ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 41

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016350	CAT	4	3930	3940	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016350	CAG	4	4224	4235	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016350	CTA	4	7393	7403	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016350	AGA	4	8545	8556	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016350	CAA	4	9622	9633	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016350	TCT	4	11674	11684	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016350	AAG	5	12694	12707	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016350	GAA	4	16319	16329	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016350	ATT	4	20570	20581	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016350	CTA	4	20777	20787	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016350	TCT	4	29161	29171	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016350	TAA	5	31746	31759	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016350	AGA	4	32638	32649	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016350	TGA	4	32647	32658	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016350	AGT	4	35566	35576	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016350	ATT	4	41048	41059	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016350	TAT	4	41798	41809	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016350	ATA	4	42874	42884	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016350	CTT	4	43301	43311	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016350	TCT	4	47408	47418	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016350	CTT	4	49552	49564	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016350	CTT	4	51640	51650	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016350	ACT	4	51714	51725	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016350	ATT	4	57770	57780	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016350	CTT	4	59832	59843	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016350	TTA	4	66985	66996	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016350	ACT	4	67013	67023	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016350	CTA	4	67137	67147	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016350	ACA	4	68119	68130	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016350	ATA	4	68942	68953	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016350	TAC	4	70792	70803	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016350	TTA	4	71416	71426	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016350	CTT	4	74661	74672	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016350	AAG	4	81926	81937	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016350	ATA	4	85938	85948	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016350	CAT	4	87391	87401	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016350	AGT	4	88066	88077	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016350	AAG	4	89796	89808	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016350	TCT	4	94052	94064	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016350	ATA	5	94196	94209	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016350	CTT	4	96351	96361	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016350	AGC	4	98087	98098	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016350	ATT	4	100006	100017	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 41