ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 12

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016345	AGA	4	1408	1418	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016345	TAT	4	1680	1690	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016345	CTC	4	2090	2100	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016345	GTT	4	6803	6814	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016345	GAA	4	9143	9154	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016345	TAA	4	10912	10923	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016345	CTT	4	14403	14414	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016345	GCA	4	16771	16781	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016345	AAT	4	21468	21478	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016345	TCT	4	22653	22664	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016345	AGA	7	28443	28462	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
12	NC_016345	TTC	4	28496	28507	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016345	AAG	4	30897	30908	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016345	TAA	4	33510	33522	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016345	ATT	4	39214	39225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016345	TAT	4	39807	39819	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016345	AGC	4	43181	43192	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016345	CTA	4	45879	45889	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016345	AAT	4	46327	46337	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016345	ATT	4	48265	48275	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016345	CCT	4	48493	48503	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016345	ATA	4	54250	54260	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016345	CTT	4	54673	54683	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016345	ATT	4	57339	57350	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016345	TCT	4	57863	57877	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016345	TTA	4	58358	58369	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016345	AAC	4	60010	60021	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016345	TAA	4	60605	60616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016345	TTC	5	63702	63715	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016345	GAG	4	67750	67761	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016345	TCA	4	68454	68464	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016345	ACT	4	68552	68562	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016345	ATA	4	69502	69514	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016345	GCT	4	69698	69708	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016345	CTT	4	69983	69994	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016345	TCA	4	70557	70568	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016345	GCA	4	70861	70872	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016345	AGC	4	72400	72411	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016345	GAA	4	73419	73430	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016345	GAG	4	74643	74654	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016345	TCT	4	75502	75512	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016345	AGA	4	75996	76008	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016345	CTA	4	76311	76322	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016345	GGA	4	77639	77650	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016345	AAG	4	80909	80919	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016345	GGA	4	83013	83023	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016345	CTT	4	83512	83522	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016345	AGA	4	84342	84352	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016345	TAA	4	85630	85641	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016345	TTA	4	86361	86371	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016345	CAG	4	95248	95258	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	35805104
52	NC_016345	CTT	4	97125	97135	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35805104
53	NC_016345	AAT	4	98278	98289	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35805104
54	NC_016345	AAG	4	99214	99225	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016345	AAC	4	103585	103597	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016345	CTT	4	106660	106670	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016345	ATT	4	109386	109397	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016345	AGA	4	112095	112106	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016345	AGT	4	118822	118832	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016345	AAG	4	120818	120829	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016345	ATG	4	121877	121888	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016345	TGC	4	123901	123913	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016345	CTT	4	127032	127043	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016345	CTG	4	129221	129232	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016345	AAC	4	129554	129565	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016345	AGT	4	132851	132862	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016345	ACA	4	133779	133791	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 12