ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016326	CGT	4	414	425	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016326	CTT	4	612	623	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016326	TCTT	3	793	804	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016326	TACT	3	1298	1310	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016326	AG	6	1674	1684	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016326	AG	7	1877	1889	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016326	CTTT	3	2024	2035	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016326	AG	6	2428	2438	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016326	TTAT	3	2632	2643	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016326	AG	6	2966	2976	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016326	GA	6	3373	3384	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016326	AAG	4	3434	3445	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016326	CTT	4	4679	4691	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016326	CTT	4	5060	5072	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016326	TCTCT	3	5602	5615	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016326	CTT	4	5923	5935	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016326	AG	7	6269	6281	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016326	AAG	4	6860	6871	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016326	AAGA	3	6964	6976	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016326	CATTCT	3	8188	8205	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016326	GAG	4	8667	8677	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016326	ATAG	3	8745	8755	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016326	GA	7	8938	8950	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016326	GAAAG	3	8959	8973	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016326	TGGA	3	8992	9003	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016326	GA	8	9110	9124	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016326	TCT	4	9607	9618	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016326	CTTT	3	9884	9895	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016326	GAAA	3	9941	9953	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016326	TCCG	3	9983	9994	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016326	AAGG	3	10440	10451	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016326	GA	7	10859	10871	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016326	CTTA	3	10923	10935	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016326	TTCT	3	11037	11047	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016326	AGAAAA	3	12039	12056	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016326	CTT	5	12532	12545	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016326	AT	6	13278	13289	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016326	AGA	5	14754	14768	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016326	TA	6	15113	15124	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016326	CT	6	15267	15278	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016326	TA	6	16593	16603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016326	CA	6	16669	16679	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016326	AGT	4	16760	16770	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016326	CTT	4	17041	17051	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016326	AGAA	4	18940	18954	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016326	GAAC	3	19041	19052	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016326	AAT	4	20042	20052	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016326	AT	8	20422	20437	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016326	AAATT	3	21728	21741	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016326	AGTT	3	22142	22153	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016326	CTA	4	22570	22580	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016326	TA	6	22886	22896	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016326	CTA	4	23228	23238	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016326	CTGT	3	23304	23314	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016326	CTT	4	23723	23733	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016326	GTA	4	24309	24320	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016326	TCA	4	24322	24333	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016326	AGTC	3	24404	24415	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016326	CT	6	24441	24453	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016326	ATTA	3	24545	24556	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016326	CTT	5	25255	25268	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016326	AAGA	3	25893	25905	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016326	CGTT	3	25943	25953	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016326	TCT	4	26203	26214	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016326	ACT	4	26209	26220	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016326	AAAG	3	28263	28273	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016326	TAAA	4	28429	28444	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016326	CTTT	3	29236	29247	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016326	CTTTG	3	29341	29354	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016326	AGA	4	29678	29689	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016326	AG	6	29930	29941	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016326	CT	6	30182	30192	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016326	CG	6	30348	30359	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016326	CT	6	30399	30410	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016326	AAGA	3	33642	33653	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016326	GAAAG	3	35055	35069	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016326	TTTCT	4	35807	35826	20	0 %	80 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
78	NC_016326	CCTTTT	3	35851	35868	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016326	CTTT	3	35933	35943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016326	CTT	4	36271	36281	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016326	TTC	4	37812	37822	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016326	TTC	4	37943	37954	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016326	CTT	4	37978	37989	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016326	CTT	4	38002	38013	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016326	AAGGA	3	38933	38948	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016326	GTAT	3	39613	39623	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016326	AG	6	39675	39687	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016326	AAG	4	40451	40461	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016326	CTT	4	40731	40742	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016326	TAGG	3	41464	41476	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016326	GA	7	41493	41505	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016326	TA	6	42040	42051	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016326	TCT	4	42290	42301	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016326	GA	6	42422	42432	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016326	TTTC	3	42589	42600	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016326	CTT	4	42690	42701	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016326	TGAA	3	42934	42944	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016326	AGGA	3	43022	43033	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016326	TTTC	3	44046	44057	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016326	CTT	4	44119	44130	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016326	TCT	4	44157	44168	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016326	CAC	4	44253	44264	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016326	GGAAT	3	44732	44745	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016326	CTT	4	44943	44953	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016326	TACT	3	45748	45758	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016326	TC	6	45981	45991	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016326	AATC	3	46087	46098	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016326	AGA	4	46213	46224	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016326	TCT	4	46456	46466	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016326	TAAT	4	46830	46845	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016326	TTC	4	47487	47497	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016326	ACT	4	47996	48007	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016326	TG	6	48008	48018	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016326	TCTT	3	48363	48374	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016326	CCG	4	49329	49339	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016326	CTT	4	50407	50417	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016326	TGAA	3	50758	50768	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016326	AAGG	3	51392	51402	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016326	CTT	5	52679	52693	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016326	GA	7	52979	52992	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016326	GAAA	3	53136	53147	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016326	AGG	4	53360	53371	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016326	TCT	4	53609	53620	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016326	GTTT	3	53933	53945	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016326	GGA	4	54235	54246	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016326	AGGAG	3	54483	54498	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016326	TCT	4	54627	54637	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016326	CTT	5	54688	54702	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding

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