ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 38

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016356	GCT	4	735	746	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016356	TCT	4	1193	1204	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016356	TGA	4	4818	4828	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016356	AAG	4	4894	4905	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016356	CTA	4	5511	5521	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016356	GAT	4	6441	6453	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016356	T	13	6595	6607	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016356	ATT	4	7195	7206	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016356	A	12	7518	7529	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016356	GAA	4	7786	7797	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016356	ATA	4	8584	8594	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016356	AAG	4	9293	9304	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016356	GATT	3	9832	9843	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016356	AGCTC	3	10643	10656	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016356	AAAG	3	10862	10872	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016356	AAGA	3	11083	11094	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016356	CAAGA	4	11099	11117	19	60 %	0 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
18	NC_016356	AGAA	3	11514	11525	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016356	AGAA	3	11530	11541	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016356	AAGA	3	11621	11632	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016356	AAG	4	13372	13383	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016356	AG	6	14259	14269	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016356	CTAT	3	14379	14389	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016356	TC	6	14592	14603	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016356	CTT	4	14693	14703	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016356	TTGC	3	15333	15344	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016356	TTTA	3	15780	15790	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016356	A	12	16553	16564	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016356	CATG	3	17663	17675	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016356	TC	6	17810	17820	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016356	CTTC	3	19240	19251	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016356	TTA	4	19273	19284	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016356	CTATCT	3	19809	19825	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016356	CAT	4	19846	19857	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016356	AAG	4	20362	20373	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016356	A	15	20779	20793	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016356	AT	6	20876	20886	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016356	TAAA	3	21222	21232	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016356	AGA	4	21265	21275	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016356	TTTC	3	21284	21294	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016356	CT	8	21441	21456	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016356	CCAT	3	21525	21536	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016356	CT	7	22486	22498	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016356	G	12	22560	22571	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016356	CTTTCT	3	22587	22604	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
46	NC_016356	AAAG	3	23345	23356	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016356	AGA	5	23409	23423	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016356	T	13	23564	23576	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016356	TTCTT	3	25003	25017	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016356	CT	6	25246	25257	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016356	AAGA	3	25426	25436	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016356	TC	6	25483	25493	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016356	TAGA	3	25919	25929	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016356	CTTT	3	26296	26306	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016356	TTTG	3	26952	26962	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016356	AAAG	3	27130	27140	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016356	CTCTT	4	27193	27212	20	0 %	60 %	0 %	40 %	5 %	Non-Coding
58	NC_016356	TTC	4	27349	27359	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016356	AGAAA	3	28357	28370	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016356	AAGA	3	28439	28450	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016356	CTT	4	28459	28470	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016356	T	13	29919	29931	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016356	AGA	5	30076	30090	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016356	TGTA	3	31034	31045	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016356	CATT	3	31441	31452	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016356	CTTT	3	31580	31591	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016356	TAA	4	31655	31666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016356	ATCT	3	32727	32737	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016356	TAT	4	33911	33921	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016356	TAAT	3	34764	34776	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016356	AAG	4	35387	35397	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016356	ATTAT	4	35512	35531	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_016356	TGC	4	35672	35683	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016356	AGAA	3	36036	36046	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016356	CTATC	4	36986	37005	20	20 %	40 %	0 %	40 %	5 %	Non-Coding
76	NC_016356	AG	6	37013	37026	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016356	TA	6	37957	37968	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016356	A	13	38622	38634	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016356	CTGG	3	39024	39034	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016356	AGC	4	42087	42098	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016356	TCTCTA	4	42214	42236	23	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016356	AT	11	42424	42445	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016356	AGCAA	3	43132	43146	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016356	CTTT	3	43472	43483	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016356	A	12	43764	43775	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016356	TAATA	3	44343	44357	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016356	TAG	4	44373	44384	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016356	CTT	5	45104	45117	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016356	AGAAAA	3	45159	45176	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_016356	TGA	4	45958	45969	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016356	GTAGAA	3	48287	48303	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_016356	AGAA	3	48304	48315	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016356	AGAA	3	49306	49317	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016356	TTG	4	50770	50781	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	35805105
95	NC_016356	TAA	4	51211	51222	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35805105
96	NC_016356	ATAA	3	52076	52086	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016356	TCT	5	52434	52448	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016356	TTGG	3	52645	52656	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016356	TTTA	3	53130	53141	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016356	AG	6	53792	53802	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016356	T	12	53865	53876	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016356	TCT	4	54966	54977	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016356	ACTT	3	56311	56321	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016356	TAC	4	56843	56854	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016356	AT	6	58371	58381	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016356	TAG	4	59080	59090	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016356	TCT	4	59091	59101	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016356	CTTA	4	59308	59323	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016356	CTT	4	59684	59695	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016356	ATG	4	60540	60550	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016356	AAAAT	4	60964	60984	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016356	GTCT	3	61655	61666	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016356	TCT	4	61805	61817	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016356	AAAG	3	62428	62438	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016356	AAGA	3	64021	64032	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016356	CTT	4	65088	65098	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016356	CTAA	3	65200	65210	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016356	TTG	6	65331	65349	19	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_016356	TAT	4	65836	65846	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016356	CTTA	3	66181	66191	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016356	CTCA	3	66253	66264	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016356	ATTT	3	66821	66832	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016356	CA	7	67524	67536	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016356	T	14	67726	67739	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016356	AGA	4	67939	67950	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016356	TGT	5	68226	68240	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016356	ACT	4	68971	68981	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016356	CTTT	3	69082	69093	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016356	G	13	69309	69321	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016356	CAAA	3	70054	70066	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016356	AT	7	70260	70273	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016356	TGGC	3	70911	70921	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016356	AGT	4	72391	72401	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016356	TTG	4	72791	72802	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016356	AGCC	3	73088	73100	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016356	ATG	4	73577	73587	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016356	AAG	4	74641	74652	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016356	GTAT	3	74741	74751	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016356	TA	6	75605	75615	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016356	AAGT	3	75805	75816	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016356	AGA	4	76267	76277	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016356	GTTA	3	76706	76716	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016356	TTA	4	77511	77522	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016356	TCCC	3	77819	77829	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016356	ATTG	3	77917	77927	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016356	CTT	4	77992	78002	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016356	TC	6	78137	78147	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016356	TCGGA	3	78339	78352	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
149	NC_016356	AAGG	4	78993	79009	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
150	NC_016356	CCTATT	3	80295	80312	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
151	NC_016356	ATTC	3	80426	80438	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
152	NC_016356	CTTG	3	81106	81116	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016356	CCTTTC	3	81432	81448	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
154	NC_016356	CTT	4	81556	81567	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
155	NC_016356	ATT	4	81670	81681	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_016356	AG	6	83223	83233	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016356	AAAG	3	84438	84448	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
158	NC_016356	A	14	84741	84754	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
159	NC_016356	ATA	5	86222	86236	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016356	GATAG	3	87765	87778	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_016356	CTT	4	88879	88891	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
162	NC_016356	ACT	4	89260	89270	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
163	NC_016356	AAG	4	89747	89758	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
164	NC_016356	GTAA	3	89943	89955	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
165	NC_016356	AGT	4	90030	90041	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_016356	AGTTAT	3	90977	90993	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
167	NC_016356	TCTA	3	92138	92149	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
168	NC_016356	CTTT	3	92393	92403	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
169	NC_016356	AGA	4	92643	92653	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
170	NC_016356	GAA	4	92784	92795	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
171	NC_016356	ATG	4	93019	93029	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
172	NC_016356	TAT	4	93364	93374	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
173	NC_016356	TAGA	3	94462	94472	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
174	NC_016356	TCT	4	94930	94941	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
175	NC_016356	TA	6	96345	96355	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
176	NC_016356	AAG	5	96892	96906	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
177	NC_016356	ATA	4	96977	96988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
178	NC_016356	GAAG	3	98228	98238	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
179	NC_016356	ACA	4	101812	101823	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
180	NC_016356	ATA	4	102302	102312	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 38