ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 96

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016327	CT	8	112	127	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016327	TTC	4	1847	1859	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016327	GA	6	1971	1982	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016327	AAAAGA	3	2611	2628	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016327	TC	6	2929	2939	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016327	CCT	4	3107	3117	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016327	TCTT	3	3655	3666	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016327	TA	6	3863	3873	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016327	CTCA	3	4450	4460	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016327	CT	7	4661	4673	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016327	TC	6	4751	4761	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016327	AGAAA	3	5271	5284	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016327	AAGA	3	5819	5830	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016327	AACA	3	6267	6278	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016327	CTT	4	8482	8493	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016327	TTTCTA	3	9149	9165	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
17	NC_016327	AG	6	9280	9291	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016327	CT	6	9647	9657	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016327	TC	6	10219	10229	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016327	AAAAGA	3	10816	10833	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016327	GA	6	11270	11281	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016327	TC	6	11394	11404	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016327	CTCTT	3	11442	11456	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016327	AGAATA	3	12371	12388	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_016327	TCT	5	12496	12509	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016327	CTTTA	3	12990	13004	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016327	CCT	4	13156	13166	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016327	AAAGAA	3	13227	13245	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_016327	CG	6	13388	13399	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016327	AGA	4	13416	13426	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016327	AG	6	13496	13507	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016327	TTCTAT	3	13640	13657	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016327	TG	6	13665	13676	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016327	TTCT	3	13813	13823	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016327	CT	6	14285	14297	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016327	CT	6	15667	15677	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016327	CTT	4	16052	16063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016327	ATTG	3	16465	16476	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016327	TC	6	16695	16705	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016327	AGA	4	17566	17577	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016327	AGA	4	17712	17723	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016327	AG	6	18118	18128	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016327	TCTT	4	18260	18274	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016327	GGA	4	18905	18916	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016327	GAGG	3	18986	18997	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016327	CTTT	3	19124	19135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016327	CCT	4	19443	19454	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016327	CTC	4	19617	19628	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016327	TCTCCT	3	19760	19776	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
50	NC_016327	CACC	3	19932	19942	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016327	TC	6	21804	21814	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016327	TC	6	22381	22392	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016327	TC	8	22547	22561	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016327	CCCA	3	22562	22572	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016327	GA	6	24088	24098	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016327	GAAAG	3	24112	24126	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016327	GA	6	24147	24157	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016327	CCTC	3	24710	24721	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016327	TC	6	25098	25108	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016327	TCTCC	3	25190	25204	15	0 %	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016327	TC	6	25466	25476	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016327	CCT	4	25479	25489	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016327	CCT	4	25623	25634	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016327	TC	6	26115	26125	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016327	TC	7	26560	26572	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016327	GATT	3	27607	27618	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016327	TA	6	28101	28111	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016327	CCAA	3	28138	28148	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016327	TTTTCT	3	28492	28510	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
70	NC_016327	TTTTTC	3	29343	29361	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
71	NC_016327	AAAG	3	30303	30314	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016327	TTC	4	30617	30627	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016327	TCT	4	33124	33134	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016327	AGA	4	33204	33216	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016327	CTTT	3	34684	34695	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016327	TA	10	34771	34790	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
77	NC_016327	CTAT	3	35846	35856	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016327	TA	7	36279	36291	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016327	AGA	4	36800	36811	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016327	GTAT	3	37289	37301	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016327	TTTC	3	37756	37767	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016327	AT	6	37911	37922	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016327	TGAA	3	38044	38054	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016327	GA	6	38113	38123	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016327	AAGGA	3	38566	38581	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016327	TA	7	38701	38714	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016327	TTC	4	38942	38954	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016327	AG	7	39153	39165	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016327	AGA	4	39657	39667	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016327	CTT	4	39781	39792	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016327	TGT	4	40031	40043	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016327	CTTT	3	40274	40286	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016327	GACT	3	40374	40384	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016327	GA	7	41674	41686	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016327	AGG	4	42692	42703	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016327	TC	6	42883	42893	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016327	TAG	6	42928	42946	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
98	NC_016327	TAGA	3	42956	42966	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016327	TA	7	44297	44309	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016327	CT	8	44805	44819	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016327	AAG	4	45271	45281	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016327	ACC	4	45288	45300	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016327	TCT	4	45304	45315	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016327	CTCG	3	45633	45644	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016327	TTCG	3	45698	45709	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016327	AAG	4	45974	45985	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016327	GGAA	3	46124	46134	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016327	AGA	4	46218	46228	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016327	TTCT	3	46528	46538	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016327	CTTTTT	3	46805	46822	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
111	NC_016327	CAT	4	47167	47177	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016327	AGA	4	47618	47629	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016327	TA	6	48270	48283	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016327	TGAA	3	49061	49073	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016327	GCC	4	49665	49675	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016327	GAAA	3	50238	50248	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016327	TC	6	50831	50841	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016327	ATACT	3	51474	51487	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016327	GAA	4	51696	51707	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016327	AGAA	3	51866	51877	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016327	GAAA	3	52432	52443	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016327	TA	6	53084	53094	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016327	CCT	4	54024	54035	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016327	ATCG	3	54749	54760	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016327	TC	6	55476	55486	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016327	AT	6	56857	56868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016327	AAAG	3	57208	57219	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016327	AAGT	3	57245	57255	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016327	TCTT	3	57301	57311	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016327	GAGAGG	3	58077	58095	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_016327	GACT	3	58369	58380	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016327	AGAA	3	58735	58746	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016327	AGAC	3	58945	58955	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016327	AAG	4	59035	59045	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016327	GTCT	3	61134	61144	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016327	TTTGC	3	62029	62042	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016327	CTC	4	62145	62155	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016327	AAGGAG	3	62339	62355	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
139	NC_016327	CG	6	62975	62986	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016327	AAAG	3	63040	63051	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016327	TTGACT	3	63202	63220	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
142	NC_016327	ACAA	3	63369	63379	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016327	GAAA	3	64064	64075	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016327	AGA	4	64106	64117	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016327	CCT	4	64303	64313	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 96