ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 22

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016352TTGG3693703110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
2NC_016352AAG4155815691266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
3NC_016352TA6181718271150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_016352TAAG3232523351150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
5NC_016352TAT4297529871333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_016352AAAC3315731681275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
7NC_016352AT7322832401350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_016352AGA4383638461166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
9NC_016352TTGC342334244120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
10NC_016352ATA4451245231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016352CAAA3462846391275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_016352A124822483312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
13NC_016352AAT4522052301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_016352AATG3556655771250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016352TTA4568957001233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_016352CTTT360966108130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
17NC_016352T1463946407140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_016352GAA4702470351266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016352TA6704370531150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_016352AT12720972302250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_016352TCT581608174150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
22NC_016352CTGA3902090311225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
23NC_016352ATA4950995201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016352AAAG310509105191175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
25NC_016352T121091410925120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
26NC_016352TCT41116811178110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
27NC_016352TATT311834118451225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_016352GTAA411920119341550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
29NC_016352AAG412533125441266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
30NC_016352AAG415035150451166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
31NC_016352CTAT316247162581225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
32NC_016352ATTT316645166561225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_016352TA616762167721150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
34NC_016352TGA417229172391133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_016352T151758617600150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
36NC_016352ATTT317684176941125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
37NC_016352TAATG317985179991540 %40 %20 %0 %0 %Non-Coding
38NC_016352AGCT319013190241225 %25 %25 %25 %0 %Non-Coding
39NC_016352GCCT32020920220120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
40NC_016352AGA620231202512166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
41NC_016352ATCG320445204561225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
42NC_016352GAT423246232561133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016352AAGG325409254191150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
44NC_016352A12260702608112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_016352AAG526369263831566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
46NC_016352TCT42700127011110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
47NC_016352ACT427554275641133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
48NC_016352GAAGT328385283991540 %20 %40 %0 %6 %Non-Coding
49NC_016352CCCT32933329345130 %25 %0 %75 %7 %Non-Coding
50NC_016352TGG42982629837120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
51NC_016352AGA430533305441266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
52NC_016352CTTT33186731878120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
53NC_016352TTC43188531895110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
54NC_016352CAAA333690337011275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
55NC_016352AAAT335423354351375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
56NC_016352TTTC43601736031150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
57NC_016352AAAG337399374091175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
58NC_016352ATA438099381091166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
59NC_016352TGA438457384681233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
60NC_016352TAA438762387731266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_016352ATA439254392641166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
62NC_016352AGAA340383403931175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
63NC_016352T124044940460120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
64NC_016352TCA443846438571233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
65NC_016352GCTT34440244413120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
66NC_016352A15445814459515100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
67NC_016352TAT445019450291133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_016352A12452444525512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
69NC_016352ATC445281452921233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
70NC_016352TCTT34552245533120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
71NC_016352CGCC34555645567120 %0 %25 %75 %0 %Non-Coding
72NC_016352AAAG345619456291175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
73NC_016352A19460304604819100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
74NC_016352ACAA348076480881375 %0 %0 %25 %7 %Non-Coding
75NC_016352A14481674818014100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
76NC_016352TATT349396494081325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_016352TTTTG35015750170140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
78NC_016352T125029350304120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_016352TAT450618506291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_016352TA950727507431750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
81NC_016352ATTG350991510011125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
82NC_016352GAAG351506515181350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
83NC_016352T175206252078170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
84NC_016352ATA452166521761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_016352CAG452444524551233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
86NC_016352GAA453569535801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
87NC_016352ACTT354690547011225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
88NC_016352GTA456213562241233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
89NC_016352CTTT45741757432160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
90NC_016352TCCTTA357933579491716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
91NC_016352A15592405925415100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
92NC_016352TTAA359433594441250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
93NC_016352GTT45978459795120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
94NC_016352TA661262612721150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
95NC_016352GCTT36157661587120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
96NC_016352GGCTTT36274562762180 %50 %33.33 %16.67 %5 %Non-Coding
97NC_016352T136311163123130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_016352CT76325963271130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
99NC_016352GAAA363848638601375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
100NC_016352AT664763647731150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
101NC_016352CTT46559465605120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
102NC_016352TTGA365753657641225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
103NC_016352GA666087660971150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
104NC_016352TAGA366410664201150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
105NC_016352T146665866671140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
106NC_016352CAAA367656676671275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
107NC_016352AGA468800688111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
108NC_016352CTTT36959969610120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
109NC_016352ATGA369870698801150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
110NC_016352ATCTTG470064700872416.67 %50 %16.67 %16.67 %4 %Non-Coding
111NC_016352ATCT370677706881225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
112NC_016352TA670826708361150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_016352CTA470996710081333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
114NC_016352TCAA372127721381250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
115NC_016352CTT47224772259130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
116NC_016352CT67228072291120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
117NC_016352TAG473028730381133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
118NC_016352TA873529735431550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
119NC_016352CTTA373704737151225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
120NC_016352AT674227742371150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_016352CTA475361753721233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
122NC_016352AG675615756251150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
123NC_016352AATG375864758751250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
124NC_016352A12762977630812100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
125NC_016352CA776307763191350 %0 %0 %50 %7 %Non-Coding
126NC_016352AAG477337773481266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
127NC_016352CTTT38018380193110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
128NC_016352TA681021810311150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
129NC_016352CTT58120581219150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
130NC_016352TTTC38124781259130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
131NC_016352AGCG381496815061125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
132NC_016352A14822428225514100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
133NC_016352T128361883629120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
134NC_016352GAA483734837461366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
135NC_016352A13840648407613100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
136NC_016352ACTT386463864741225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
137NC_016352CTT48666486676130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
138NC_016352TTTC38749687507120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
139NC_016352CTT48751187522120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
140NC_016352GAAA387690877011275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
141NC_016352AGA487755877661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
142NC_016352A14879438795614100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
143NC_016352AT888123881381650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
144NC_016352TA688346883571250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
145NC_016352TA688545885551150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
146NC_016352CTT48959889610130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
147NC_016352GATCC390615906281420 %20 %20 %40 %7 %Non-Coding
148NC_016352TAT491775917861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
149NC_016352ATA591804918181566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
150NC_016352AAAGT391970919831460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
151NC_016352CTTT39357193581110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
152NC_016352ACGC394363943731125 %0 %25 %50 %9 %Non-Coding
153NC_016352TTC49567195682120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
154NC_016352CTTT39611896128110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
155NC_016352TTA496214962251233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
156NC_016352ATTTTA396673966901833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
157NC_016352CT69714597156120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
158NC_016352GT69829298302110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
159NC_016352GA698355983651150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
160NC_016352CTT49886398874120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
161NC_016352CTT49901199022120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
162NC_016352A1310055210056413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
163NC_016352CTTAA41008311008502040 %40 %0 %20 %10 %Non-Coding
164NC_016352TAG41023541023641133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
165NC_016352TAAGA31024151024281460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
166NC_016352TTA41027601027701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
167NC_016352TAT41035731035841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
168NC_016352AAGA31040271040371175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
169NC_016352AGAA31041861041961175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
170NC_016352TTC4104723104733110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
171NC_016352TTA41055831055931133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
172NC_016352AAG41058661058771266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
173NC_016352TTC4106224106235120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
174NC_016352T12106525106536120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
175NC_016352CTT4106622106632110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
176NC_016352AGAA31078051078161275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
177NC_016352AGCG31081141081251225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
178NC_016352AGA41083471083581266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
179NC_016352AAGT31098231098331150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
180NC_016352CTT4110101110112120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
181NC_016352CTTTC3110382110396150 %60 %0 %40 %0 %Non-Coding
182NC_016352TGT4110741110751110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
183NC_016352GAA41109061109181366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
184NC_016352ATG41115561115661133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
185NC_016352T14112080112093140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
186NC_016352GGAA31124981125081150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
187NC_016352CTT4113442113453120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
188NC_016352CGC4114042114053120 %0 %33.33 %66.67 %8 %Non-Coding
189NC_016352TAAG31147871147981250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
190NC_016352TAT51148821148951433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
191NC_016352TATTCC31158711158881816.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
192NC_016352T13116113116125130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
193NC_016352GCTT3117351117362120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
194NC_016352T14118107118120140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
195NC_016352AT61186531186641250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
196NC_016352AT81187801187951650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
197NC_016352GAAA31198611198711175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
198NC_016352TA61201591201691150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
199NC_016352CTCTTT3120712120729180 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
200NC_016352GTA41209951210061233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
201NC_016352AAGC31210071210181250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
202NC_016352AGTA31219581219681150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
203NC_016352GATA31221241221341150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
204NC_016352AAG41221811221911166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding