ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 81

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016320	GA	6	321	331	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016320	AGA	4	641	654	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016320	AGG	4	852	863	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016320	TA	6	1749	1760	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016320	AAG	4	1861	1873	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016320	GAA	4	1906	1916	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016320	CTT	4	2547	2559	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016320	AGGAG	4	2799	2819	21	40 %	0 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016320	TGAA	3	3003	3013	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016320	GGA	4	3232	3243	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016320	TCTT	3	3381	3392	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016320	TGAA	3	3672	3682	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016320	GAG	4	3754	3765	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016320	CTT	5	4080	4094	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016320	TTTTC	3	4358	4372	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016320	CAAAG	3	4608	4621	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016320	TGAA	3	4678	4688	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016320	AG	6	5401	5411	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016320	TTTG	3	6646	6656	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016320	GGA	4	7038	7049	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016320	GGA	4	7694	7705	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016320	TGAA	3	7730	7740	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016320	AG	6	7766	7776	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016320	GACT	3	8173	8183	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016320	TA	7	8568	8580	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016320	TGAA	3	8884	8894	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016320	GAG	4	8987	8997	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016320	AAGT	3	9643	9654	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016320	CTAT	3	9986	9997	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016320	GA	6	11669	11679	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016320	GA	6	11925	11935	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016320	CAG	4	14244	14254	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016320	AGA	4	14839	14849	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016320	AAGC	3	14901	14912	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016320	AAAG	3	15082	15093	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016320	AAG	4	16453	16463	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016320	ACAAG	3	17084	17098	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016320	CT	8	17326	17340	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016320	AGAA	3	17945	17956	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016320	CT	7	18378	18390	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016320	TC	6	18736	18746	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016320	CTTT	3	19563	19573	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016320	TC	8	20252	20266	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016320	TAG	4	22070	22080	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016320	CTAA	3	23700	23710	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016320	TA	8	23840	23854	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016320	AG	6	24070	24080	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016320	AG	8	24163	24177	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016320	AACC	3	24678	24688	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016320	TTG	4	24952	24962	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016320	ATAA	3	24975	24986	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016320	CTT	4	25169	25179	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016320	GA	6	25253	25264	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016320	CTT	5	25856	25869	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016320	CTAT	3	25949	25960	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016320	CATC	3	26035	26045	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016320	AAGG	3	26528	26539	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016320	TTTA	3	27152	27162	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016320	CGAT	3	27541	27552	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016320	ACT	4	27741	27751	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016320	AATG	3	30640	30652	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016320	CTTTTT	3	31740	31758	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
63	NC_016320	TGT	4	32820	32830	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016320	TTTC	3	33559	33569	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016320	GCTT	3	34079	34089	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016320	TAGG	3	34697	34707	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016320	TTTG	3	35673	35685	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016320	CATA	3	37044	37054	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016320	AAG	4	37403	37415	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016320	TTC	4	37960	37971	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016320	GTCC	3	38097	38107	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016320	TCT	4	38427	38437	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016320	TCT	5	38509	38524	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016320	GACT	3	39521	39531	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016320	CTT	4	39606	39616	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016320	AAGA	3	39713	39724	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016320	CTT	4	40017	40029	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016320	CTT	4	41206	41217	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016320	CT	6	41582	41592	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016320	CT	8	41706	41720	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016320	CTAAG	3	42114	42128	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016320	AAGA	3	42470	42480	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016320	AAGG	3	42681	42691	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016320	TTAAA	3	43493	43506	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016320	TA	6	44264	44275	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016320	TTAC	3	44481	44491	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016320	CGCC	3	46866	46876	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016320	AGA	4	47003	47017	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016320	AG	6	48655	48666	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016320	TC	6	49267	49277	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016320	AGA	5	50054	50067	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016320	AAG	4	50118	50129	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016320	ATAG	3	50330	50340	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016320	TTTGCT	3	50531	50549	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
95	NC_016320	GA	6	50684	50694	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016320	GAG	4	50779	50790	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016320	TGAA	3	50807	50817	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016320	GGAA	3	51837	51848	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016320	TAAA	3	52053	52064	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016320	TTAG	3	53908	53920	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016320	AT	6	53942	53953	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016320	TTTC	3	54141	54151	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016320	ATC	4	54801	54811	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016320	TTC	4	55115	55126	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016320	AGA	4	56259	56269	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016320	TCTT	3	56456	56467	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016320	GAT	4	56651	56663	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016320	AAAG	3	59254	59264	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016320	AAG	4	59410	59421	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016320	TCT	4	59581	59592	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016320	GAG	4	60821	60833	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016320	AG	6	62166	62176	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016320	AG	8	62818	62834	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_016320	GAA	4	63517	63528	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016320	AAG	4	64763	64774	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016320	GAG	4	64999	65010	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016320	CTT	4	65831	65843	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016320	TCTT	3	66050	66060	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016320	AAAG	3	66195	66206	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016320	TA	6	66399	66410	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016320	AAAG	3	66445	66456	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016320	AGG	4	67309	67320	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016320	GA	7	67447	67459	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016320	AT	6	67459	67469	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016320	CTGC	3	67689	67700	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016320	AG	7	68468	68480	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016320	AT	6	68694	68705	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016320	AG	6	69049	69061	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016320	TTAT	3	69864	69875	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016320	TGAA	3	70068	70078	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016320	GA	6	70105	70115	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016320	TGAA	3	70366	70376	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016320	GA	7	70762	70774	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016320	TA	6	70960	70970	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016320	TGAA	3	71202	71212	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016320	TCT	5	72269	72283	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016320	GA	7	72408	72420	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016320	CG	6	72452	72463	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016320	ACT	4	73211	73223	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016320	TA	6	74087	74098	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016320	TTTC	3	74141	74152	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016320	GAA	4	74348	74359	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016320	TA	6	74715	74726	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 81