ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 18

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016357TCT4170182130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
2NC_016357ATC4536053711233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_016357TTA4852185311133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016357ATT4953595451133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_016357ATA711405114252166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_016357TAT411881118931333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_016357GAA415562155721166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016357TTA420202202121133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
9NC_016357AGT421593216031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016357TCT42387923890120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
11NC_016357GCT42548325494120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
12NC_016357GAA426403264141266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
13NC_016357AGT426452264621133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016357CTT42990729917110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
15NC_016357AGC433565335761233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_016357TAA437002370131266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_016357CTT43795037960110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
18NC_016357TAT538649386621433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_016357TTA440286402961133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_016357ATA440974409841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_016357TTA442563425741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016357TAT443702437131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_016357AGC443804438141133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
24NC_016357CTT44456744578120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_016357GAA444729447401266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
26NC_016357CTT44714547157130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
27NC_016357AGA447704477151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
28NC_016357TTA447823478341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_016357CTT44974949760120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
30NC_016357CTT45018150192120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
31NC_016357TAG450257502671133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
32NC_016357GAA450336503461166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
33NC_016357GTA452253522641233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
34NC_016357GAT453635536461233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
35NC_016357CTT45461154621110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
36NC_016357AGG460301603121233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
37NC_016357AGT461296613061133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
38NC_016357TGC46258262593120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
39NC_016357GAA463823638341266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016357TAT564731647441433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_016357CTA465956659661133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
42NC_016357CTT46616566176120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
43NC_016357TAT567258672721533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
44NC_016357ATA467836678461166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
45NC_016357ATA668130681461766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
46NC_016357CAT474486744971233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
47NC_016357AAT475382753941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
48NC_016357AGA477276772861166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
49NC_016357TAA477970779801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
50NC_016357ATG578159781731533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
51NC_016357AGA479172791831266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
52NC_016357TGA481382813921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
53NC_016357TTG48161981630120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
54NC_016357TTA483217832281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016357AAG484457844691366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
56NC_016357GAA485262852721166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
57NC_016357ATG485555855651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
58NC_016357TAT686627866431733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
59NC_016357AGA491595916061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
60NC_016357GTC49406294072110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
61NC_016357CTT49684396855130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
62NC_016357AGA499130991411266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
63NC_016357TTA41028111028221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016357GAG41040551040661233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016357ATA41045911046031366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_016357AGA41064411064521266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
67NC_016357TCT4108063108075130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
68NC_016357AGT41096961097061133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
69NC_016357TAG41104761104861133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
70NC_016357TCA41106971107081233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
71NC_016357GCT4110709110720120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
72NC_016357TAT41108901109011233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
73NC_016357CTT5113484113497140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
74NC_016357TCT4116819116829110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
75NC_016357TCT4121069121080120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
76NC_016357ATC51238451238581433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
77NC_016357AAG41243361243471266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
78NC_016357TCT4125279125290120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
79NC_016357TAG41253841253951233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding