ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 3

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016348	AAT	4	109	119	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016348	ATA	5	1279	1292	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016348	CAA	4	1523	1534	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016348	ATA	6	2020	2036	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016348	TAA	5	2763	2776	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016348	TGA	4	3199	3209	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016348	TAC	4	3243	3254	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016348	ATA	4	3451	3462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016348	CTT	4	6002	6013	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016348	TTA	4	7574	7585	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016348	AGA	4	7926	7936	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016348	CTT	4	8463	8475	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016348	CTT	5	10518	10531	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016348	TTC	4	11561	11571	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016348	GAA	4	12567	12577	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016348	AGA	4	13872	13883	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016348	AGT	4	16203	16214	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016348	ATT	4	21204	21215	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016348	TAT	5	22436	22450	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016348	TAG	4	23013	23026	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016348	TGC	4	23918	23929	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016348	TAC	4	26184	26195	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016348	TGG	4	28720	28731	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016348	GAA	4	32605	32616	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016348	TAG	4	36028	36039	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016348	CTT	4	38074	38084	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016348	GGT	4	38724	38736	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016348	GAA	4	38801	38813	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016348	AGA	4	41868	41878	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016348	AGA	4	42018	42029	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016348	TTA	4	48458	48469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016348	AGT	4	48866	48876	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016348	GAA	4	50139	50149	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016348	GAA	4	52025	52035	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016348	TTA	4	54896	54906	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016348	CTT	4	64618	64628	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016348	TAA	4	65105	65116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016348	TCT	4	66541	66552	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016348	AGC	4	68220	68230	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016348	GCT	4	71573	71584	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016348	TAA	4	71718	71728	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016348	CTT	4	72679	72691	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016348	CTC	4	77585	77595	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016348	CTT	5	85369	85382	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016348	CTT	4	90081	90091	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016348	CTC	4	91307	91317	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016348	AGA	4	92300	92311	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016348	AGA	4	99801	99812	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016348	ACT	4	110981	110993	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016348	ATT	4	113504	113514	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016348	TCT	4	114100	114110	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016348	ATA	4	115358	115368	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016348	TCT	4	115714	115724	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016348	TCT	4	120939	120950	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016348	TAT	4	121721	121732	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016348	AGT	4	126359	126369	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016348	ATA	4	127191	127202	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016348	TTA	5	127518	127532	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016348	TAT	4	127731	127741	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016348	GAA	4	135023	135034	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016348	GAA	4	141757	141769	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016348	CTT	4	143709	143721	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016348	TAT	6	143722	143739	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016348	ACT	4	144133	144143	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016348	CTA	4	144609	144619	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016348	GCA	4	145475	145486	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016348	ATC	4	148526	148536	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016348	TAT	4	148915	148926	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016348	TAT	5	149881	149895	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016348	TAT	4	150458	150469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016348	TCT	4	151671	151682	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 3