ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 118

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016324	CTT	6	613	630	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016324	CTT	4	1569	1580	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016324	CTG	4	1617	1628	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016324	AAAGA	3	2015	2030	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016324	AG	6	2244	2255	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016324	AGC	4	2265	2275	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016324	CTT	4	2502	2512	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016324	CTT	4	2895	2905	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016324	CTT	4	3140	3151	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016324	TA	7	3395	3408	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016324	AG	6	3727	3738	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016324	TC	6	3837	3847	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016324	TAAA	3	4613	4624	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016324	AG	6	5126	5136	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016324	ACTT	3	6108	6119	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016324	TAG	4	6266	6276	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016324	GAA	4	6820	6831	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016324	CTTT	3	6867	6878	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016324	TCTT	3	9635	9645	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016324	AGAAAA	3	9757	9774	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016324	TA	7	10621	10634	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016324	TAAG	3	11163	11174	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016324	TTC	4	12472	12483	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016324	TA	6	12797	12807	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016324	TA	6	13346	13356	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016324	CTTT	3	14182	14192	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016324	AGAA	3	15644	15655	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016324	TTCG	3	15674	15684	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016324	CTA	4	16859	16871	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016324	TA	6	17369	17379	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016324	CT	6	17483	17493	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016324	CA	6	17950	17961	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016324	TA	7	18572	18585	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016324	CAG	4	19529	19539	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016324	TACT	5	21191	21209	19	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016324	TAAG	3	22486	22496	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016324	TCT	4	22535	22547	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016324	AAGA	3	22605	22616	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016324	TTTAC	3	22648	22662	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016324	GA	8	23900	23914	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016324	GAAAG	3	23954	23968	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016324	AG	6	23984	23994	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016324	GAAA	3	24368	24380	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016324	TA	6	24675	24685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016324	GAAA	3	25244	25255	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016324	CTT	4	25345	25355	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016324	CA	7	25389	25401	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016324	GA	6	26581	26591	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016324	GC	6	26678	26689	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016324	AAAG	3	26774	26786	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016324	GA	6	28204	28214	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016324	AAAG	3	28483	28494	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016324	GAT	4	28916	28927	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016324	ACCC	3	29499	29509	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016324	AATCA	3	29554	29569	16	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016324	GAG	4	29818	29829	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016324	AGA	4	29931	29941	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016324	TA	6	30150	30161	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016324	GAA	4	30188	30198	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016324	AAGA	3	30203	30213	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016324	CTT	4	31289	31300	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016324	GA	6	32808	32818	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016324	TA	6	33716	33727	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016324	TGAA	3	34163	34173	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016324	CTTG	3	34713	34723	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016324	ATTC	3	34908	34918	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016324	TA	10	35561	35580	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_016324	TA	6	36204	36214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016324	AACG	3	36624	36635	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016324	TGCT	3	37906	37917	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016324	AAGT	3	38323	38333	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016324	AAG	4	38347	38358	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016324	GA	6	38374	38384	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016324	TGAA	3	38878	38888	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016324	GAA	4	39147	39159	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016324	TA	7	39220	39233	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016324	TA	6	39275	39286	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016324	GGA	4	39624	39634	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016324	GA	6	39642	39652	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016324	CTA	4	40361	40371	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016324	AGAA	3	40570	40580	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016324	TAAG	3	40692	40702	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016324	AAGA	4	40724	40740	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016324	AGA	4	40849	40860	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016324	AT	6	40878	40889	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016324	GA	6	41087	41097	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016324	AAG	4	41185	41195	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016324	AAGG	3	42204	42214	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016324	AG	6	43806	43816	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016324	GA	6	44635	44645	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016324	ATTC	3	45321	45331	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016324	TA	6	45333	45344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016324	CTTT	4	45748	45763	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016324	AAGAA	4	45882	45901	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
95	NC_016324	TCT	4	45964	45975	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016324	TA	6	46523	46534	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016324	TCCT	3	46849	46860	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016324	AAAG	3	47058	47070	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016324	GA	7	47851	47864	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016324	GAG	4	47962	47972	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016324	CAAA	3	48479	48489	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016324	AAAG	3	48679	48689	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016324	CTT	4	48902	48913	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016324	AAG	4	49495	49506	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016324	CTTT	3	50874	50885	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016324	AAG	4	51437	51448	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016324	ACTT	3	51457	51468	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016324	AGC	4	51685	51696	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016324	GAA	4	51940	51951	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016324	AAGAA	4	52333	52351	19	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
111	NC_016324	AAG	5	52380	52394	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016324	AAG	5	52416	52430	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016324	AAGA	3	52900	52910	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016324	GAA	4	52946	52956	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016324	AGC	4	53562	53572	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016324	TCT	4	54227	54238	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016324	CT	6	54578	54588	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016324	GAA	5	55144	55158	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016324	AGC	4	55475	55486	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016324	GA	7	55765	55777	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016324	AG	6	56250	56260	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016324	GA	6	56365	56375	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016324	AAAG	3	56915	56926	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016324	CTTTT	3	57464	57479	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016324	GAG	4	57629	57640	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016324	GCTTCT	3	58140	58157	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
127	NC_016324	CCTT	3	58336	58347	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016324	CTT	4	58399	58410	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 118