ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016321	GGT	4	539	550	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016321	TA	6	642	653	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016321	GTA	4	844	856	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016321	TA	7	1449	1461	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016321	AAAG	3	2787	2797	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016321	CTTT	3	3612	3622	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016321	AGAA	3	3865	3876	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016321	AG	6	3951	3961	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016321	CAG	4	4047	4058	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016321	TCT	4	4562	4574	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016321	CTT	5	4593	4606	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35796727
12	NC_016321	GAA	4	5647	5658	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016321	TCCTCT	3	6267	6285	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
14	NC_016321	TC	6	6305	6315	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016321	CTTT	3	7525	7536	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35796727
16	NC_016321	AT	6	7980	7991	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016321	TTC	4	9094	9105	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016321	TC	7	9284	9296	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016321	AAGA	3	9501	9512	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016321	AAAG	3	10258	10269	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016321	TCAG	3	10837	10849	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016321	AT	6	11069	11080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016321	TCT	4	11226	11236	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016321	AAG	4	11664	11675	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016321	CTC	4	12141	12151	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016321	CAG	4	12426	12437	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016321	CT	6	12607	12618	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016321	C	12	12648	12659	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016321	TTC	4	12885	12896	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016321	AAG	4	13436	13447	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016321	ACG	4	13805	13815	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016321	CT	6	16868	16879	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016321	AAG	4	17000	17011	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016321	AG	7	17637	17650	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016321	GA	6	17763	17773	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016321	TTC	4	17846	17856	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016321	AGA	4	18299	18310	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016321	AAGGGC	3	18649	18666	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
39	NC_016321	AGA	4	18730	18741	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016321	CT	7	19004	19016	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016321	CTT	4	19155	19165	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016321	TTCTT	3	19580	19594	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016321	TA	6	20645	20656	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016321	CTT	4	21422	21433	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016321	CAGA	3	22461	22471	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016321	TG	6	23981	23991	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016321	TC	6	24326	24337	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016321	TA	7	24801	24814	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016321	TCTT	3	24817	24829	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016321	GAA	4	25011	25022	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016321	AAG	4	25050	25060	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016321	CTT	4	25247	25257	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016321	TA	6	25674	25684	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016321	AAAG	4	25726	25742	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016321	TAG	4	26281	26295	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016321	TAAG	3	26306	26316	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016321	CTTT	3	27085	27095	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016321	ACTGGG	3	28278	28295	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
59	NC_016321	TA	6	28802	28812	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016321	AAG	5	29120	29134	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016321	AGTA	3	29187	29199	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016321	AGT	4	29208	29218	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016321	TAA	4	30184	30194	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016321	GCTT	3	30332	30343	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016321	TAAA	3	31673	31684	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016321	TC	6	32305	32316	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016321	CAGA	3	32436	32446	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016321	AGC	4	32822	32833	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016321	CATA	3	33145	33155	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016321	CTT	4	33428	33439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016321	TA	10	33716	33736	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016321	AAAG	3	34569	34579	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016321	AG	6	34915	34925	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016321	TA	6	35015	35026	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016321	AAGC	3	35430	35441	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016321	CT	6	36058	36068	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016321	CTT	4	36288	36300	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016321	GCG	4	36826	36836	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016321	TCT	4	37880	37891	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016321	TA	7	37945	37958	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016321	TCT	4	38126	38137	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016321	TA	6	38200	38211	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016321	AT	6	38362	38373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016321	AT	6	39504	39515	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016321	AG	6	39543	39553	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016321	AAAAG	3	39727	39741	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016321	GTG	4	39866	39877	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016321	TTC	4	40283	40293	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016321	TTCT	3	41086	41096	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016321	CAAGG	3	41482	41495	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016321	TCT	4	42091	42103	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016321	TA	6	42139	42150	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016321	TCTT	3	42172	42182	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016321	TTCTT	4	43212	43231	20	0 %	80 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
95	NC_016321	TGAA	3	43409	43419	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016321	AGAGGA	3	44122	44138	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_016321	AG	6	44252	44262	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016321	AGAGAA	3	45683	45699	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_016321	AAGA	4	45717	45732	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_016321	TC	6	45860	45870	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016321	CTT	4	46304	46316	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016321	TTCTC	3	46351	46365	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016321	TCC	4	46506	46517	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016321	AAG	4	46659	46671	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016321	CTT	4	46799	46810	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016321	TAG	4	47992	48003	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016321	TA	8	48085	48099	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016321	AAG	4	48229	48240	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016321	TTG	4	49009	49019	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016321	AAG	4	49726	49738	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016321	TC	6	50036	50046	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016321	GGTT	3	50375	50385	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016321	TGAT	3	50555	50566	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016321	AGAA	3	50726	50738	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016321	CTTT	3	51453	51464	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016321	AT	6	52023	52036	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016321	AGA	4	52486	52497	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016321	AAGCT	3	52651	52665	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016321	TA	7	54882	54894	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016321	CTG	4	55019	55030	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016321	CTA	4	55275	55285	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016321	TA	6	55739	55750	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016321	TTTAC	4	56546	56564	19	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
124	NC_016321	CCAA	4	56677	56691	15	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016321	CAGA	3	58148	58158	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016321	CGCA	3	58205	58216	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016321	GAA	4	58846	58857	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016321	AT	6	59037	59047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016321	AG	6	59533	59543	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016321	AGGA	3	60730	60741	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016321	GA	6	61934	61944	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016321	TCTTAT	3	62699	62716	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
133	NC_016321	TCT	4	63145	63156	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016321	AG	6	63541	63551	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016321	TTTC	3	64203	64214	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016321	GA	6	64460	64470	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016321	CCA	4	64957	64968	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 101