ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 17

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016346	ATT	4	114	125	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016346	AGA	5	3646	3659	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016346	TTA	5	4210	4224	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016346	CTT	4	7292	7303	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016346	AGA	4	9041	9053	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016346	CTA	4	9061	9072	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016346	ATT	4	11968	11979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016346	AGA	4	13104	13116	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016346	ATA	4	13398	13408	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016346	TTA	4	17667	17677	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016346	TAT	4	18207	18217	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016346	AGA	4	18838	18849	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016346	CTC	4	19486	19496	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016346	ATA	4	20438	20448	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016346	GAA	4	23346	23357	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016346	TTA	4	24345	24355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016346	AAG	4	24939	24949	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016346	TAG	4	25417	25428	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016346	TAG	4	26231	26242	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016346	AAG	4	26419	26431	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016346	TTA	4	27035	27047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016346	ACT	4	29119	29129	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016346	GAA	4	31123	31134	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016346	CAT	4	31250	31261	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016346	TAC	4	35577	35587	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016346	ACT	4	38719	38730	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016346	AGA	4	42052	42064	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016346	AGA	4	42431	42441	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016346	TGA	4	48199	48210	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016346	CCT	4	48411	48421	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016346	AGC	4	49872	49884	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016346	ATT	5	55554	55568	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016346	TCT	4	57218	57228	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016346	AAG	4	59658	59669	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016346	TCT	4	60420	60430	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016346	TTA	4	60595	60605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016346	CAA	4	60691	60702	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016346	TTA	4	61390	61402	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016346	CCA	4	62449	62460	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016346	TGG	4	64330	64341	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016346	GAT	4	66689	66700	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016346	GAG	4	67531	67541	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016346	TAT	4	67583	67593	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016346	ACT	4	68100	68111	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016346	CTT	4	69106	69116	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016346	TAT	4	72325	72335	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016346	ATC	4	77471	77481	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016346	ATA	4	78171	78181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016346	AGG	4	84021	84032	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016346	TCA	4	90669	90680	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016346	AAG	4	101456	101467	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016346	TTC	4	104157	104168	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016346	GTA	4	105715	105726	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016346	AGA	4	106545	106556	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016346	AAG	4	106692	106703	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016346	TCT	4	107942	107952	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016346	AGA	4	109228	109239	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016346	TTA	5	110795	110808	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016346	CTA	4	112765	112775	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016346	TAC	4	114175	114186	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016346	GAA	4	114507	114518	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016346	CTT	4	116023	116034	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016346	ATT	5	116204	116218	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016346	TCT	4	117471	117481	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016346	GTA	4	118800	118810	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016346	CCT	4	127292	127302	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016346	GGA	4	127597	127607	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 17