ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 58

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016342	CTT	4	1504	1515	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016342	CTA	4	1674	1685	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016342	TCT	4	2808	2820	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016342	AGC	4	6779	6790	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016342	TTC	4	10623	10634	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016342	TCT	5	10713	10727	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016342	TTG	4	13603	13613	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016342	TCT	4	14797	14807	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016342	TCT	4	17983	17994	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016342	TAA	4	20057	20069	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016342	GAG	4	22933	22944	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016342	CTT	4	23771	23782	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016342	TCT	5	23915	23929	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016342	CAT	4	25268	25279	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016342	TTA	4	26832	26843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016342	AAG	4	30257	30268	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016342	CTT	4	31556	31567	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016342	TAA	4	32886	32896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016342	TCT	4	39768	39778	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016342	AAG	4	41608	41620	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016342	TCT	4	43008	43018	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016342	AAG	4	43440	43451	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016342	CAA	4	43601	43612	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016342	CCG	4	45709	45719	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016342	CTT	4	47495	47507	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016342	AGG	4	50696	50706	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016342	AGA	4	56440	56451	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016342	GAA	4	56553	56564	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016342	AAG	4	57489	57500	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016342	TTC	4	57625	57636	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016342	GAC	4	57725	57737	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016342	AAG	6	58069	58085	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016342	CTT	4	61449	61460	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016342	TGC	4	61654	61666	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016342	AAG	4	63403	63414	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016342	TTC	4	68071	68083	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016342	AGA	4	68745	68756	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016342	AGG	4	69247	69259	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016342	TCT	4	69266	69277	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016342	CTT	4	70220	70232	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016342	CCA	4	73035	73046	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016342	CTT	4	75657	75667	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016342	CTT	4	77276	77287	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016342	TTG	4	77683	77694	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016342	TAG	4	81347	81358	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016342	CTA	4	81398	81409	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 58