ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 13

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016363	TCT	4	654	665	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016363	TTC	4	2995	3006	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016363	ACA	5	3012	3025	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016363	TCT	4	4566	4577	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016363	GAA	4	4863	4873	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016363	ACT	4	7639	7650	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016363	AGA	4	7702	7713	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016363	CTT	4	10243	10254	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016363	GAA	4	11271	11282	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016363	CTA	4	12774	12785	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016363	GTT	4	17360	17371	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016363	TGT	4	22323	22334	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016363	TAT	5	22367	22381	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016363	TAG	5	22449	22463	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016363	AGA	4	27564	27575	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016363	ATA	4	31392	31403	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016363	ACA	4	31946	31956	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016363	AGC	4	35485	35495	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016363	CAC	4	36131	36142	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016363	TAA	4	36542	36553	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016363	GAA	4	37593	37604	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016363	ATA	4	42529	42541	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016363	TAT	4	43500	43512	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016363	ATA	4	50600	50610	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016363	AGA	4	52365	52375	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016363	AGA	4	52412	52422	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016363	ATA	4	52762	52773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016363	ATA	4	61049	61060	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016363	GGT	4	61347	61359	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016363	TTA	4	62098	62108	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016363	AAG	4	64153	64164	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016363	AAG	4	65381	65393	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016363	TTA	4	65528	65538	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016363	ATG	4	66792	66802	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016363	GAA	4	67461	67471	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016363	AAC	4	68153	68164	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016363	TAG	4	68313	68324	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016363	AAG	4	68832	68843	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016363	TAG	4	70505	70516	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016363	TAG	4	70639	70650	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016363	ACT	4	70986	70998	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016363	TGC	4	71699	71709	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016363	TAA	4	71854	71864	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016363	CTG	4	72411	72422	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016363	GAA	5	75137	75151	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016363	AAG	4	78280	78290	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016363	CTT	4	79595	79605	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016363	TCT	4	80591	80602	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016363	AGC	4	81063	81074	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016363	CTC	4	82421	82432	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016363	TAA	4	82802	82812	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016363	TTC	4	86369	86380	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016363	TTA	4	88510	88521	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016363	ACT	4	91509	91520	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016363	CTT	4	93880	93891	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016363	TTA	4	94845	94856	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016363	ATT	4	95294	95304	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016363	CTT	4	95709	95719	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016363	TAT	4	98443	98454	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016363	GAA	4	98897	98907	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016363	ATA	4	103390	103402	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016363	TAA	4	103463	103474	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016363	AAG	4	103616	103627	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016363	TAT	4	104595	104607	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016363	CTT	4	104824	104835	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016363	AGA	4	104931	104943	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016363	GTA	4	109684	109695	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016363	CTT	4	114239	114249	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016363	AGA	4	115004	115015	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016363	TAT	4	127113	127123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016363	TAG	4	128274	128284	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016363	TTC	5	129814	129828	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 13