ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 61

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016325	ACTTA	3	587	600	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016325	CT	7	696	708	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016325	CAG	4	751	762	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016325	AAGA	4	1618	1633	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016325	TAGA	3	2590	2601	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016325	AAG	4	3579	3590	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016325	AAAG	3	3715	3726	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016325	AAGA	3	4161	4172	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016325	GAA	4	4852	4862	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016325	AG	8	5591	5605	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016325	GAA	4	6104	6114	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016325	GAAA	3	6253	6264	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016325	TCTT	3	6378	6389	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016325	CAG	4	6397	6408	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016325	TTAT	3	6684	6695	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016325	AAAGA	3	7283	7297	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016325	AT	6	7901	7912	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016325	AATGT	3	8654	8667	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016325	TA	6	9191	9202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016325	TTCT	3	9613	9623	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016325	TGAA	3	9826	9836	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016325	GAGGA	3	9923	9938	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016325	TCCT	3	10294	10305	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016325	TCT	4	12689	12701	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016325	TTTA	3	12917	12928	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016325	TGAA	3	13280	13290	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016325	AGCT	3	13504	13514	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016325	GTA	4	14647	14658	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016325	AG	6	14790	14800	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016325	TAG	4	15628	15639	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016325	AG	6	16276	16287	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016325	TCTG	3	17077	17089	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016325	CTTT	4	17390	17406	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016325	TCTCCT	3	18106	18122	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016325	AG	6	19476	19487	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016325	TC	6	20426	20436	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016325	ATC	4	21977	21988	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016325	CTTTT	4	22428	22447	20	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
39	NC_016325	GC	6	22729	22739	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016325	GGCT	3	23179	23189	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016325	GAAA	3	23406	23416	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016325	AG	6	23440	23451	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016325	TGA	4	23544	23554	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016325	GTCT	3	24264	24274	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016325	TA	6	24636	24646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016325	GAA	4	25863	25873	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016325	AAAG	3	25927	25938	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016325	CTTT	3	26107	26118	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016325	TAC	4	26248	26259	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016325	AAG	4	27546	27558	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016325	TTCG	3	29603	29613	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016325	AAGA	3	30315	30325	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016325	CG	7	31510	31523	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016325	CCT	4	32181	32192	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016325	AAAGAA	3	33505	33522	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016325	CCTT	3	33825	33836	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016325	AT	6	34170	34181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016325	ACTT	3	34309	34320	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016325	TC	6	35228	35239	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016325	GTT	4	37062	37073	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016325	CTT	4	37081	37093	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016325	AT	6	37094	37105	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016325	AAGG	3	37754	37764	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016325	CA	6	38765	38776	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016325	AAAG	3	38779	38789	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016325	TCCT	3	39383	39394	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016325	CT	6	39726	39736	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016325	TTCA	3	40036	40047	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016325	GCAA	3	40089	40100	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016325	CTT	4	40631	40642	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016325	TGCT	3	41479	41490	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016325	ACTT	3	42895	42906	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016325	GAT	4	42991	43001	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016325	CTC	4	43530	43541	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016325	TC	6	44057	44067	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016325	CTTT	3	44631	44643	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016325	CTAG	3	45425	45435	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016325	AAG	5	46238	46252	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016325	TCTT	3	47288	47299	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016325	AGA	4	47517	47529	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016325	AT	6	47904	47915	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016325	CTA	4	49683	49694	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016325	GTA	4	50179	50191	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016325	CA	6	50309	50319	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016325	AGAA	3	51089	51100	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016325	TC	6	51460	51471	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016325	TA	6	51610	51620	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016325	TTTC	3	51656	51666	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016325	TAGA	3	52106	52117	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016325	TTC	4	54565	54576	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016325	AT	6	54708	54721	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016325	GTA	4	54785	54795	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016325	CT	7	55330	55343	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016325	TAC	4	55505	55515	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016325	CTA	4	56228	56238	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016325	TCT	4	57271	57281	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016325	TA	8	57527	57541	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016325	TCT	4	57895	57907	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016325	TATC	3	57954	57965	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016325	CTTT	3	58647	58657	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016325	TC	6	58708	58719	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016325	CTT	4	58898	58909	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016325	ACT	4	59910	59920	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016325	CTTT	3	61049	61059	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016325	TA	6	61502	61512	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016325	GAAA	3	62100	62110	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016325	TTAT	3	62186	62197	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016325	TCT	4	62774	62784	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016325	TA	6	63400	63411	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016325	ATC	4	63431	63442	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016325	TCT	4	63507	63518	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016325	GTAT	3	64583	64595	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016325	GAA	4	65077	65089	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016325	GAT	4	65940	65950	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016325	AAAC	3	66768	66778	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016325	AGA	4	66840	66852	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016325	GCTA	3	67051	67063	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016325	CTT	4	67091	67103	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016325	GAAA	3	67586	67596	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016325	AAG	4	67830	67841	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016325	CTT	4	68403	68413	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016325	CTT	4	68440	68452	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016325	TTAC	3	68464	68475	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016325	AAAG	3	68795	68805	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016325	AGA	4	69629	69639	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016325	TCT	4	70175	70187	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016325	CTT	5	70206	70219	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35796727
128	NC_016325	CCT	4	71530	71540	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016325	CTTT	3	72560	72571	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35796727
130	NC_016325	TCTT	3	73053	73064	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016325	AGAC	3	73204	73214	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016325	TTTC	3	74474	74484	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016325	AAG	4	75484	75495	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016325	TC	6	76932	76942	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016325	CTT	4	77029	77040	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016325	TA	6	77210	77221	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016325	CTT	4	77336	77346	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016325	GA	6	78426	78436	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016325	TTC	6	79162	79179	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016325	CAA	4	79560	79571	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016325	GGA	4	79944	79955	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016325	CTTT	3	80082	80092	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016325	TC	6	80116	80126	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016325	TA	6	80223	80234	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016325	AAC	4	81631	81641	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016325	AGGG	3	82352	82363	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 61