ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 58

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016342	CTTT	3	1303	1314	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016342	CTT	4	1504	1515	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016342	CTA	4	1674	1685	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016342	TCTTA	3	1795	1809	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016342	TCTT	3	2288	2298	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016342	AAGA	3	2756	2767	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016342	TCT	4	2808	2820	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016342	CTTT	3	4080	4090	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016342	GTTT	3	4513	4524	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016342	ATAG	3	5535	5545	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016342	GTAG	4	5794	5808	15	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016342	AGC	4	6779	6790	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016342	TA	7	7984	7996	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016342	ACAAG	3	9457	9470	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016342	TAAG	3	10044	10054	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016342	TTC	4	10623	10634	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016342	TCT	5	10713	10727	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016342	GGGC	3	11153	11163	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016342	CTTT	3	11508	11518	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016342	TG	6	11607	11617	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016342	GGTGG	3	11687	11700	14	0 %	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016342	GAAT	3	11804	11814	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016342	AT	6	12861	12872	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016342	TTG	4	13603	13613	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016342	TTTG	3	14366	14376	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016342	GA	6	14422	14433	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016342	TCT	4	14797	14807	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016342	AGAT	3	17510	17521	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016342	AGAT	3	17841	17853	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016342	TCT	4	17983	17994	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016342	AGACT	3	18042	18055	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016342	TAGT	3	18421	18432	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016342	CT	6	18522	18533	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016342	TC	6	19760	19772	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016342	CT	6	19934	19944	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016342	TAA	4	20057	20069	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016342	AAAG	3	20104	20114	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016342	TC	7	21436	21449	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016342	GAG	4	22933	22944	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016342	CTT	4	23771	23782	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016342	TCT	5	23915	23929	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016342	TTCTTT	3	24190	24207	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
43	NC_016342	GA	6	24423	24433	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016342	CAT	4	25268	25279	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016342	GA	7	25685	25697	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016342	TA	7	26162	26174	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016342	CTTT	4	26473	26487	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016342	GA	7	26586	26599	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016342	TTA	4	26832	26843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016342	TGGA	3	26985	26996	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016342	TA	6	27800	27811	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016342	ACTT	3	29072	29083	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016342	AGAC	3	29420	29431	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016342	AAG	4	30257	30268	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016342	TACAA	3	31188	31201	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016342	TGCT	3	31371	31382	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016342	CTT	4	31556	31567	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016342	TAGA	3	32062	32072	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016342	CTTT	3	32154	32165	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016342	AGTC	3	32259	32270	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016342	TAA	4	32886	32896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016342	GA	6	33079	33090	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016342	GA	6	34099	34109	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016342	TA	6	34204	34215	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016342	GACT	3	34844	34856	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016342	GGGA	3	35538	35548	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016342	TA	6	35776	35787	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016342	TGAA	3	35921	35931	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016342	AT	6	37171	37181	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016342	GCCTT	3	39629	39642	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016342	TCT	4	39768	39778	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016342	GCTT	3	40818	40828	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016342	TTTA	3	40995	41006	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016342	AAG	4	41608	41620	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016342	GTCT	3	41804	41814	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016342	CTTT	3	42135	42145	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016342	CGAA	3	42704	42714	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016342	GA	6	42718	42728	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016342	TCT	4	43008	43018	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016342	GAGGCA	3	43353	43370	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016342	AAG	4	43440	43451	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016342	CAA	4	43601	43612	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016342	AG	6	44387	44397	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016342	GATT	3	45106	45117	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016342	CCG	4	45709	45719	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016342	CT	6	46826	46836	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016342	CTT	4	47495	47507	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016342	AT	6	47508	47519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016342	TA	6	48083	48093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016342	AG	6	48793	48803	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016342	TA	6	49284	49294	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016342	AGG	4	50696	50706	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016342	TAAA	4	51370	51385	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016342	AT	6	52755	52766	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016342	AAAGAA	3	53172	53189	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016342	AT	6	54903	54914	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016342	TA	6	55184	55195	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016342	AT	6	55802	55813	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016342	TACT	3	56102	56113	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016342	AAGAA	4	56237	56256	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_016342	AGA	4	56440	56451	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016342	GAA	4	56553	56564	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016342	GAAA	3	56807	56817	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016342	GA	6	56961	56971	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016342	AGGA	3	56992	57002	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016342	AAG	4	57489	57500	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016342	TTC	4	57625	57636	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016342	GAC	4	57725	57737	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016342	AAG	6	58069	58085	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_016342	TCGT	3	58227	58238	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016342	TA	7	58419	58431	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016342	TATT	3	59269	59280	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016342	GATTA	3	60143	60157	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016342	AGAA	3	60537	60547	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016342	CTT	4	61449	61460	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016342	TGC	4	61654	61666	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016342	AGAA	3	62919	62930	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016342	AAG	4	63403	63414	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016342	AAGG	3	63683	63693	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016342	TC	6	65245	65256	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016342	TTC	4	68071	68083	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016342	AGA	4	68745	68756	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016342	AGG	4	69247	69259	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016342	TCT	4	69266	69277	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016342	N	100	69637	69736	100	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016342	CTT	4	70220	70232	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016342	TAGA	3	70445	70456	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016342	CCA	4	73035	73046	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016342	CTT	4	75657	75667	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016342	CT	7	76747	76760	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016342	TGAC	3	76877	76887	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016342	CTT	4	77276	77287	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016342	TAAGG	4	77622	77640	19	40 %	20 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
134	NC_016342	TTG	4	77683	77694	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016342	GA	7	80364	80376	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016342	GCAA	3	81006	81016	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016342	TAG	4	81347	81358	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016342	CTA	4	81398	81409	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016342	AAGA	3	82222	82232	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016342	A	13	82749	82761	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016342	CCTT	3	82813	82823	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016342	ACCC	3	82850	82861	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016342	TA	6	83227	83238	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016342	GAAA	3	83241	83251	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016342	AAGT	3	83372	83382	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016342	ATGC	3	83383	83393	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016342	TAAT	3	83615	83626	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_016342	AG	6	83906	83916	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016342	ACTA	3	84680	84692	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 58