ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 75

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016343	TCT	4	128	139	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016343	AAGA	4	446	461	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016343	CTT	4	1563	1575	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016343	AG	8	1931	1945	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016343	TCT	4	2387	2397	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016343	GAG	4	4196	4208	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016343	CTC	5	4476	4490	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016343	AAAAGA	3	5169	5186	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016343	TTTTC	3	5436	5450	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016343	AAAG	3	5669	5680	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016343	AC	8	6665	6680	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016343	CTA	5	6957	6970	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016343	AAGA	5	7807	7826	20	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_016343	TA	6	7863	7873	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016343	CTG	4	11520	11531	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016343	TTCC	3	11714	11724	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016343	TA	8	12668	12682	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016343	TCAT	3	13814	13825	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016343	TTCTT	3	14095	14108	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016343	TA	6	14490	14500	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016343	GAA	4	14641	14652	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016343	TCAT	3	14688	14699	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016343	TA	7	14933	14946	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016343	TCT	4	15840	15851	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016343	AGA	4	16313	16323	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016343	CTG	4	17356	17367	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016343	AAGA	3	18942	18952	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016343	CGAA	3	19141	19151	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016343	TGAAG	3	19417	19430	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016343	CTA	5	19511	19525	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016343	TAGA	3	20570	20581	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016343	TTC	4	21123	21133	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016343	CTAA	3	22092	22107	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016343	GCAAT	3	24655	24668	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016343	AG	6	24913	24924	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016343	CT	7	25372	25384	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016343	CA	7	25435	25448	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016343	CTTT	3	25572	25583	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016343	CTT	4	26385	26397	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016343	TTC	4	27189	27200	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016343	CTT	4	28424	28434	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016343	AGA	4	28531	28541	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016343	CTTTT	3	28813	28826	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016343	TCT	4	29417	29428	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016343	GAA	4	31715	31726	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016343	CT	6	31878	31889	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016343	CGAG	3	32715	32727	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016343	AGA	4	32895	32907	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016343	AGG	4	33942	33952	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016343	TCT	4	34754	34766	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016343	TGT	4	34778	34789	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016343	TCT	8	35864	35886	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016343	AGTA	3	37360	37371	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016343	TTG	4	37955	37966	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016343	AGGA	3	38293	38304	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016343	ACT	4	38680	38690	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016343	TAAA	3	39473	39484	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016343	AGGA	3	39659	39670	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016343	AAAAGA	3	39883	39901	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_016343	TATT	4	40304	40319	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016343	TAAA	3	40499	40510	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016343	AGC	4	40523	40533	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016343	TC	6	41290	41300	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016343	CCAC	3	41457	41468	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016343	ATTC	3	41475	41486	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016343	AG	6	41503	41514	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016343	TA	6	41569	41579	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016343	TTC	4	42476	42486	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016343	TAT	4	42802	42814	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016343	TAT	4	43196	43207	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016343	TTCT	3	43358	43368	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016343	AAG	4	43862	43873	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016343	GAAG	3	44418	44428	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016343	CTA	4	44519	44530	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016343	AAG	4	45956	45967	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016343	ATGA	3	47183	47194	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016343	CT	6	47410	47421	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016343	TTCC	3	47766	47776	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016343	CAGA	3	49214	49224	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016343	CT	6	49509	49519	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016343	TTACA	3	49859	49872	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016343	TAG	4	51062	51073	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016343	CTT	4	51325	51337	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016343	AAAGA	3	52080	52094	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016343	TA	8	52745	52760	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016343	AGA	4	54399	54409	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016343	TA	6	54762	54772	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016343	CCTT	3	54896	54907	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016343	AGTG	3	55463	55474	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016343	ATA	4	56322	56332	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016343	TACT	3	56818	56828	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016343	TTAA	3	57762	57773	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016343	CTTT	3	58111	58121	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016343	AGAA	3	58821	58832	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016343	N	100	59287	59386	100	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016343	AAG	4	60522	60532	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016343	TCT	4	60617	60629	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016343	GAAA	3	60965	60977	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016343	AAG	4	61467	61479	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016343	TCT	5	61957	61970	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016343	CTC	5	62375	62388	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016343	CT	6	62439	62449	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016343	ATAG	3	63149	63160	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016343	TAG	4	63815	63826	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016343	AAG	4	63828	63839	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016343	AAAG	3	64048	64058	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016343	AGA	4	64302	64313	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016343	AATT	3	64641	64653	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016343	CTT	5	64952	64965	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016343	TC	6	65061	65071	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016343	AGA	4	65757	65768	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016343	GACAC	3	66447	66460	14	40 %	0 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016343	AGC	4	66486	66496	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016343	TCT	4	66746	66756	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016343	AGA	4	66808	66818	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016343	CTTT	3	66837	66847	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016343	AAGC	3	67225	67235	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016343	AG	6	67536	67546	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016343	CA	6	67558	67568	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016343	AAG	4	67630	67642	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016343	TA	6	67729	67739	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016343	AG	6	67893	67904	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016343	AG	6	68154	68164	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016343	TAG	4	68426	68437	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016343	TCT	5	68443	68458	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016343	TCTT	3	68462	68472	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016343	TTC	5	68525	68539	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016343	ACTT	3	68817	68828	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016343	CA	8	69014	69028	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
130	NC_016343	TAG	4	69254	69265	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016343	AAGA	3	71557	71567	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016343	CGA	4	71870	71881	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016343	GAA	4	71992	72003	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016343	AT	7	73190	73203	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016343	AAG	4	73319	73330	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016343	AAG	4	73343	73354	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016343	GA	6	73683	73693	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016343	TTA	4	74591	74601	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016343	TTCCTT	3	75036	75053	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016343	GAG	4	75118	75129	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016343	GA	6	76010	76020	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016343	AGGG	3	76488	76499	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 75