ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 35

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016344	TA	6	1012	1022	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016344	TGAA	3	2076	2086	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016344	CCA	4	5792	5802	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016344	TAA	4	5861	5872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016344	AGA	4	6195	6205	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016344	TAG	4	6274	6284	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016344	CATTA	3	6667	6681	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016344	TTTC	3	6812	6822	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016344	GAA	4	7840	7851	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016344	AT	9	8197	8213	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_016344	GAA	4	8604	8615	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016344	CTTG	3	11750	11760	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016344	GTC	4	12284	12294	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016344	TAGC	3	12485	12496	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016344	TAA	4	12704	12715	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016344	GCTT	3	13475	13485	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016344	TTC	5	14012	14026	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016344	AT	6	14668	14678	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016344	T	14	15612	15625	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016344	A	12	15807	15818	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016344	TAAG	3	16167	16177	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016344	AGGG	3	20001	20012	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016344	ACCT	3	21222	21232	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016344	AAAG	3	21724	21735	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016344	AAAAAG	3	22377	22393	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_016344	AACT	3	22616	22626	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016344	CT	7	23176	23189	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016344	AAGC	3	23831	23841	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016344	TCT	4	24172	24183	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016344	T	13	24535	24547	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016344	CTAT	3	24557	24567	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016344	TAAAA	3	24706	24720	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016344	TA	6	25255	25265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016344	AAGA	3	25639	25650	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016344	TAAC	3	26624	26635	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016344	CGTT	3	26753	26764	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016344	T	18	27334	27351	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_016344	TCT	5	27682	27696	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016344	TTGCC	3	28122	28135	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016344	TTGA	3	28239	28250	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016344	TTAA	3	29007	29019	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016344	ATTCC	3	29573	29586	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016344	TC	6	30521	30531	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016344	ATTC	3	32203	32214	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016344	TTGC	4	34224	34239	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016344	A	12	35226	35237	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016344	ACC	4	35473	35484	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016344	AAG	4	35918	35928	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016344	CAT	4	36048	36058	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016344	CT	6	36279	36289	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016344	AGAT	3	36493	36504	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016344	AGGA	3	37376	37386	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016344	TA	6	38094	38104	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016344	TTGA	3	38831	38841	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016344	AAG	4	39147	39157	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016344	TAT	4	41658	41669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016344	ATA	4	42116	42126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016344	CAAG	3	42955	42967	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016344	CTTCT	3	43666	43680	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016344	AG	6	43861	43871	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016344	TTATA	3	44142	44155	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016344	CTA	4	44435	44446	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016344	AT	6	45797	45807	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016344	GCT	4	46932	46943	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016344	ATGAA	3	47091	47105	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016344	TACT	3	47459	47471	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016344	AGA	4	48447	48458	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016344	A	26	48699	48724	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016344	AAAGAA	3	48888	48904	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
70	NC_016344	CACTC	3	48923	48937	15	20 %	20 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016344	TAC	4	49264	49275	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016344	CTT	4	49383	49393	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016344	TTCTT	3	49672	49685	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016344	CTT	5	50102	50117	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016344	TCTT	3	50489	50500	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016344	TAT	4	50712	50722	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016344	ATA	5	50750	50764	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016344	TTA	4	50804	50814	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016344	ATA	4	50824	50835	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016344	A	12	50956	50967	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016344	TGA	4	51034	51045	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016344	AGA	4	51095	51106	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016344	AATAG	3	51110	51124	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016344	TTC	4	52847	52857	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016344	CTTT	3	53701	53712	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016344	TAA	4	53827	53837	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016344	GCAA	3	55202	55213	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016344	T	13	55595	55607	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016344	CTTG	3	55855	55865	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016344	TAC	4	56970	56980	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016344	AGAT	3	57067	57077	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016344	AT	7	57105	57120	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016344	CTTT	3	57208	57218	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016344	CTA	5	57409	57424	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016344	TAATGC	3	57423	57439	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016344	TA	6	57562	57575	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016344	TAT	6	58393	58410	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016344	T	15	58558	58572	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016344	TTAT	3	59379	59390	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016344	TAA	4	59582	59594	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016344	TTA	4	60634	60645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016344	CTTAT	3	60723	60736	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016344	TAT	4	60801	60812	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016344	AGA	4	61678	61688	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016344	TCGA	3	62107	62117	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016344	TA	8	63204	63220	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_016344	TAAAG	3	63503	63517	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016344	TTA	4	63625	63635	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016344	CTT	4	64418	64429	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016344	AGAA	3	65227	65237	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016344	AATC	3	65968	65979	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016344	T	12	68188	68199	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016344	GAT	4	68279	68290	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016344	CTTT	3	68487	68497	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016344	TGT	4	68950	68961	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016344	ACTTA	3	69523	69536	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016344	CTTTTT	3	70090	70107	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
118	NC_016344	TA	6	70490	70500	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016344	CTT	4	70621	70633	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016344	TA	7	70819	70831	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016344	T	15	70964	70978	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016344	AAAG	3	71672	71682	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016344	TCT	4	71859	71869	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016344	GAAA	3	71943	71953	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016344	TCC	4	72183	72194	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016344	GAAA	3	73829	73840	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016344	T	13	74188	74200	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016344	CTT	4	74307	74317	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016344	TAT	4	74445	74456	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016344	ATTTT	3	76169	76183	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_016344	AAAG	3	76866	76876	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016344	TAG	4	76933	76944	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016344	AT	6	76984	76994	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016344	AAGA	3	77241	77252	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016344	CTT	4	77485	77495	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016344	TAAAA	3	77705	77719	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016344	TA	7	78006	78018	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016344	TCT	5	78064	78078	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016344	GAT	6	78441	78457	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016344	CTTTC	3	78473	78486	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016344	AGTTA	3	79116	79129	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016344	AG	7	79491	79503	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016344	TTC	4	79636	79648	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016344	CCAT	4	79939	79954	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016344	GAG	4	80688	80698	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016344	GAAAA	3	81519	81533	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
147	NC_016344	AGAA	3	82200	82211	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_016344	TA	6	82583	82593	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016344	ATA	5	85031	85045	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
150	NC_016344	TGAA	3	85156	85167	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016344	CTT	4	86942	86953	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016344	TAT	4	87628	87638	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016344	TA	6	90509	90519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_016344	TA	6	90610	90620	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016344	TA	6	92298	92308	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016344	TA	6	93686	93698	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
157	NC_016344	AGG	4	96315	96326	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
158	NC_016344	GAT	4	96661	96672	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_016344	T	14	96848	96861	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
160	NC_016344	A	13	97727	97739	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_016344	TACTA	6	101987	102016	30	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016344	TAT	4	102162	102173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
163	NC_016344	TTA	4	103419	103429	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 35