ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 22

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016352	AAG	4	1558	1569	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016352	TAT	4	2975	2987	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016352	AGA	4	3836	3846	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016352	ATA	4	4512	4523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016352	AAT	4	5220	5230	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016352	TTA	4	5689	5700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016352	GAA	4	7024	7035	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016352	TCT	5	8160	8174	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016352	ATA	4	9509	9520	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016352	TCT	4	11168	11178	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016352	AAG	4	12533	12544	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016352	AAG	4	15035	15045	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016352	TGA	4	17229	17239	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016352	AGA	6	20231	20251	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016352	GAT	4	23246	23256	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016352	AAG	5	26369	26383	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016352	TCT	4	27001	27011	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016352	ACT	4	27554	27564	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016352	TGG	4	29826	29837	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016352	AGA	4	30533	30544	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016352	TTC	4	31885	31895	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016352	ATA	4	38099	38109	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016352	TGA	4	38457	38468	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016352	TAA	4	38762	38773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016352	ATA	4	39254	39264	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016352	TCA	4	43846	43857	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016352	TAT	4	45019	45029	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016352	ATC	4	45281	45292	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016352	TAT	4	50618	50629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016352	ATA	4	52166	52176	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016352	CAG	4	52444	52455	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016352	GAA	4	53569	53580	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016352	GTA	4	56213	56224	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016352	GTT	4	59784	59795	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016352	CTT	4	65594	65605	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016352	AGA	4	68800	68811	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016352	CTA	4	70996	71008	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016352	CTT	4	72247	72259	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016352	TAG	4	73028	73038	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016352	CTA	4	75361	75372	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016352	AAG	4	77337	77348	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016352	CTT	5	81205	81219	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016352	GAA	4	83734	83746	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016352	CTT	4	86664	86676	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016352	CTT	4	87511	87522	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016352	AGA	4	87755	87766	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016352	CTT	4	89598	89610	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016352	TAT	4	91775	91786	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016352	ATA	5	91804	91818	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016352	TTC	4	95671	95682	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016352	TTA	4	96214	96225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016352	CTT	4	98863	98874	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016352	CTT	4	99011	99022	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016352	TAG	4	102354	102364	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016352	TTA	4	102760	102770	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016352	TAT	4	103573	103584	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016352	TTC	4	104723	104733	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016352	TTA	4	105583	105593	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016352	AAG	4	105866	105877	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016352	TTC	4	106224	106235	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016352	CTT	4	106622	106632	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016352	AGA	4	108347	108358	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016352	CTT	4	110101	110112	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016352	TGT	4	110741	110751	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016352	GAA	4	110906	110918	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016352	ATG	4	111556	111566	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016352	CTT	4	113442	113453	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016352	CGC	4	114042	114053	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016352	TAT	5	114882	114895	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016352	GTA	4	120995	121006	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016352	AAG	4	122181	122191	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 22