ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 46

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016341	GA	8	388	402	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016341	TGAA	3	522	532	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016341	TCT	4	870	880	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016341	TTCTCC	3	1431	1447	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016341	AAAAGA	3	1993	2010	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_016341	TCTT	3	2106	2117	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016341	CTTT	3	2285	2296	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016341	TCT	4	2368	2380	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016341	AAAGAA	3	2702	2719	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_016341	TTCT	3	2728	2739	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016341	CTTT	4	3378	3393	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016341	GAA	4	3542	3554	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016341	TGAA	3	3918	3928	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016341	GA	6	3957	3967	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016341	AG	6	4002	4012	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016341	CTTT	3	4223	4233	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016341	TTTC	3	4835	4846	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016341	TCCT	3	4984	4995	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016341	GAAA	3	5568	5578	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016341	AG	6	5627	5638	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016341	TCT	4	5715	5725	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016341	TC	7	6160	6172	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016341	AAG	4	7043	7053	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35796728
24	NC_016341	TCT	4	7572	7582	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	35796728
25	NC_016341	TTTCTT	3	7808	7825	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	35796728
26	NC_016341	TTTTG	3	8038	8052	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	35796728
27	NC_016341	AAGC	3	8309	8320	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016341	CTT	4	9247	9258	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016341	ATGAG	3	9800	9813	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016341	CTTT	3	10676	10686	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016341	TTTC	3	10715	10725	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016341	CTT	4	10826	10836	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016341	TCTT	3	11160	11171	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016341	GTCT	3	11730	11741	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016341	TCT	4	11764	11774	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016341	TATGG	3	12054	12067	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016341	CTT	4	12074	12086	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016341	CTC	4	12415	12426	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016341	CTTT	3	13142	13152	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016341	TC	6	13854	13864	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016341	GAAA	3	14614	14624	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016341	TCT	4	16027	16037	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016341	AGC	4	16091	16102	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016341	AAG	4	16313	16324	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016341	TGAA	3	16651	16661	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016341	TCTT	3	17398	17409	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016341	TGAA	3	18659	18669	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016341	GA	6	18741	18751	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016341	TGAG	3	19267	19277	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016341	GAA	4	20875	20887	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016341	AT	6	21677	21687	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016341	TGAA	3	22475	22485	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016341	GA	7	22519	22531	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016341	AG	6	22633	22643	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016341	GA	7	23453	23465	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016341	GAG	4	24362	24373	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016341	AG	6	25767	25777	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016341	CG	6	25992	26003	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016341	GAG	4	26228	26239	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016341	AG	6	26935	26945	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016341	CTT	4	29488	29498	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016341	CAT	4	29638	29648	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016341	TCTT	3	30134	30145	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016341	GA	6	30416	30426	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016341	AG	7	30563	30575	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016341	CTTT	4	30894	30909	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016341	GGGTCA	3	31050	31068	19	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
68	NC_016341	GGTA	3	31146	31156	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016341	TA	7	32538	32550	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016341	GA	6	32808	32819	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016341	TTTA	3	33625	33637	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016341	ACCTT	3	34677	34690	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016341	AGA	4	35279	35289	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016341	ACT	4	36232	36243	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016341	TA	7	36532	36545	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016341	CGA	5	36612	36625	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016341	CTC	4	37084	37095	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016341	CTTC	3	37941	37952	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016341	TA	7	38101	38113	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016341	AAAG	3	38134	38145	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016341	TA	6	38584	38595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016341	TA	6	38670	38682	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016341	ACT	4	39756	39767	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016341	AGA	4	39776	39787	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016341	AAAG	3	39972	39983	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016341	AGAA	3	40129	40140	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016341	AAGT	3	41494	41504	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016341	TAGG	3	43126	43136	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016341	TTGA	3	44195	44206	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016341	TGAG	3	44223	44233	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016341	AG	6	44358	44369	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016341	AG	6	45052	45063	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016341	TATG	4	45102	45116	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016341	CTTA	3	46207	46219	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016341	TAGA	3	46302	46314	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016341	TAGA	3	47264	47274	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016341	GGAA	3	47303	47314	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016341	TA	6	47735	47745	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016341	GAAA	3	48308	48320	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016341	AATT	3	48979	48990	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016341	CTTT	7	49065	49092	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
102	NC_016341	GA	6	49218	49229	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016341	AT	6	50103	50114	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016341	CCAG	3	50174	50186	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016341	CTAG	4	50810	50825	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016341	GAGT	3	51313	51324	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016341	CTTT	4	52101	52116	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016341	TCTT	3	52148	52158	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016341	AAGA	3	52182	52193	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016341	AGAA	3	52307	52317	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016341	AGAA	3	52830	52840	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016341	TC	7	53020	53033	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016341	CTTT	3	53661	53672	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016341	TTCTT	3	54220	54234	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016341	GA	7	54401	54413	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016341	CG	6	54485	54496	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016341	AAAG	3	54580	54590	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016341	TA	8	55022	55036	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016341	GAA	4	55039	55049	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016341	AGGAA	3	55106	55119	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016341	CAGG	3	55168	55179	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016341	AGA	4	55343	55354	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016341	GAAA	3	55483	55494	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016341	AAAG	3	55565	55576	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016341	CAAT	3	55674	55684	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016341	AT	7	55692	55705	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016341	AAAG	3	56150	56161	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016341	AAAG	3	56339	56350	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016341	CTTT	3	58285	58296	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016341	AC	6	58849	58860	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016341	AGA	5	59045	59058	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016341	GAG	4	59391	59401	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016341	AAG	4	60062	60072	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016341	AGAA	3	60622	60633	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016341	CGAG	3	61330	61342	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016341	GA	6	61443	61453	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016341	TGAA	3	61486	61496	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016341	GAA	4	61553	61565	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016341	ATTTT	3	63393	63407	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016341	AAAG	3	64272	64282	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016341	TC	6	64575	64585	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016341	AAAG	3	65131	65143	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_016341	GA	7	65177	65189	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 46