ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 31

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016361	GTT	4	13	25	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016361	AAGT	3	1276	1286	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016361	AAAG	3	1498	1508	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016361	TA	6	1784	1796	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016361	CTTT	3	2053	2064	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016361	TAA	4	2258	2269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016361	AGT	4	2325	2336	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016361	CTT	4	3420	3431	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016361	ATAA	3	3491	3501	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016361	AGT	4	3753	3765	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016361	TGA	4	4818	4828	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016361	AGTG	3	5138	5148	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016361	TGAA	3	5417	5427	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016361	CTT	4	6675	6685	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016361	TCCT	3	6914	6925	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016361	CTAG	3	7253	7263	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016361	CT	6	7356	7367	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016361	TA	8	7388	7402	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016361	TAAAAA	3	7585	7603	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_016361	TTTA	3	8676	8687	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016361	AAGTT	3	10682	10696	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016361	CTTT	4	12835	12850	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016361	TTA	4	12950	12962	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016361	TAGA	3	13558	13569	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016361	TTCTT	3	14316	14329	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016361	G	12	14709	14720	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016361	AAAT	3	14911	14922	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016361	TA	6	15249	15259	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016361	GATAA	3	16378	16392	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016361	GAA	4	17025	17036	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016361	AAAG	4	17882	17896	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016361	ACC	4	19096	19106	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016361	A	17	19492	19508	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016361	TCT	4	20507	20517	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016361	TCT	4	20934	20945	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016361	AAAG	5	21777	21796	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
37	NC_016361	TTTC	3	22067	22078	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016361	A	13	25373	25385	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016361	AG	6	26406	26416	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016361	GTTC	3	26646	26656	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016361	ATA	4	26681	26692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016361	TAA	5	26772	26785	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016361	TACC	3	27488	27499	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016361	A	12	27948	27959	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016361	ATTT	3	28447	28458	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016361	CA	6	29889	29899	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016361	TC	6	30603	30613	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016361	A	16	30628	30643	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016361	AT	6	31493	31503	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016361	AAGA	4	32127	32142	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016361	CTTC	3	32457	32467	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016361	CTTT	3	32853	32864	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016361	T	14	32898	32911	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016361	TAAC	4	37764	37780	17	50 %	25 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016361	AAGA	3	38243	38253	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016361	A	16	40319	40334	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016361	T	20	41053	41072	20	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_016361	CCTTA	3	41258	41272	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016361	TA	6	41279	41289	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016361	TATCT	3	41351	41364	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016361	TA	6	42222	42234	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016361	AGA	4	43388	43398	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016361	TTAT	3	43943	43954	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016361	GTAA	3	44015	44026	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016361	AT	6	44403	44416	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016361	GAAA	3	46069	46079	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016361	TA	6	47519	47529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016361	AAAGG	3	47602	47615	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016361	T	13	47931	47943	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016361	TAGT	4	48719	48734	16	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016361	AAAAG	3	50310	50323	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016361	ATA	5	50873	50886	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016361	TTCG	3	51158	51168	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016361	A	13	51411	51423	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016361	CTTC	3	51504	51515	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016361	AAGA	3	51656	51667	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016361	T	13	51704	51716	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016361	AT	6	51853	51864	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016361	TA	6	52116	52126	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016361	AT	6	52914	52924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016361	CTCA	3	52936	52947	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016361	CTT	4	53673	53683	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016361	TA	8	55554	55570	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016361	CTTT	3	55989	56000	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016361	TTCC	3	57035	57046	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016361	TC	6	57407	57417	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016361	T	13	58550	58562	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016361	ATTT	3	59635	59645	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016361	CTTT	3	59683	59693	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016361	CGCC	3	59716	59726	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016361	TA	8	60812	60826	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016361	ACA	4	60910	60921	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016361	TGAG	3	61236	61246	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016361	A	15	61377	61391	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016361	TCAT	3	62534	62545	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016361	TA	6	63983	63993	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016361	TAAA	3	64187	64198	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016361	TAC	4	65239	65249	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016361	TAAA	3	67487	67498	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016361	AGT	4	67668	67680	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016361	CTTG	3	68481	68492	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016361	AAAC	3	69024	69036	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016361	CTTT	3	69629	69639	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016361	TA	6	70125	70136	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016361	CTTG	3	71300	71310	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016361	T	12	71350	71361	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016361	AT	6	71596	71607	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016361	AAAG	3	71677	71689	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016361	ACTT	3	73660	73672	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016361	T	12	73812	73823	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016361	GAAA	3	74029	74039	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016361	TTC	4	75212	75223	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016361	GAT	4	75821	75832	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016361	T	12	75861	75872	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016361	AAG	4	76428	76439	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016361	GAT	4	77063	77074	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016361	TTTA	4	77672	77686	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016361	AG	6	77836	77846	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016361	AATGG	3	79433	79447	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016361	CTT	4	80102	80113	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016361	TAT	5	80604	80619	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016361	TAGT	3	80935	80946	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016361	AT	6	81493	81504	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016361	AGT	4	81695	81705	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016361	AGGG	3	82162	82172	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016361	GCAT	3	82195	82206	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016361	TGA	4	82579	82591	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016361	GGTA	3	82654	82666	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016361	CCTT	3	85774	85784	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016361	TCA	4	86538	86548	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016361	TCTT	3	89804	89815	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016361	TTTC	3	91343	91354	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016361	ATTCT	3	91722	91737	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016361	AAG	4	92731	92741	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016361	TTCA	3	92829	92840	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016361	TGGAT	3	93672	93685	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016361	T	12	93803	93814	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016361	GAA	4	94766	94776	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016361	AT	7	95028	95040	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016361	GCT	4	96487	96499	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016361	TCT	4	97011	97022	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016361	CTT	4	97217	97228	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016361	AAAG	3	98203	98214	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016361	CTTT	3	98556	98567	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016361	CAA	4	98701	98712	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016361	ATG	4	101404	101415	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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148	NC_016361	CTT	4	103155	103165	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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150	NC_016361	TAG	5	104258	104271	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
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154	NC_016361	AG	6	106009	106019	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016361	AGT	4	106600	106612	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 31