC	4	13157	13167	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016366	GTA	4	15346	15357	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016366	TTC	4	15554	15565	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016366	CTTC	3	15605	15615	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016366	TCTT	3	15623	15634	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016366	CT	6	17716	17726	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016366	TAG	4	18145	18155	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016366	AT	6	19383	19393	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016366	TAAG	3	19676	19686	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016366	CTTA	3	21327	21338	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016366	TCA	4	21463	21473	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016366	AAG	5	22098	22113	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016366	TCT	4	22406	22416	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016366	TCGTA	3	23602	23616	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016366	AAAG	3	23933	23943	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016366	TTCTA	3	24232	24245	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016366	CT	6	24565	24576	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016366	AATA	3	25552	25563	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016366	TAG	4	25734	25745	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016366	AGA	4	27207	27218	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016366	TAC	4	27370	27380	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016366	TACAA	3	27581	27595	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016366	TAGA	3	27929	27940	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016366	TTATCT	3	28383	28401	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
41	NC_016366	GAAAA	3	33183	33196	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016366	TCT	5	33413	33426	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016366	CTTC	3	35609	35620	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016366	AAAG	3	35789	35799	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016366	AAG	4	39003	39013	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016366	TA	6	40127	40137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016366	GCA	4	41584	41595	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016366	CTTG	3	42026	42036	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016366	AC	6	42514	42524	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016366	CTTT	3	43374	43385	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016366	TGCT	3	43705	43715	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016366	AAGA	3	43764	43775	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016366	ATG	4	44502	44512	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016366	ATA	5	44661	44674	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016366	GAAA	3	44766	44777	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016366	TCT	4	45615	45626	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016366	TTTA	3	46173	46185	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016366	TTCC	3	46550	46561	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016366	TCT	4	46730	46741	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016366	CTTGA	3	47121	47135	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016366	AATC	3	47531	47542	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016366	GCTG	3	47556	47566	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016366	AAAG	3	47646	47657	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016366	TCT	4	48276	48286	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016366	TAAT	3	48538	48549	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016366	TA	7	50052	50064	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016366	GAG	4	50790	50802	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016366	CTTTT	3	50977	50991	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016366	CTT	4	51110	51120	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016366	CTA	4	51547	51557	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016366	AAT	4	53483	53494	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016366	TA	6	53993	54003	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016366	TA	8	54221	54235	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016366	AT	6	56305	56316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016366	AAG	4	56317	56328	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016366	TCT	4	56444	56454	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016366	GAAA	3	56502	56512	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016366	CTAA	3	56706	56717	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016366	AGCG	3	56749	56759	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016366	TGGA	3	56930	56940	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016366	AAGC	4	58309	58324	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016366	AAAAG	4	58899	58918	20	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_016366	A	13	60274	60286	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016366	AAAG	3	60557	60568	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016366	AATT	3	60907	60919	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016366	CTTT	3	61542	61553	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016366	CTTCA	3	62271	62284	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016366	CTAG	3	63515	63525	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016366	TTC	4	63771	63782	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016366	TTGCTT	3	64569	64586	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
91	NC_016366	GTTC	3	65618	65628	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016366	TCA	4	65971	65982	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016366	AT	6	66826	66836	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016366	CTT	5	67159	67173	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016366	CTT	4	67875	67887	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016366	TTA	4	68351	68362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016366	AGAC	3	68859	68870	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016366	AG	6	69136	69146	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016366	CTTT	3	69232	69243	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016366	TAT	4	69326	69336	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016366	TTTC	3	69554	69564	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016366	TA	7	69914	69928	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016366	CAG	4	70539	70549	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016366	CTCA	3	71113	71124	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016366	ACT	4	71204	71214	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016366	AGGA	3	71784	71795	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016366	ATAAG	3	72417	72430	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016366	AGA	4	72500	72510	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016366	TGC	4	72917	72928	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016366	AGAA	3	73216	73227	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016366	GCT	4	73907	73918	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016366	TAGA	3	75067	75077	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016366	GATT	3	75560	75572	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016366	TAT	4	79027	79038	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016366	TAAA	4	79258	79274	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016366	TTAA	3	79912	79922	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016366	TCA	4	80549	80560	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016366	CAGGA	3	82102	82116	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016366	ATCT	3	82191	82203	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016366	ATAGG	3	83213	83226	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016366	CT	6	83716	83726	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016366	CAATG	4	83803	83823	21	40 %	20 %	20 %	20 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016366	AGCTAG	3	83973	83991	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
124	NC_016366	AT	7	84557	84569	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016366	T	13	84850	84862	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016366	TCT	4	86641	86651	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016366	TTAGA	3	87306	87320	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016366	AAGAAA	3	87667	87685	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
129	NC_016366	TTATA	4	87970	87988	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
130	NC_016366	TGA	4	88039	88049	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016366	AAAT	3	90251	90261	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016366	CTT	5	90302	90316	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016366	ACT	6	90541	90557	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
134	NC_016366	GCGAA	3	92341	92355	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
135	NC_016366	TC	7	92898	92910	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016366	AAGC	3	93130	93140	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016366	TTGA	3	93187	93199	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016366	GA	6	94842	94852	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016366	AAG	4	95162	95173	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016366	GGATG	3	96630	96644	15	20 %	20 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
141	NC_016366	TAT	5	97481	97494	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016366	AAAG	3	97602	97613	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016366	GAA	4	97909	97920	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016366	TGG	4	98120	98131	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016366	TCTT	3	98137	98147	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016366	TTAA	3	99794	99805	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016366	ACTTT	3	100574	100588	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
148	NC_016366	TATC	3	102606	102616	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016366	T	14	103224	103237	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 33