ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 6

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016355	TTC	4	661	671	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016355	TAG	4	7098	7109	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016355	TCT	4	7842	7853	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016355	TGA	4	8275	8286	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016355	GAA	5	8376	8390	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016355	TCA	4	10958	10968	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016355	ATA	4	11817	11829	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016355	ATA	4	16651	16663	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016355	ACA	4	18666	18678	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016355	ATG	5	19438	19452	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016355	TCT	4	22188	22198	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016355	ATA	5	28638	28652	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016355	CAG	4	29337	29348	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016355	GTT	4	33803	33814	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016355	TTA	4	35463	35474	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016355	GAA	4	36022	36032	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016355	TAA	4	38024	38034	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016355	ATT	4	38649	38660	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016355	ATT	4	41352	41362	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016355	TCT	4	41448	41460	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016355	CAT	4	47026	47037	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016355	GAA	4	53438	53448	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016355	CTT	4	56004	56015	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016355	TTA	4	57455	57466	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016355	CGA	4	60197	60207	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016355	CTT	4	61899	61909	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016355	TAG	4	67108	67118	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016355	TCT	4	69670	69682	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016355	AGA	4	71649	71661	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016355	TTA	4	73410	73421	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016355	TCT	4	74470	74481	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016355	CTT	4	74960	74971	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016355	CTT	4	79058	79069	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016355	CAG	4	79682	79693	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016355	CTT	4	81396	81406	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016355	TTA	4	81431	81443	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016355	TAT	4	81555	81566	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016355	TAA	6	82611	82627	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_016355	CAA	4	82880	82891	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016355	AGT	4	83481	83491	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016355	GAC	4	84973	84984	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016355	GTC	4	89141	89151	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016355	CTA	4	89490	89501	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016355	TAG	5	89643	89657	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016355	AGT	4	89736	89746	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016355	TTC	4	89906	89917	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016355	ATT	4	91147	91158	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016355	CAT	4	97202	97213	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016355	TAC	4	97899	97909	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016355	TCT	4	98958	98969	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016355	ATA	4	108304	108315	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016355	ATA	5	110374	110387	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016355	TGC	4	110487	110497	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016355	GAA	4	110802	110812	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016355	CTA	4	116058	116069	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016355	ATT	4	117617	117627	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016355	AGT	4	117671	117682	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016355	AAG	4	123366	123376	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016355	AGT	4	124206	124216	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016355	CTA	4	124453	124464	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016355	CTA	5	124639	124652	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016355	AGA	4	125048	125059	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016355	AAG	4	128188	128199	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016355	TTA	4	128777	128788	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016355	AGA	5	129259	129273	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016355	AGA	4	133459	133470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016355	TTC	4	135261	135271	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016355	AGA	4	135818	135830	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016355	AGT	4	136302	136312	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016355	AAG	4	137365	137376	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016355	AGA	4	138044	138055	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016355	TTC	4	143186	143196	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016355	ATT	4	147452	147462	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 6