ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016330	AGA	4	1019	1029	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016330	AT	6	1557	1567	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016330	TA	6	2626	2637	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016330	GAGG	3	2803	2814	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016330	AAG	4	3530	3541	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016330	GAAA	3	3735	3746	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016330	AAG	4	3797	3808	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016330	AAG	4	3860	3871	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016330	TA	6	4041	4051	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016330	CAG	4	4312	4323	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016330	CCCTT	3	7086	7101	16	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016330	AT	6	7514	7525	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016330	CTA	4	8738	8749	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016330	AAG	4	8970	8982	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016330	AAG	4	9306	9317	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016330	AAG	4	10404	10415	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016330	TC	7	10947	10959	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016330	GAA	4	11184	11195	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016330	AAG	4	11876	11886	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016330	GAA	4	11944	11956	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016330	TTCC	3	12139	12150	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016330	AAG	4	12266	12277	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016330	CTC	4	12350	12360	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016330	TA	6	12501	12512	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016330	AT	6	12656	12667	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016330	CCTT	3	13014	13025	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016330	AAG	4	13125	13136	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016330	TC	7	13584	13596	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016330	AGA	4	13830	13841	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016330	TA	6	14234	14245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016330	AGA	4	15717	15728	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016330	CT	6	15795	15805	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016330	TCCT	3	15838	15849	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016330	CCT	4	15894	15904	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016330	GGAG	3	16443	16453	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016330	AAAGAA	3	17382	17400	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
37	NC_016330	CTA	4	17993	18003	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016330	AT	6	18029	18040	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016330	CT	6	18100	18110	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016330	TCC	4	18187	18198	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016330	CTTT	3	18922	18934	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016330	GCCT	3	19516	19526	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016330	TCTT	3	19684	19695	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016330	AG	6	20347	20357	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016330	TCCTCT	3	21917	21933	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
46	NC_016330	TC	6	22342	22352	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016330	CCT	4	22590	22600	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016330	AAGA	3	22880	22890	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016330	TA	6	22912	22923	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016330	TCT	4	23087	23099	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016330	TC	6	23172	23182	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016330	TC	7	23310	23322	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016330	CTT	4	24292	24302	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016330	AT	7	24613	24626	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016330	TTGT	3	25855	25865	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016330	TTGA	3	27700	27710	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016330	AT	6	28003	28014	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016330	GTTA	3	29517	29528	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016330	AAAG	3	29593	29603	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016330	CTCTTT	3	29823	29839	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
61	NC_016330	AGT	4	29912	29922	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016330	GTCT	3	30199	30209	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016330	TACT	3	30213	30225	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016330	TA	6	30557	30567	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016330	AAAAG	4	31115	31135	21	80 %	0 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016330	AGA	4	31465	31477	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016330	GAAA	3	31498	31509	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016330	GAAA	3	31923	31934	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016330	AAGCAG	3	32183	32201	19	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
70	NC_016330	CTTT	3	35765	35775	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016330	CTT	4	35993	36004	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016330	CT	6	36095	36105	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016330	TAGT	3	36664	36675	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016330	TCT	4	36699	36710	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016330	TAAA	3	36998	37009	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016330	GTTA	3	37237	37248	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016330	CAAG	3	37403	37414	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016330	CT	9	38383	38399	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016330	GA	6	38775	38785	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016330	GAAAG	3	38799	38813	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016330	CTT	4	38863	38873	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016330	AT	6	39007	39018	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016330	GAA	4	39198	39210	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016330	CTTGT	3	39621	39635	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016330	CTTT	3	39811	39822	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016330	CTC	4	39900	39910	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016330	CCT	4	40218	40229	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016330	TCCT	3	40386	40397	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016330	CCT	4	41741	41751	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016330	TCT	4	42175	42186	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016330	CT	6	42694	42704	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016330	AGA	4	44567	44578	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016330	TA	8	44775	44790	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016330	CTAC	3	45356	45367	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016330	AAG	4	45641	45651	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016330	GAAA	3	46086	46098	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016330	AAG	4	46587	46599	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016330	CTC	5	47449	47462	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016330	CT	6	47510	47520	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016330	CTTC	3	48179	48189	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016330	TCT	4	49617	49628	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016330	TTA	4	49829	49839	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016330	ATA	4	50007	50019	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016330	AAGG	3	50252	50262	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016330	AAGT	3	50320	50330	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016330	CTTT	3	50672	50682	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016330	ACT	6	50896	50913	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016330	CTT	4	51601	51613	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016330	TCTATT	3	51816	51834	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
110	NC_016330	GCG	4	53665	53676	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016330	CTT	4	54121	54133	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016330	CAA	4	54288	54298	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016330	TA	8	56335	56349	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016330	CTTA	3	56400	56411	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016330	AGA	4	57646	57657	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016330	AAG	4	57762	57773	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016330	GGA	4	57847	57857	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016330	CCTT	3	58533	58543	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016330	AAAG	3	58971	58982	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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