ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 31

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016361	GTT	4	13	25	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016361	TAA	4	2258	2269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016361	AGT	4	2325	2336	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016361	CTT	4	3420	3431	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016361	AGT	4	3753	3765	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016361	TGA	4	4818	4828	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016361	CTT	4	6675	6685	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016361	TTA	4	12950	12962	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016361	GAA	4	17025	17036	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016361	ACC	4	19096	19106	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016361	TCT	4	20507	20517	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016361	TCT	4	20934	20945	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016361	ATA	4	26681	26692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016361	TAA	5	26772	26785	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016361	AGA	4	43388	43398	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016361	ATA	5	50873	50886	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016361	CTT	4	53673	53683	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016361	ACA	4	60910	60921	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016361	TAC	4	65239	65249	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016361	AGT	4	67668	67680	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016361	TTC	4	75212	75223	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016361	GAT	4	75821	75832	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016361	AAG	4	76428	76439	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016361	GAT	4	77063	77074	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016361	CTT	4	80102	80113	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016361	TAT	5	80604	80619	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016361	AGT	4	81695	81705	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016361	TGA	4	82579	82591	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016361	TCA	4	86538	86548	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016361	AAG	4	92731	92741	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016361	GAA	4	94766	94776	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016361	GCT	4	96487	96499	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016361	TCT	4	97011	97022	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016361	CTT	4	97217	97228	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016361	CAA	4	98701	98712	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016361	ATG	4	101404	101415	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016361	CTT	4	103155	103165	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016361	TAG	5	104258	104271	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016361	CAC	4	105177	105188	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016361	AGT	4	106600	106612	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 31