ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 16

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016365	AAG	4	553	564	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016365	ATA	4	2631	2641	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016365	TAT	4	4627	4638	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016365	TCT	4	6331	6342	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016365	AGA	4	6593	6605	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016365	CTA	4	8307	8317	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016365	TAT	6	9845	9861	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_016365	TAG	4	11202	11212	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016365	CTT	4	13300	13310	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016365	AGA	4	17815	17826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016365	TAA	4	18983	18995	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016365	TGA	4	19546	19556	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016365	TCT	4	22191	22201	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016365	AGT	4	22790	22802	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016365	TAA	4	23427	23439	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016365	AGA	4	24200	24210	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016365	TCT	4	25474	25484	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016365	AAG	4	26000	26010	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016365	AAG	4	26200	26210	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016365	GTA	4	30634	30645	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016365	AGC	4	31014	31025	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016365	TCA	4	33556	33567	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016365	AGA	4	35107	35118	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016365	TAG	4	35469	35480	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016365	TCT	4	36255	36266	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016365	AGT	5	38003	38018	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016365	TGT	4	40253	40264	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016365	TAT	4	41022	41032	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016365	AGC	4	41219	41231	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016365	ACT	4	43001	43011	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016365	TAT	4	46741	46753	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016365	TCA	4	49429	49439	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016365	TAG	4	52657	52667	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016365	TTC	4	56876	56887	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016365	TAT	5	57751	57764	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016365	GTT	4	60611	60622	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016365	CTA	4	60716	60726	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016365	CTA	4	63282	63292	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016365	TAC	4	63332	63344	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016365	CTC	4	69034	69044	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016365	GAA	4	69558	69568	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016365	ATT	4	70250	70260	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016365	TTC	5	70932	70947	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016365	CTA	4	72849	72860	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016365	TCT	4	73264	73275	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016365	CTT	4	73868	73880	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016365	TTC	4	73917	73928	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016365	TCT	4	77454	77465	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016365	AAG	4	77608	77618	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016365	ATA	4	77673	77684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016365	AAG	4	80273	80284	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016365	TGT	4	84138	84150	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016365	ATT	4	89995	90006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016365	TAG	4	90512	90524	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016365	TAA	4	93445	93456	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016365	TTC	4	93770	93782	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016365	AGA	4	94101	94112	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016365	GAT	4	95963	95973	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016365	GAA	4	96706	96716	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016365	GAT	4	98182	98192	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016365	TAT	5	99709	99724	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016365	TCT	4	100699	100710	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016365	AGA	4	102518	102529	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016365	TTA	4	104612	104623	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016365	CTT	4	106905	106916	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016365	CTT	4	112389	112399	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016365	AGG	4	113063	113075	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016365	TTC	4	114363	114374	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016365	AGT	5	115101	115114	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016365	TAA	4	120176	120186	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016365	TCT	4	124702	124713	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016365	CTT	4	128314	128326	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016365	AGA	4	128701	128711	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016365	TCT	4	128829	128840	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 16