ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 25

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016359	GACTC	3	1384	1397	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016359	TCT	4	1755	1765	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016359	GCAC	3	3717	3727	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016359	TTTTC	3	3841	3855	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016359	CTAT	3	4011	4023	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016359	AGA	5	4639	4653	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016359	CGAG	3	5653	5663	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016359	CGCT	3	7021	7031	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016359	TTTG	3	7601	7612	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016359	GAAA	3	8130	8142	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016359	TCTT	3	8606	8617	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016359	CTTA	3	8960	8972	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016359	GCTT	3	9394	9405	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016359	TCTT	3	10393	10404	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016359	A	16	10802	10817	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016359	TA	7	11000	11013	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016359	TGA	5	11302	11315	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016359	AAAG	3	12761	12771	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016359	AGA	4	13002	13014	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	35805105
20	NC_016359	T	12	14123	14134	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	35805105
21	NC_016359	CT	6	16049	16059	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35805105
22	NC_016359	CTTT	5	16125	16143	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	35805105
23	NC_016359	A	12	18041	18052	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016359	CTTT	4	18085	18099	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016359	CTTT	3	18976	18987	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016359	TTTG	3	19678	19689	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016359	TCTT	3	20113	20124	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016359	TC	6	20714	20725	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016359	ATA	8	20977	21000	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016359	AAAG	3	21908	21918	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016359	TTTC	3	23048	23059	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016359	A	12	23143	23154	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016359	AGA	4	23374	23388	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016359	A	17	23654	23670	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016359	AG	7	23704	23717	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016359	TTTC	4	24773	24788	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016359	TAT	4	27625	27636	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016359	TATT	3	28742	28752	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016359	AT	6	28757	28767	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016359	TAA	4	29082	29092	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016359	A	12	30269	30280	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016359	TTAA	5	32445	32464	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_016359	AGAAA	3	32852	32865	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016359	AAGA	3	33675	33687	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016359	GAAA	3	33900	33910	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016359	AAG	4	33991	34001	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016359	T	12	34039	34050	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016359	AAG	4	34288	34299	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016359	TTTC	3	34903	34914	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016359	TTCG	3	35464	35475	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016359	TCTTT	3	36000	36013	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016359	GAGC	3	36257	36267	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016359	TCT	4	36953	36964	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016359	TAGG	3	37387	37398	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016359	ATT	4	37925	37935	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016359	TTAG	3	38095	38106	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016359	GAA	4	38122	38132	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016359	TAG	4	38400	38411	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016359	TTC	4	39111	39122	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016359	T	13	39803	39815	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016359	AAGC	3	39887	39898	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016359	TTCT	3	40352	40363	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016359	GTTT	3	40889	40900	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016359	CT	6	40945	40956	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016359	TA	6	43933	43943	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016359	CTTT	3	44420	44431	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016359	T	12	45651	45662	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016359	AGGT	3	47808	47818	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016359	AAG	4	48433	48443	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016359	TAAG	3	48978	48989	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016359	TTA	6	49669	49685	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_016359	TTCT	3	50022	50034	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016359	CAG	4	50978	50990	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016359	CTT	4	52382	52393	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016359	GAAA	3	52620	52631	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016359	AT	6	52674	52684	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016359	GAAA	3	53435	53446	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016359	TAT	4	54113	54123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016359	TTTA	3	54962	54973	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016359	AGG	4	56397	56407	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016359	CCATA	3	56740	56753	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016359	CAT	4	56796	56807	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016359	GGAA	3	57720	57731	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016359	ACTT	3	57834	57846	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016359	AAG	4	60825	60836	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016359	AGAA	3	61056	61067	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016359	A	12	61608	61619	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016359	TTTTG	3	62153	62167	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016359	CTTT	3	62782	62792	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016359	A	12	63216	63227	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016359	TTTAA	3	64069	64084	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016359	TTA	4	64550	64561	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016359	TCTT	3	66408	66419	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016359	CTTT	3	68155	68165	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016359	ATCT	3	73040	73051	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016359	A	13	73205	73217	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016359	ACT	4	74937	74948	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016359	A	13	75893	75905	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016359	CTA	4	76120	76131	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016359	CA	6	76449	76460	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016359	CGGT	3	76628	76639	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016359	ATCT	3	77424	77435	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016359	TC	7	77748	77760	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016359	TTCA	3	77771	77783	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016359	ACA	4	78567	78578	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016359	ACA	4	79043	79054	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016359	TTAGG	3	79852	79866	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016359	TCT	5	81258	81271	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016359	GAAA	4	82127	82141	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016359	TTTC	3	83162	83172	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016359	CTTT	3	83677	83687	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016359	CTT	4	83886	83896	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016359	AGT	4	84253	84263	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016359	GTA	4	84956	84967	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016359	GTCA	3	88439	88449	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016359	A	12	89754	89765	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016359	AAAC	3	89845	89855	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016359	TCT	4	90656	90666	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016359	AGGC	3	91063	91074	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016359	TAT	4	91176	91187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016359	TTC	4	91742	91753	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016359	AAG	4	92339	92350	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016359	AATT	3	92356	92367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016359	GCATG	3	93367	93380	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016359	TCCA	3	95479	95491	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016359	TCT	5	95759	95774	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016359	AAAG	3	96143	96153	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016359	ATC	4	96666	96677	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016359	TGAG	3	96733	96743	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016359	AGCT	3	97489	97499	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016359	T	16	98577	98592	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016359	ATC	4	98683	98694	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016359	C	12	101030	101041	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016359	CTA	4	101214	101224	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016359	CT	6	102007	102017	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016359	AG	6	102808	102818	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016359	CTA	4	103896	103907	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016359	A	15	103935	103949	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016359	TCT	4	104169	104179	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016359	GAAA	3	104694	104705	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016359	AAG	4	105271	105282	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016359	TTA	4	105948	105958	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016359	TA	6	106584	106595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016359	A	16	107325	107340	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016359	TAG	4	107780	107790	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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149	NC_016359	CAAA	3	108537	108548	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016359	ATA	4	109426	109438	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016359	ATCT	3	112065	112076	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 25