ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 24

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016360	TA	6	509	519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016360	ATG	4	814	824	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016360	AT	9	2512	2528	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_016360	TTCCTT	3	3466	3483	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016360	TATTG	3	4967	4981	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016360	AAGG	3	6254	6264	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016360	AGGA	3	6365	6375	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016360	ATA	4	6429	6441	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016360	GCCT	3	6682	6692	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016360	TAAA	3	6699	6709	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016360	GAAA	3	7254	7265	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016360	TA	6	8273	8284	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016360	TAA	4	8417	8428	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016360	TA	6	8440	8451	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016360	AT	6	9503	9513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016360	AG	6	9621	9632	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016360	TTA	4	10399	10410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016360	TTAC	3	11300	11311	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016360	TAT	4	11924	11936	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016360	AGA	4	12978	12989	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016360	TGAT	3	13598	13609	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016360	TTTC	3	14242	14252	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016360	TGC	4	14272	14284	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016360	TTCT	3	14451	14462	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016360	GTCA	3	14751	14761	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016360	TAT	4	15059	15069	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016360	AAG	4	15444	15454	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016360	AAGA	3	15738	15748	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016360	GAA	4	16340	16352	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016360	TA	6	18740	18750	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016360	CTTA	4	18766	18781	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016360	TCAA	3	18831	18841	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016360	CCTT	3	19485	19496	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016360	CTTA	3	19521	19532	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016360	T	12	19620	19631	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016360	AGTA	3	19781	19792	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016360	TTAA	3	20362	20373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016360	CTAT	3	20773	20785	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016360	TG	6	21698	21709	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016360	TCTT	3	22124	22135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016360	CTT	5	22362	22375	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016360	AAAG	3	22524	22535	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016360	TA	6	23308	23318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016360	GATA	3	23761	23771	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016360	TAAGG	3	24155	24168	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016360	ACTATA	3	24492	24508	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
47	NC_016360	AGGAA	3	24561	24575	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016360	AT	6	24765	24776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016360	CTTTC	3	25337	25351	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016360	GTTT	3	25507	25518	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016360	CTTTTT	3	25800	25818	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
52	NC_016360	ATG	4	26316	26327	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016360	TCT	4	26337	26348	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016360	AT	8	26990	27004	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016360	TAAT	3	27005	27016	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016360	GGTA	3	28549	28560	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016360	CT	6	30272	30282	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016360	ACTT	3	30833	30843	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016360	TAGCT	3	30863	30876	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016360	CTA	4	31312	31322	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016360	TA	8	31859	31873	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016360	TAA	4	32164	32174	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016360	TGT	4	32510	32521	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016360	CTAT	3	33546	33557	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016360	ATAA	3	35621	35631	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016360	AGA	4	35691	35702	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016360	TA	6	36266	36277	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016360	ATC	4	36499	36510	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016360	A	16	36713	36728	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016360	AG	8	37091	37106	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016360	GAAA	3	37161	37172	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016360	AAG	4	39218	39230	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016360	AAGA	3	40395	40406	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016360	ATA	4	41125	41135	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016360	TTTC	3	43094	43104	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016360	AG	7	44375	44388	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016360	TATAA	3	45082	45096	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016360	TA	8	45496	45511	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016360	TTTC	3	46805	46816	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016360	AGTTTA	3	47379	47396	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016360	GTTT	3	47587	47597	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016360	GGGC	3	47938	47949	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016360	CTTAG	3	49281	49294	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016360	TAA	4	49403	49414	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016360	TGT	4	49699	49709	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016360	ATTTT	3	49882	49896	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016360	AAAG	3	50363	50373	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016360	AAAT	3	50471	50481	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016360	TGT	4	50495	50506	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016360	AAAAT	3	50647	50661	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016360	ATG	4	50705	50715	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016360	TA	7	51599	51612	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016360	CTTA	3	53177	53188	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016360	TA	6	53517	53528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016360	AAAT	3	53613	53623	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016360	CCGG	3	53763	53774	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016360	A	14	53817	53830	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016360	TCT	4	53989	54000	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016360	TCT	5	54040	54053	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016360	GAT	4	55433	55446	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016360	GAG	4	56014	56024	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016360	ATT	4	57735	57746	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016360	TCTG	3	58077	58087	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016360	CAAAG	4	58989	59008	20	60 %	0 %	20 %	20 %	5 %	Non-Coding
105	NC_016360	AGA	6	59202	59218	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_016360	AGAT	3	61836	61847	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016360	CTTT	3	62318	62329	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016360	AATA	3	62756	62768	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016360	TAT	4	63135	63145	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016360	ACT	4	63322	63333	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016360	TCTT	3	63550	63561	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016360	GAT	4	63608	63619	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016360	AGAATA	3	66516	66532	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_016360	TAAA	3	67337	67347	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016360	A	15	67946	67960	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016360	CT	6	69421	69431	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016360	TTA	4	70321	70331	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016360	TA	6	72248	72258	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016360	GTA	5	72430	72444	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016360	ACT	4	72538	72548	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016360	AGTA	3	73188	73198	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016360	A	12	73990	74001	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016360	TAT	4	74057	74068	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016360	AAG	4	74066	74077	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016360	ATC	4	76112	76123	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016360	AAAG	3	76678	76688	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016360	GAAA	3	76987	76998	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016360	CT	6	78496	78506	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016360	T	13	78718	78730	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016360	AAAT	3	78972	78983	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016360	AGA	4	81068	81080	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016360	TCAA	3	81136	81147	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016360	TTTTC	3	86391	86405	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016360	AAAG	3	87784	87795	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016360	TTCCT	3	88256	88270	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016360	CTTT	3	88697	88707	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016360	AAG	4	88825	88836	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016360	GAA	4	88861	88873	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016360	CTCTA	3	89952	89966	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016360	ACT	4	90074	90084	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016360	AGAA	3	90304	90314	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016360	CTTG	3	90355	90367	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016360	TCTTT	3	91666	91679	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016360	ATGA	3	91823	91835	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016360	GA	6	92058	92069	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016360	AGAA	3	92088	92100	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016360	ATGCT	3	92358	92372	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
148	NC_016360	TACTTC	3	92699	92716	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
149	NC_016360	ATA	4	92903	92913	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016360	AAGC	3	93162	93174	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016360	TCTT	3	94254	94265	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016360	CCT	4	96279	96289	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016360	ACAA	3	97107	97118	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016360	TCT	5	97928	97941	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
155	NC_016360	A	13	98418	98430	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016360	AGAA	3	100006	100016	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016360	C	13	100998	101010	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
158	NC_016360	T	13	101988	102000	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
159	NC_016360	CAAG	3	102706	102717	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
160	NC_016360	CAT	4	102776	102787	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
161	NC_016360	CTAG	3	102906	102917	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016360	TTTA	4	103248	103263	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
163	NC_016360	CTTT	3	103592	103602	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
164	NC_016360	CTTA	3	104641	104653	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
165	NC_016360	GGAA	3	104820	104830	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
166	NC_016360	T	12	105130	105141	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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169	NC_016360	T	12	106072	106083	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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173	NC_016360	AGA	5	108646	108660	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
174	NC_016360	GTAT	3	108914	108925	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
175	NC_016360	AGT	4	109047	109058	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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177	NC_016360	TA	6	110895	110905	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
178	NC_016360	AAAG	4	111529	111543	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
179	NC_016360	AAAAGA	3	111871	111889	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
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181	NC_016360	A	14	115245	115258	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
182	NC_016360	AAGA	3	116073	116083	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
183	NC_016360	ACTT	3	116134	116145	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
184	NC_016360	CCTT	3	118582	118593	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 24