ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 18

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016357	TCT	4	170	182	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016357	AAAG	3	392	402	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016357	TA	6	848	858	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016357	A	13	3217	3229	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016357	T	12	4370	4381	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016357	ATC	4	5360	5371	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016357	CTTATC	3	7107	7125	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
8	NC_016357	CGAT	3	7495	7506	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016357	TTA	4	8521	8531	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016357	AGGT	3	8826	8837	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016357	ATT	4	9535	9545	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016357	T	18	9796	9813	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_016357	GTTG	3	9832	9843	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016357	TTGC	3	10411	10421	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016357	ATA	7	11405	11425	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016357	GCTTT	3	11430	11443	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016357	CTAT	3	11674	11686	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016357	TAT	4	11881	11893	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016357	CTTT	3	12051	12061	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016357	GAA	4	15562	15572	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016357	TCTTA	3	15853	15868	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016357	AG	7	15868	15880	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016357	TTAA	3	16753	16763	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016357	AT	6	18233	18244	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016357	GAAG	3	18745	18757	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016357	TTA	4	20202	20212	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016357	TA	6	20772	20782	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016357	AT	8	21326	21340	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016357	AGT	4	21593	21603	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016357	CTATT	3	23300	23314	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016357	TCT	4	23879	23890	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016357	GCT	4	25483	25494	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016357	GAA	4	26403	26414	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016357	AGT	4	26452	26462	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016357	TAGA	3	28358	28369	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016357	GGATC	3	28465	28478	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016357	TTTA	3	28916	28926	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016357	T	13	29164	29176	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016357	TCCTT	3	29536	29550	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016357	CTT	4	29907	29917	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016357	TTTG	3	30289	30301	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016357	TA	7	30328	30340	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016357	T	13	32042	32054	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016357	ATAA	3	33148	33160	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016357	TTGG	3	33274	33285	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016357	AGC	4	33565	33576	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016357	TGAT	3	36031	36041	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016357	AGTA	3	36109	36119	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016357	TAA	4	37002	37013	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016357	TTGC	3	37178	37189	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016357	CTT	4	37950	37960	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016357	TAT	5	38649	38662	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016357	TTA	4	40286	40296	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016357	ATA	4	40974	40984	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016357	AT	6	41432	41442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016357	TTA	4	42563	42574	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016357	TATT	3	43658	43669	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016357	TAT	4	43702	43713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016357	AGC	4	43804	43814	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016357	CTT	4	44567	44578	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016357	GAAA	3	44690	44701	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016357	GAA	4	44729	44740	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016357	AT	6	44836	44847	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016357	GTAAA	3	46721	46735	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016357	CTT	4	47145	47157	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016357	TATAT	3	47435	47449	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016357	TG	6	47598	47609	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016357	AT	6	47645	47655	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016357	AGA	4	47704	47715	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016357	TTA	4	47823	47834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016357	CTT	4	49749	49760	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016357	CTTT	3	49782	49793	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016357	CTT	4	50181	50192	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016357	ATCAT	3	50203	50217	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016357	TAG	4	50257	50267	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016357	GAA	4	50336	50346	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016357	TTTGC	4	50425	50443	19	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
78	NC_016357	A	13	51411	51423	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016357	AAGC	3	51651	51662	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016357	A	14	52030	52043	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016357	GTA	4	52253	52264	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016357	AAGC	3	53231	53241	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016357	TTTC	3	53411	53422	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016357	GAT	4	53635	53646	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016357	TA	8	54543	54558	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016357	CTT	4	54611	54621	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016357	TTATA	3	55968	55982	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016357	TAAA	3	56610	56620	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016357	TTATA	4	57506	57524	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
90	NC_016357	CTTT	4	57727	57741	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016357	TA	6	57859	57869	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016357	ATAGAA	3	58057	58075	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_016357	AAAC	3	58468	58479	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016357	ATTT	3	58669	58679	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016357	AGG	4	60301	60312	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016357	AGT	4	61296	61306	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016357	GAAA	3	61703	61713	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016357	AT	7	61785	61797	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016357	TAAG	3	62338	62350	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016357	TGC	4	62582	62593	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016357	TTCA	3	63565	63577	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016357	GAA	4	63823	63834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016357	TAT	5	64731	64744	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016357	AT	6	65642	65652	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016357	CTA	4	65956	65966	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016357	CTT	4	66165	66176	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016357	AAAG	3	66723	66733	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016357	TAT	5	67258	67272	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016357	ATA	4	67836	67846	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016357	TA	7	67843	67855	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016357	ATA	6	68130	68146	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_016357	TTTA	3	70482	70493	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016357	TTACA	4	71284	71302	19	40 %	40 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
114	NC_016357	A	14	74211	74224	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016357	CAT	4	74486	74497	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016357	T	19	75355	75373	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
117	NC_016357	AAT	4	75382	75394	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016357	TTTA	3	75863	75873	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016357	AGA	4	77276	77286	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016357	TAA	4	77970	77980	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016357	ATG	5	78159	78173	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016357	AAAT	3	78284	78295	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016357	AGA	4	79172	79183	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016357	TTCT	3	81367	81378	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016357	TGA	4	81382	81392	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016357	TTG	4	81619	81630	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016357	GATA	3	82594	82606	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016357	TTA	4	83217	83228	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016357	GAAA	3	83826	83836	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016357	AAG	4	84457	84469	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016357	GAAT	3	85135	85145	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016357	GAA	4	85262	85272	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016357	ATG	4	85555	85565	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016357	GCAA	4	85967	85982	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
135	NC_016357	TC	6	86453	86463	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016357	TAT	6	86627	86643	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_016357	CA	6	87837	87848	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016357	AAAG	3	88096	88107	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016357	CCAAG	3	88557	88571	15	40 %	0 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
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141	NC_016357	TAGG	3	88944	88955	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
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169	NC_016357	TTTA	3	103577	103588	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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211	NC_016357	AATC	3	126582	126593	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 18