ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 46

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016341	TCT	4	870	880	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016341	TCT	4	2368	2380	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016341	GAA	4	3542	3554	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016341	TCT	4	5715	5725	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016341	AAG	4	7043	7053	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35796728
6	NC_016341	TCT	4	7572	7582	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35796728
7	NC_016341	CTT	4	9247	9258	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016341	CTT	4	10826	10836	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016341	TCT	4	11764	11774	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016341	CTT	4	12074	12086	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016341	CTC	4	12415	12426	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016341	TCT	4	16027	16037	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016341	AGC	4	16091	16102	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016341	AAG	4	16313	16324	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016341	GAA	4	20875	20887	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016341	GAG	4	24362	24373	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016341	GAG	4	26228	26239	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016341	CTT	4	29488	29498	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016341	CAT	4	29638	29648	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016341	AGA	4	35279	35289	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016341	ACT	4	36232	36243	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016341	CGA	5	36612	36625	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016341	CTC	4	37084	37095	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016341	ACT	4	39756	39767	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016341	AGA	4	39776	39787	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016341	GAA	4	55039	55049	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016341	AGA	4	55343	55354	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016341	AGA	5	59045	59058	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016341	GAG	4	59391	59401	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016341	AAG	4	60062	60072	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016341	GAA	4	61553	61565	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016341	AAG	4	69404	69414	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016341	ACA	4	71705	71716	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016341	AGA	4	73530	73544	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016341	TTC	4	76008	76020	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016341	GAA	4	76503	76514	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016341	AGA	5	93876	93889	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016341	GAA	7	94098	94118	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016341	AGA	4	94202	94213	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016341	TCT	4	95293	95304	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016341	TTC	4	95427	95438	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016341	AAG	4	95486	95497	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 46