ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 47

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016358	TA	7	435	447	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016358	CTTT	3	604	615	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016358	AAGA	4	1758	1773	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016358	AAAG	3	2128	2140	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016358	GCTA	3	2170	2182	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016358	TTA	4	2796	2807	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016358	CTTA	4	3793	3808	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016358	AGT	4	3963	3973	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016358	TCC	4	4301	4312	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016358	ATT	4	4395	4406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016358	CTTT	3	4702	4712	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016358	CCTT	3	4746	4756	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016358	CTTT	3	5501	5513	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016358	AAG	4	5653	5664	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016358	AAAG	3	5703	5714	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016358	AGA	4	6863	6874	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016358	GAA	4	7133	7143	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016358	AGA	4	8518	8529	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016358	AGAA	3	8553	8564	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016358	TAG	4	9126	9137	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016358	AAG	4	9332	9342	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016358	TCT	4	9797	9807	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016358	A	12	9963	9974	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016358	T	12	10555	10566	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016358	CTT	4	10632	10642	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016358	TAAA	3	11475	11486	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016358	TCT	5	11551	11566	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016358	CTTT	3	13575	13585	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016358	CTTT	3	15812	15823	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016358	CAAA	3	16478	16489	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016358	CTT	4	16874	16884	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016358	TTCT	3	17260	17271	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016358	AG	6	17450	17460	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016358	AAAGA	3	17821	17835	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016358	ACT	4	18339	18350	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016358	CTA	4	20032	20043	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016358	A	14	20668	20681	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016358	AGCG	3	21106	21118	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016358	GTCT	3	22424	22434	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016358	CTAT	3	23619	23630	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016358	AAAGTA	4	24316	24338	23	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016358	A	13	27163	27175	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016358	CGAA	3	30303	30313	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016358	TCTT	3	30531	30541	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016358	AGA	4	32025	32035	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016358	GAA	4	32309	32320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016358	TCTA	3	32872	32883	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016358	CTGG	3	33119	33131	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016358	AACA	3	33554	33565	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016358	TAT	4	34709	34719	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016358	CTT	4	35120	35131	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016358	ATTC	4	35666	35680	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016358	CTTT	3	35755	35766	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016358	TAT	5	35804	35818	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016358	TTTCAA	3	36052	36070	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
56	NC_016358	GTTC	3	36869	36880	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016358	AGAGG	3	37742	37755	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016358	TTA	4	38339	38350	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016358	CTT	4	38600	38611	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016358	ACCT	3	39933	39944	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016358	TCT	4	40538	40549	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016358	CTTG	3	40680	40690	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016358	TACGAA	3	40786	40804	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016358	TCT	4	41185	41196	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016358	TTCC	3	41232	41244	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016358	AAAG	3	41596	41607	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016358	ATA	4	43625	43636	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016358	A	19	43910	43928	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016358	ATA	4	44990	45001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016358	T	12	45476	45487	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016358	AT	6	45714	45725	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016358	TCT	4	45932	45942	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016358	A	14	46954	46967	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016358	A	13	47870	47882	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016358	AACG	3	47989	47999	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016358	AGA	4	48208	48218	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016358	GCT	4	48260	48270	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016358	TGAA	3	48437	48447	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016358	TTGA	3	48714	48724	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016358	TA	6	48899	48910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016358	CAAGA	3	49647	49662	16	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016358	CTAT	3	50181	50191	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016358	TA	6	51595	51605	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016358	AAAG	3	52257	52267	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016358	TCAT	3	52385	52396	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016358	A	17	53452	53468	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016358	CATG	3	53564	53575	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016358	T	12	54064	54075	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016358	CCTT	3	54704	54715	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016358	ATC	4	54877	54888	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016358	CTTT	3	56105	56115	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016358	AAAG	3	56856	56867	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016358	GCAT	3	56997	57007	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016358	T	12	57306	57317	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016358	CTA	4	57897	57908	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016358	AG	6	58467	58478	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016358	AAAG	3	58633	58643	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016358	TAT	4	58974	58985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016358	CTTAT	4	59238	59256	19	20 %	60 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016358	A	16	60081	60096	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016358	A	15	60461	60475	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016358	TTTA	3	63412	63423	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016358	CTTT	4	63494	63509	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016358	AAG	4	63830	63840	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016358	TCA	7	64049	64068	20	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
106	NC_016358	CATC	3	66262	66272	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016358	AACAAG	3	67108	67126	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
108	NC_016358	AAT	4	67207	67217	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016358	TACC	3	67870	67881	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016358	C	13	68342	68354	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016358	TTTAA	3	69637	69650	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016358	GAAA	3	69664	69674	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016358	TAA	4	69859	69870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016358	AT	6	69934	69944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016358	ACT	4	71437	71448	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016358	AT	6	72162	72173	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016358	AGA	5	72265	72280	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016358	CT	6	72577	72587	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016358	CTT	4	72785	72796	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016358	CTT	4	73490	73501	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016358	TTGG	3	73912	73923	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016358	TGACT	3	74022	74035	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016358	CTTT	3	74536	74547	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016358	TATT	3	75081	75091	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016358	AAAGG	3	75231	75245	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016358	AAAG	3	75424	75435	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016358	T	12	78575	78586	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016358	ACT	4	79494	79506	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016358	TTA	4	79595	79605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016358	TTTA	3	79718	79729	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016358	TTA	5	80299	80314	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016358	CGAG	3	80932	80942	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016358	CTTT	4	81278	81293	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016358	ATG	4	81880	81890	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016358	TAT	4	82860	82870	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016358	GTAG	3	84400	84410	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016358	CTT	4	84672	84683	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016358	TTATAT	3	85887	85905	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
139	NC_016358	TCT	4	87116	87127	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016358	GAAA	3	87619	87629	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016358	AAAGG	3	88158	88171	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016358	CTT	4	88462	88472	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016358	TTTATA	4	88471	88493	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
144	NC_016358	AATAA	3	89209	89224	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016358	GCTT	3	89236	89247	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
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149	NC_016358	ACTTT	3	91834	91847	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
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151	NC_016358	TA	6	94059	94069	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 47