ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 6

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016355ACTATA32722901950 %33.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
2NC_016355TTC4661671110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_016355CCAA3183718481250 %0 %0 %50 %8 %Non-Coding
4NC_016355GAAA3323032411275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
5NC_016355GCTT337263736110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
6NC_016355AGAA3406640761175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
7NC_016355T1554415455150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_016355CTTT358695879110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
9NC_016355CGGG369536965130 %0 %75 %25 %7 %Non-Coding
10NC_016355TAG4709871091233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016355TC672007211120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
12NC_016355TA6727172821250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_016355TCT478427853120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_016355TGA4827582861233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016355GAA5837683901566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
16NC_016355CAAACC3908991061850 %0 %0 %50 %5 %Non-Coding
17NC_016355A129240925112100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
18NC_016355TAAAA3972697401580 %20 %0 %0 %0 %Non-Coding
19NC_016355A129813982412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016355TCA410958109681133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
21NC_016355ATA411817118291366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_016355TTCA412236122511625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
23NC_016355T151274012754150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
24NC_016355GCCT31317713188120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
25NC_016355CTTT31371313724120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
26NC_016355A13139681398013100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_016355ATA416651166631366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
28NC_016355ACCCTT417494175172416.67 %33.33 %0 %50 %4 %Non-Coding
29NC_016355TAGA317833178441250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016355ACA418666186781366.67 %0 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
31NC_016355A14187271874014100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_016355AT618883188961450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_016355TCATAA319019190351750 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
34NC_016355ATG519438194521533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
35NC_016355AG820067200811550 %0 %50 %0 %6 %Non-Coding
36NC_016355TTCC32023920250120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
37NC_016355ACTT321075210861225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
38NC_016355A14214682148114100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
39NC_016355TCT42218822198110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
40NC_016355TTTTAA323437234541833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
41NC_016355T132369023702130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
42NC_016355T132433824350130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
43NC_016355AGAA325681256921275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
44NC_016355T122609826109120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
45NC_016355CTTT32794327954120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
46NC_016355ACCT328062280731225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
47NC_016355ATA528638286521566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
48NC_016355CAG429337293481233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
49NC_016355TTTTC33215732170140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
50NC_016355TAAAA432814328332080 %20 %0 %0 %10 %Non-Coding
51NC_016355GAAA333199332101275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
52NC_016355GTT43380333814120 %66.67 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
53NC_016355TTA435463354741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_016355GAA436022360321166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
55NC_016355TGAC336697367071125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
56NC_016355TGGAAT337171371891933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %Non-Coding
57NC_016355T153732337337150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
58NC_016355GTAT337463374741225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
59NC_016355TAA438024380341166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_016355CTTT43810838122150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
61NC_016355TTTG33856238574130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
62NC_016355ATT438649386601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
63NC_016355CTCTG33914839162150 %40 %20 %40 %6 %Non-Coding
64NC_016355CAAG339419394291150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
65NC_016355CTTA340249402591125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
66NC_016355TCTCAT340563405791716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
67NC_016355AAAG340808408191275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
68NC_016355ATT441352413621133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
69NC_016355TCT44144841460130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
70NC_016355AAAG346486464961175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
71NC_016355CT64690146911110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
72NC_016355TTGT34697246983120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
73NC_016355CAT447026470371233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
74NC_016355AGAA347438474491275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
75NC_016355GA647477474871150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
76NC_016355AAGA350238502481175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
77NC_016355A12506205063112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_016355G135120951221130 %0 %100 %0 %7 %Non-Coding
79NC_016355GAA453438534481166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016355AT653741537511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_016355CTT45600456015120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
82NC_016355CAAGA356038560511460 %0 %20 %20 %7 %Non-Coding
83NC_016355CT75688456896130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
84NC_016355AT656942569521150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_016355TTA457455574661233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_016355GGTG36001660026110 %25 %75 %0 %9 %Non-Coding
87NC_016355CGA460197602071133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
88NC_016355CTT46189961909110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
89NC_016355A15645336454715100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
90NC_016355TA764775647871350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
91NC_016355TCCAT365559655721420 %40 %0 %40 %7 %Non-Coding
92NC_016355GA666656666661150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
93NC_016355TAG467108671181133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
94NC_016355CATCT369222692371620 %40 %0 %40 %6 %Non-Coding
95NC_016355TCT46967069682130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
96NC_016355TACAA369769697831560 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
97NC_016355AAGA370560705721375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
98NC_016355CTTT47110571119150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
99NC_016355TA671345713561250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_016355AGA471649716611366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
101NC_016355CAAG371834718451250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
102NC_016355TTA473410734211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_016355ATCCT373516735291420 %40 %0 %40 %7 %Non-Coding
104NC_016355CTTTG37370673719140 %60 %20 %20 %7 %Non-Coding
105NC_016355TCT47447074481120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
106NC_016355CTT47496074971120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
107NC_016355T137523575247130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
108NC_016355AG677109771191150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
109NC_016355CTTT37832478334110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
110NC_016355CTT47905879069120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
111NC_016355TGAG379428794381125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
112NC_016355ATGC379542795531225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
113NC_016355CAG479682796931233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
114NC_016355AATTT380120801341540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
115NC_016355TC68046580475110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
116NC_016355CTT48139681406110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
117NC_016355TTA481431814431333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
118NC_016355TAT481555815661233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
119NC_016355TAA682611826271766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
120NC_016355CAA482880828911266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
121NC_016355T128339983410120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
122NC_016355AGT483481834911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
123NC_016355GAC484973849841233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
124NC_016355AGAA385604856151275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
125NC_016355AAGA385855858651175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
126NC_016355ATTAGG386978869961933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %Non-Coding
127NC_016355GACT387290873001125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
128NC_016355AT788967889811550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
129NC_016355GTC48914189151110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
130NC_016355CATTA389380893931440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
131NC_016355CTA489490895011233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
132NC_016355TAG589643896571533.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
133NC_016355AGT489736897461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
134NC_016355TTC48990689917120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
135NC_016355TTTA390938909481125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
136NC_016355ATT491147911581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
137NC_016355CTTT39131991329110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
138NC_016355GA792705927171350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
139NC_016355A22927249274522100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
140NC_016355T129354293553120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
141NC_016355TTAA493909939241650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
142NC_016355TTTA395005950161225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
143NC_016355TA695324953341150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
144NC_016355CAAA396040960511275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
145NC_016355CAAT396741967521250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
146NC_016355CAT497202972131233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
147NC_016355TAC497899979091133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
148NC_016355ATTA398341983531350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
149NC_016355TCT49895898969120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
150NC_016355ATTT399298993091225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
151NC_016355T179965899674170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
152NC_016355AGCG31004711004821225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
153NC_016355GCCA31009151009261225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
154NC_016355AT61011941012041150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
155NC_016355A1310385010386213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
156NC_016355GTCT3104764104774110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
157NC_016355TTTC3104972104983120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
158NC_016355A1210568210569312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
159NC_016355AT61073731073831150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
160NC_016355CT6107888107898110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
161NC_016355ATA41083041083151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
162NC_016355GA71086341086461350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
163NC_016355TA61092861092971250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
164NC_016355AGAT31097551097651150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
165NC_016355AAGA31098681098781175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
166NC_016355ATA51103741103871466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
167NC_016355TGC4110487110497110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
168NC_016355TTTC3110767110777110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
169NC_016355GAA41108021108121166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
170NC_016355TA71115981116111450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
171NC_016355CTAA41118241118391650 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
172NC_016355A1411322111323414100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
173NC_016355A1311332911334113100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
174NC_016355TTCA31137081137181125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
175NC_016355A1511403611405015100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
176NC_016355ATTG31145811145911125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
177NC_016355TCTT3115968115979120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
178NC_016355A1511598411599815100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
179NC_016355CTA41160581160691233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
180NC_016355TA61169561169661150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
181NC_016355TTGC3117306117317120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
182NC_016355ATT41176171176271133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
183NC_016355AGT41176711176821233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
184NC_016355ATTT31183881183981125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
185NC_016355AAAC31189301189401175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
186NC_016355CTTC3119076119087120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
187NC_016355GTTC3119728119739120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
188NC_016355TTAG31198561198671225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
189NC_016355T17120620120636170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
190NC_016355GAAA31214291214391175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
191NC_016355A1612282412283916100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
192NC_016355AAG41233661233761166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
193NC_016355TGAG31236021236121125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
194NC_016355CTAT31239081239191225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
195NC_016355AGT41242061242161133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
196NC_016355TTTC3124347124357110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
197NC_016355CTA41244531244641233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
198NC_016355CTA51246391246521433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
199NC_016355TA111249461249662150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
200NC_016355AGA41250481250591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
201NC_016355TATT31268491268601225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
202NC_016355GGAA41276111276251550 %0 %50 %0 %6 %Non-Coding
203NC_016355AAG41281881281991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
204NC_016355TA61285661285771250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
205NC_016355TTA41287771287881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
206NC_016355CATAT31290091290231540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
207NC_016355AGA51292591292731566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
208NC_016355AAAG31299451299551175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
209NC_016355AAAGAG31304741304911866.67 %0 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
210NC_016355AG71306601306731450 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
211NC_016355AAAT31308921309031275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
212NC_016355TCTT3131021131031110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
213NC_016355A1613129313130816100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
214NC_016355CGAA31315771315881250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
215NC_016355TA61321661321761150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
216NC_016355AG71322891323011350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
217NC_016355AGA41334591334701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
218NC_016355TTC4135261135271110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
219NC_016355AGA41358181358301366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
220NC_016355AGT41363021363121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
221NC_016355AAG41373651373761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
222NC_016355AGA41380441380551266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
223NC_016355CA61382401382501150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
224NC_016355CCTT3138773138783110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
225NC_016355CAAG31402241402341150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
226NC_016355CTTT3141010141020110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
227NC_016355TTACT31411021411151420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
228NC_016355TCTT3142195142206120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
229NC_016355TTC4143186143196110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
230NC_016355CTTTCT3143655143671170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
231NC_016355CTTTCT3143692143708170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
232NC_016355AGAGAA31442101442271866.67 %0 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
233NC_016355CAAA31450871450971175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
234NC_016355A1214528814529912100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
235NC_016355T12146037146048120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
236NC_016355TAAG31465761465881350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
237NC_016355CTAT31466551466661225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
238NC_016355GAAA31468141468241175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
239NC_016355TTCTTT3147059147076180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
240NC_016355ATT41474521474621133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
241NC_016355A1214757314758412100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding