ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 97

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016323	GCCT	3	21	31	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016323	TAC	4	62	72	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016323	CTTA	3	1090	1102	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016323	TAC	4	1305	1316	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016323	TAG	4	1311	1322	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016323	TA	6	1938	1948	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016323	CT	6	2444	2455	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016323	TA	7	3047	3059	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016323	CTT	4	3226	3236	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016323	TA	6	3357	3367	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016323	TC	6	3817	3827	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016323	TC	8	3929	3943	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016323	AT	6	4039	4050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016323	TCTTT	3	4288	4302	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016323	GAA	4	4559	4569	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016323	AAG	4	5374	5385	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016323	AT	6	6318	6329	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016323	TTC	4	6655	6666	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016323	AT	6	6777	6787	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016323	TCT	4	6896	6906	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016323	CCCT	3	7352	7363	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016323	CTCTT	3	7719	7733	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016323	TCTGCT	3	8143	8160	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
24	NC_016323	TTG	4	8315	8326	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016323	AGG	4	8602	8612	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016323	TC	6	8882	8892	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016323	TCTT	3	9722	9733	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016323	AG	6	9918	9928	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016323	GGAGC	3	9999	10012	14	20 %	0 %	60 %	20 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016323	CTT	4	10469	10480	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016323	AAG	4	10848	10858	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016323	TTTG	3	11142	11152	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016323	CTT	4	12133	12144	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016323	ATA	4	12818	12829	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016323	GAAA	3	12857	12867	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016323	CTT	4	13795	13805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016323	CAT	4	13848	13859	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016323	GTA	4	15442	15452	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016323	TTA	5	15954	15967	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016323	AG	7	16248	16260	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016323	ACGC	3	16449	16460	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016323	CTT	5	16638	16651	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016323	CAAG	3	17157	17169	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016323	TA	7	17755	17768	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016323	TA	7	18200	18213	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016323	GTCA	3	18688	18699	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016323	TA	8	19062	19077	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016323	TA	6	19491	19502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016323	AGGAG	3	20275	20288	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016323	TA	10	20917	20935	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
51	NC_016323	TCT	4	20985	20996	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016323	TA	6	21150	21161	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016323	ACGAGA	3	21245	21262	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016323	TCT	4	21971	21982	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016323	CTT	5	23208	23221	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016323	CTT	4	23657	23668	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016323	TA	6	23896	23907	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016323	TTC	4	24402	24413	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016323	CTT	4	24705	24716	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016323	AAGA	3	24806	24817	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016323	CT	6	25083	25093	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016323	CTT	4	25313	25324	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016323	GATC	3	25409	25419	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016323	AGAAAA	3	25972	25990	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016323	CTC	4	27727	27738	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016323	TGAA	3	27814	27824	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016323	CTT	4	28139	28149	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016323	CTT	4	29188	29199	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016323	TA	7	29279	29291	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016323	GAATG	4	29635	29653	19	40 %	20 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
71	NC_016323	TCT	4	29722	29733	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016323	TC	6	29874	29884	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016323	CT	6	29921	29934	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016323	TCT	4	29955	29965	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016323	TAGC	3	31100	31110	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016323	TA	7	31289	31302	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016323	GA	6	31339	31349	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016323	CT	7	32356	32368	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016323	CTTT	4	33060	33075	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016323	CT	6	33834	33845	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016323	AAG	5	33984	33998	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016323	TTC	4	34513	34524	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016323	AAAGA	3	35292	35306	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016323	TTC	4	35377	35388	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016323	CAAG	3	35686	35698	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016323	GGA	4	36089	36100	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016323	AG	6	36596	36607	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016323	CT	6	36839	36849	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016323	TC	6	36869	36879	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016323	TA	6	37133	37144	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016323	AGA	4	37166	37176	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016323	AAGC	3	37415	37426	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016323	AGA	4	38468	38478	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016323	CTC	4	38660	38670	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016323	GGA	4	39394	39405	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016323	GAG	4	39433	39444	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016323	GAAA	3	40177	40187	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016323	CAA	4	40252	40263	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016323	TA	7	40891	40904	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016323	TGCC	3	41193	41204	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016323	AGC	4	42450	42460	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016323	ACTCT	3	43283	43297	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016323	TA	6	45155	45166	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016323	AAG	4	45206	45217	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016323	ATGG	3	45860	45871	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016323	CCCTCT	3	46092	46109	18	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
107	NC_016323	TCTT	3	46303	46313	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016323	TCT	4	47440	47451	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016323	TAC	4	47813	47823	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016323	TA	7	48371	48383	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016323	GGAGG	3	48590	48603	14	20 %	0 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016323	AAGAA	3	48768	48781	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016323	TCTT	3	49882	49893	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016323	AG	6	50512	50522	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016323	AAGA	3	50587	50598	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016323	AAGA	3	51399	51411	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016323	CTA	5	51457	51471	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016323	CTA	4	51987	51998	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016323	AAAG	3	53104	53115	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016323	CT	6	53263	53274	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016323	TCT	4	53519	53531	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016323	TA	7	53793	53805	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016323	AG	6	54024	54035	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016323	TAC	4	54435	54447	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016323	AAAGAT	3	55429	55447	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
126	NC_016323	TCT	4	59780	59791	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016323	GCC	4	60028	60038	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016323	CTT	4	60182	60192	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016323	CTTA	3	60476	60487	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016323	TCT	4	60991	61001	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016323	AGA	4	61325	61336	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016323	TTTA	3	62656	62667	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016323	AAAG	3	62722	62733	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016323	CT	7	64137	64149	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016323	AAGC	3	64550	64560	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016323	ACT	4	64681	64691	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016323	CTTT	3	64921	64932	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016323	TC	6	65258	65268	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016323	TA	6	65675	65685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016323	GTCT	3	65783	65794	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016323	AAG	4	65838	65850	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 97