ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 46

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016353	GAA	4	190	200	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016353	CTG	4	882	894	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016353	AGA	4	1274	1284	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016353	ACT	4	3758	3768	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016353	CTT	4	4997	5008	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016353	CAT	4	6056	6066	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016353	AGT	4	10519	10530	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016353	TCA	4	11715	11726	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016353	CTC	4	18406	18416	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016353	AGA	4	22918	22928	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016353	TCT	5	23323	23337	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016353	AGC	4	27462	27473	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016353	ATC	4	27901	27911	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016353	TAA	4	31417	31428	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016353	CTT	4	31539	31550	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016353	ATG	4	37798	37808	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016353	AGA	5	38138	38152	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016353	ATA	4	40675	40686	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016353	CTT	4	45115	45125	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016353	AGA	4	49227	49238	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016353	GAA	4	60002	60012	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016353	TTA	4	60431	60441	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016353	TAT	4	62298	62308	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016353	TAT	4	62849	62860	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016353	CTT	4	64821	64831	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016353	GAA	4	67351	67362	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016353	TTA	4	68848	68858	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016353	CAG	4	71243	71254	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016353	TGA	4	72073	72084	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016353	TCT	4	74533	74544	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016353	GAA	4	74800	74810	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016353	ATA	4	76484	76494	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016353	CCT	4	78970	78981	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016353	TGC	4	79337	79348	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016353	TAA	4	79551	79562	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016353	TCT	4	80082	80093	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016353	GAA	4	86402	86413	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016353	TTA	4	87974	87985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016353	TAA	4	88815	88827	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016353	AAT	4	90064	90075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016353	AAG	4	90851	90862	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016353	AGA	4	93397	93407	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 46