ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 23

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016364	GCT	4	1430	1441	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016364	GGAA	3	4707	4717	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016364	ATA	5	5775	5788	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016364	ATT	4	6044	6056	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016364	CT	6	6189	6199	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016364	ATTCT	3	7722	7736	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016364	GAAA	3	8088	8099	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016364	AGG	4	8113	8123	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016364	AAAGT	3	8794	8807	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016364	A	16	9057	9072	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016364	CAAG	3	10756	10768	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016364	TCT	4	11315	11327	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016364	ACTT	3	12378	12388	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016364	AT	6	12430	12440	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016364	TAT	5	12777	12790	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016364	GTA	4	12844	12855	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016364	AGAT	3	13413	13424	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016364	CTTC	3	13823	13835	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016364	TGA	4	14257	14267	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016364	T	14	14345	14358	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016364	ATT	4	14720	14730	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016364	TA	6	15518	15528	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016364	CCATG	3	16644	16657	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016364	AGA	4	18175	18185	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016364	TA	7	18830	18842	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016364	AAT	4	19411	19422	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016364	AT	6	20531	20541	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016364	AT	6	20872	20882	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016364	GTT	4	21569	21579	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016364	ATA	4	22322	22333	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016364	AGTT	3	24476	24486	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016364	T	12	24654	24665	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016364	A	12	24750	24761	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016364	TAG	4	25784	25794	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016364	CTTA	3	26429	26440	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016364	ACT	4	26917	26928	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016364	T	14	27877	27890	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016364	CTA	4	29222	29232	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016364	TA	6	29446	29456	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016364	GGGT	3	32067	32077	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016364	GGTA	3	32971	32982	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016364	TTA	4	33289	33300	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016364	TTAAAG	3	33718	33735	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016364	TTTA	3	34399	34410	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016364	GACT	3	37190	37201	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016364	CTTG	3	39655	39667	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016364	AC	6	40225	40235	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016364	CTT	4	40790	40801	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016364	AAGT	3	40995	41005	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016364	GAAA	3	42074	42085	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016364	CTTTA	3	42999	43014	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016364	T	17	43240	43256	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016364	TTC	4	43620	43631	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016364	ATC	4	43832	43843	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016364	TTCA	3	45384	45394	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016364	GAT	4	46032	46043	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016364	GA	6	46044	46054	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016364	ATA	4	46333	46343	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016364	CTTT	3	47682	47693	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016364	AAGA	3	49095	49105	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016364	ACTT	3	49669	49680	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016364	TCCT	3	49737	49749	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016364	TGC	4	49931	49941	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016364	AAAG	4	50240	50255	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016364	AAT	4	51039	51049	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016364	CTT	4	51517	51528	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016364	A	13	53720	53732	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016364	CTT	4	54242	54253	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016364	TAT	4	54351	54365	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016364	AAGT	3	55840	55851	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016364	CTG	4	56160	56171	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016364	GCTT	3	56941	56951	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016364	CTTT	3	57113	57125	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016364	ATA	4	57637	57647	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016364	GGTT	3	57808	57819	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016364	CAA	4	57939	57950	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016364	TAT	4	58014	58025	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016364	TGGC	3	58534	58544	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016364	ATG	4	59503	59514	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016364	TTCTT	3	60727	60741	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016364	TAAC	3	60969	60980	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016364	CAATA	3	61548	61562	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016364	T	13	62150	62162	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016364	GTAGA	3	62189	62204	16	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016364	TA	6	63054	63064	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016364	AAAC	3	63257	63267	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016364	ATT	4	64082	64093	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016364	AATAAA	3	64243	64261	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
89	NC_016364	AAAG	3	66910	66921	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016364	TA	6	67764	67774	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016364	GCT	4	67827	67838	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016364	TA	6	68345	68355	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016364	AAGT	3	68676	68686	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016364	ATT	4	68755	68766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016364	T	12	69796	69807	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016364	AG	8	70734	70748	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016364	T	12	71346	71357	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016364	CTTT	3	72296	72307	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016364	TTCGT	3	72399	72413	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016364	ATC	4	73125	73136	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016364	TTC	4	73273	73284	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016364	ACGT	3	74056	74066	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016364	TGAAAG	3	75338	75356	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
104	NC_016364	TGTTT	3	76279	76293	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016364	TAAA	3	76661	76672	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016364	ATATGA	3	76842	76860	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_016364	CA	6	76998	77008	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016364	CATA	3	77253	77263	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016364	CTG	4	77317	77328	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016364	ATA	4	78260	78272	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016364	GGAA	3	80908	80919	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016364	CGAAG	3	81620	81633	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016364	A	14	82082	82095	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016364	T	15	82244	82258	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016364	GAA	4	82668	82679	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016364	CAAG	3	82732	82743	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016364	AAAG	3	84344	84354	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016364	ATAA	3	84419	84430	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016364	CTTT	3	85412	85423	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016364	ATAAGA	3	86508	86525	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
121	NC_016364	AGAA	3	86617	86629	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016364	TA	6	88117	88127	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016364	GA	6	89017	89028	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016364	AAAG	3	89152	89162	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016364	TTGTA	3	90110	90123	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016364	AAAGTA	3	91864	91880	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
127	NC_016364	TTCGT	3	92179	92192	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016364	CA	6	92353	92364	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016364	TTA	4	93197	93208	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016364	GAAAT	4	93221	93239	19	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_016364	AAAT	3	93945	93957	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016364	TA	7	94173	94185	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016364	AAAG	3	94186	94197	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016364	TTC	4	94788	94799	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016364	TCAA	3	95163	95173	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016364	CGAG	3	95498	95509	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016364	TCAA	3	95706	95717	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016364	CT	6	96205	96215	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016364	T	17	96511	96527	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016364	CTTT	3	97227	97238	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_016364	CTTT	3	97557	97567	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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174	NC_016364	GGAA	3	122254	122265	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 23