ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 36

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016347	CTA	4	542	552	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016347	CAA	4	1032	1043	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016347	AT	6	1427	1438	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016347	CTTT	3	1828	1838	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016347	CAAG	3	2122	2133	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016347	TTAT	3	2608	2620	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016347	TAGCT	3	3939	3952	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016347	TTA	4	4793	4803	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016347	GCT	4	6123	6133	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016347	CTTAGT	3	6284	6300	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
11	NC_016347	AGTC	3	6743	6753	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016347	CTA	4	7849	7860	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016347	TAT	4	7896	7906	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016347	TAT	4	7909	7919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016347	TAG	4	8295	8305	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016347	T	12	8658	8669	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016347	ATAA	3	8830	8840	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016347	AGT	4	8957	8968	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016347	TAC	4	9201	9212	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016347	AGCA	3	9538	9549	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016347	T	14	10393	10406	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016347	TGC	4	12009	12019	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016347	AAG	4	12110	12121	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016347	GAAAG	3	12422	12435	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016347	TTA	5	13657	13671	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016347	TATT	3	13802	13813	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016347	ATCTT	3	14841	14855	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016347	AG	6	15719	15729	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016347	T	12	17724	17735	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016347	TCTT	5	18108	18128	21	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016347	TCT	4	18439	18451	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016347	TAGG	3	19211	19222	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016347	A	17	20958	20974	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016347	A	14	21589	21602	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016347	TCTG	3	21957	21969	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016347	GA	6	23118	23129	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016347	TATGAT	3	23308	23324	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_016347	TCGT	3	23339	23350	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016347	AGA	4	24181	24191	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016347	T	12	24902	24913	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016347	GCTT	3	25247	25259	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016347	TCA	4	25923	25933	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016347	CTT	4	26059	26069	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016347	AGTGTA	3	26312	26328	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_016347	GCT	4	29743	29754	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016347	TA	6	30170	30180	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016347	GAAAAA	3	30233	30250	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_016347	AAAG	3	32209	32219	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016347	AGAA	3	33137	33147	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016347	AAAAAG	3	33897	33913	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016347	CA	6	34090	34101	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016347	TAAA	3	34475	34486	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016347	A	12	34961	34972	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016347	AAAG	3	35131	35143	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016347	TA	6	35413	35423	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016347	AAAG	3	35481	35491	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016347	TACTTA	3	35548	35564	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
58	NC_016347	ACAA	3	35581	35592	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016347	TTG	4	36173	36184	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016347	TAAA	3	36201	36212	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016347	CCAG	3	36420	36431	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016347	AGA	4	36919	36930	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016347	TCA	4	38302	38313	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016347	TTTA	3	38674	38685	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016347	TCT	5	39445	39459	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016347	AATC	3	39685	39696	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016347	AGA	4	40494	40505	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016347	GAA	4	41186	41197	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016347	ATCG	3	41491	41501	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016347	TCT	4	41826	41838	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016347	CT	8	42475	42489	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016347	AGA	4	42564	42575	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016347	TC	6	42608	42618	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016347	GAAA	3	42680	42691	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016347	T	15	43094	43108	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016347	CTT	4	44443	44454	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016347	TGT	4	44631	44641	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016347	TA	6	46915	46926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016347	TATTT	3	47133	47148	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016347	TGTA	3	48132	48142	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016347	CAAT	3	49079	49090	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016347	ATTT	4	51220	51235	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016347	TCA	4	52050	52061	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016347	CTA	4	52516	52526	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016347	AAAG	3	53599	53610	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016347	CTA	4	53819	53829	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016347	TTA	4	54134	54145	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016347	CTTT	3	54325	54335	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016347	TAG	5	55017	55031	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016347	AAT	4	55920	55930	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016347	AAAG	3	56429	56440	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016347	CAGA	3	56656	56667	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016347	A	13	56828	56840	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016347	TTC	4	57258	57268	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016347	TGA	4	57946	57956	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016347	TAA	4	58775	58785	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016347	GAA	4	59289	59299	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016347	CTTT	3	62207	62217	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016347	A	12	62413	62424	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016347	GAT	4	62471	62482	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016347	TTAATA	3	62972	62988	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_016347	GTATA	3	63196	63210	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016347	TTA	4	63584	63595	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016347	TAGT	3	63903	63914	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016347	CAC	4	64176	64186	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016347	TTTA	3	65858	65868	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016347	ATTAT	3	66942	66956	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016347	ATATAA	3	67074	67092	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_016347	AGAAA	3	67413	67428	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016347	CTTT	3	68491	68501	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016347	GAT	4	69198	69209	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016347	ATGT	3	69370	69381	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016347	AGC	4	69655	69667	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016347	GAAA	3	70442	70452	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016347	CTT	4	71415	71426	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016347	TCTT	3	71924	71935	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016347	TA	6	72154	72164	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016347	ATT	4	72521	72532	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016347	TA	6	72580	72590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016347	TTCA	3	73686	73697	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016347	CTT	4	74331	74341	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016347	TTGC	3	74736	74747	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016347	GAAAGA	3	76288	76306	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
124	NC_016347	CT	6	76645	76655	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	35805104
125	NC_016347	A	15	77876	77890	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016347	TAT	4	79814	79825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016347	AAAG	3	81887	81897	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016347	AT	6	82909	82920	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016347	GGTC	3	83471	83482	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016347	AT	6	84316	84326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016347	A	12	84492	84503	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016347	TA	6	84989	84999	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016347	GCT	4	85102	85113	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016347	CTT	4	86550	86560	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016347	CTTT	3	86904	86915	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016347	TTA	4	86953	86963	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016347	ATA	6	87626	87642	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
138	NC_016347	AAG	4	87741	87751	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016347	CAAA	3	89078	89089	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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161	NC_016347	TTAA	4	101695	101710	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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164	NC_016347	A	14	102929	102942	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 36