ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 16

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016365	TA	6	485	495	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016365	AAG	4	553	564	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016365	TAGTA	3	823	837	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016365	TCTT	3	1027	1038	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016365	AGAA	3	1483	1495	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016365	TTTA	3	1676	1686	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016365	G	16	2304	2319	16	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016365	ATA	4	2631	2641	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016365	T	18	2896	2913	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_016365	AAGT	3	3806	3818	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016365	AG	6	4139	4149	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016365	TAT	4	4627	4638	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016365	GA	6	5367	5377	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016365	CTATT	3	6046	6059	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016365	A	16	6289	6304	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016365	TCT	4	6331	6342	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016365	AGA	4	6593	6605	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016365	TTATAA	3	7667	7685	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_016365	GAAG	3	8018	8030	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016365	CTA	4	8307	8317	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016365	AATC	3	8336	8346	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016365	GAAGTA	3	8474	8492	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_016365	TTTC	3	8735	8746	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016365	TAT	6	9845	9861	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_016365	TAG	4	11202	11212	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016365	TAAAG	3	12294	12308	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016365	A	16	12883	12898	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016365	CTT	4	13300	13310	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016365	GAAA	3	13987	13998	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016365	TA	6	14904	14914	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016365	TCTT	3	15251	15262	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016365	TA	6	16526	16537	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016365	TTGAT	3	16669	16682	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016365	CTTT	3	16969	16981	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016365	AGA	4	17815	17826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016365	AT	6	17983	17993	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016365	TAA	4	18983	18995	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016365	AATT	3	19490	19501	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016365	TGA	4	19546	19556	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016365	AGTT	3	20768	20778	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016365	AAGC	3	20975	20985	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016365	TCT	4	22191	22201	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016365	GACATA	3	22399	22416	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016365	TTTA	3	22683	22693	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016365	AGT	4	22790	22802	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016365	TAA	4	23427	23439	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016365	CCAA	3	24179	24191	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016365	AGA	4	24200	24210	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016365	AG	6	25246	25257	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016365	TCT	4	25474	25484	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016365	AAGT	3	25753	25763	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016365	CTTT	3	25987	25997	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016365	AAG	4	26000	26010	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016365	AAG	4	26200	26210	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016365	AAAG	3	27899	27910	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016365	GGCA	3	30277	30287	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016365	GTA	4	30634	30645	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016365	AGC	4	31014	31025	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016365	AAAG	3	33062	33072	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016365	TCA	4	33556	33567	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016365	AGA	4	35107	35118	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016365	A	16	35193	35208	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016365	TAG	4	35469	35480	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016365	TCT	4	36255	36266	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016365	GTAT	3	36504	36515	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016365	TTTA	3	36673	36685	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016365	GTTA	3	37246	37257	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016365	TCAA	3	37388	37399	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016365	CACTT	3	37613	37626	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016365	AGT	5	38003	38018	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016365	TGT	4	40253	40264	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016365	CTTT	3	40397	40407	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016365	TAT	4	41022	41032	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016365	TAAA	3	41079	41090	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016365	AGC	4	41219	41231	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016365	AGTGC	3	41273	41286	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016365	AT	6	41908	41919	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016365	CTTT	3	42843	42855	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016365	ACT	4	43001	43011	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016365	AACTA	4	45598	45618	21	60 %	20 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016365	TAT	4	46741	46753	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016365	CTTT	3	47535	47545	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016365	AAAAG	3	48153	48166	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016365	TCA	4	49429	49439	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016365	TAG	4	52657	52667	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016365	GTAA	3	53584	53594	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016365	TTCA	3	54571	54582	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016365	AAGC	3	54615	54625	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016365	TCTTAA	3	56446	56463	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_016365	TTC	4	56876	56887	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016365	TAT	5	57751	57764	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016365	AATTT	3	59040	59055	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016365	GTT	4	60611	60622	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016365	CTA	4	60716	60726	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016365	TTAG	3	61008	61019	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016365	TA	6	61474	61484	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016365	ACTC	3	61514	61526	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016365	GAATTT	3	62011	62029	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
99	NC_016365	CTA	4	63282	63292	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016365	TAC	4	63332	63344	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016365	TTTC	3	63848	63859	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016365	TTTC	3	63919	63930	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016365	AT	6	64134	64144	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016365	AGAA	4	64219	64235	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
105	NC_016365	CATT	3	65288	65298	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016365	AAAG	3	65998	66008	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016365	TCTT	3	66168	66179	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016365	A	12	66787	66798	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016365	TTATT	3	66885	66898	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016365	GCAG	3	67249	67259	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016365	T	12	67900	67911	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016365	TA	6	68780	68790	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016365	CTC	4	69034	69044	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016365	GAA	4	69558	69568	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016365	CT	6	70096	70107	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016365	ATT	4	70250	70260	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016365	TTCAAT	3	70444	70461	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
118	NC_016365	TTC	5	70932	70947	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016365	TA	6	71029	71041	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016365	TA	6	72587	72598	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016365	CTA	4	72849	72860	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016365	TCT	4	73264	73275	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016365	CTT	4	73868	73880	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016365	TTC	4	73917	73928	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016365	TCT	4	77454	77465	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016365	AAG	4	77608	77618	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016365	ATA	4	77673	77684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016365	TTCTA	3	77791	77805	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016365	AAG	4	80273	80284	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016365	ATTT	3	80492	80504	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016365	AAAG	3	81504	81515	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016365	TA	6	82354	82364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016365	TGT	4	84138	84150	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016365	A	13	85007	85019	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016365	GAAA	3	87081	87092	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016365	AT	6	89550	89560	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016365	ATT	4	89995	90006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016365	CT	6	90267	90277	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016365	TAG	4	90512	90524	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016365	TA	6	90561	90571	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 16