ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016319	TAC	4	257	268	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016319	TA	6	269	279	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016319	TA	7	574	586	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016319	ACT	4	1900	1911	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016319	CAAG	3	2841	2851	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016319	CTG	4	4067	4077	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016319	GTGG	3	4119	4129	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016319	TAC	4	4628	4638	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016319	CTT	4	4747	4759	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016319	GAAT	3	7081	7092	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016319	TAC	4	7250	7260	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016319	AG	7	7699	7711	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016319	GTCT	3	8080	8090	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016319	TCTT	3	8290	8301	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016319	CCTC	3	8404	8415	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016319	ACAAG	3	8589	8602	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016319	AGG	4	9450	9460	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016319	CCTT	4	9579	9594	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016319	CT	6	9768	9778	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016319	AAG	4	9890	9900	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016319	G	12	9943	9954	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016319	AAAG	3	10132	10142	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016319	ATTC	3	10535	10545	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016319	TA	6	11232	11242	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016319	TGA	4	11730	11741	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016319	AAG	4	12059	12070	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016319	CGGA	3	12905	12915	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016319	TAC	4	13944	13954	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016319	TTTC	3	14798	14809	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016319	AGT	4	15446	15457	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016319	AAGA	3	15477	15487	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016319	AG	7	18087	18100	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016319	TA	9	18514	18531	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016319	AT	7	19191	19203	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016319	TTAC	3	19439	19450	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016319	ACTA	3	19851	19861	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016319	TA	6	19959	19970	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016319	TA	6	20306	20317	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016319	AAGTG	3	20355	20368	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016319	CT	6	20406	20416	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016319	TA	6	20734	20744	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016319	AGAGT	3	20807	20820	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016319	GTA	4	21159	21169	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016319	CA	6	21380	21390	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016319	AGGA	3	21823	21833	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016319	CTT	4	21859	21870	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016319	TA	7	22360	22373	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016319	TAGTA	3	22579	22592	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016319	TTTC	3	24994	25005	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016319	AGAA	3	25217	25228	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016319	ACTT	3	25767	25778	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016319	TA	6	26096	26106	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016319	TTTC	3	26196	26206	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016319	TA	6	26777	26789	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016319	CTT	5	31464	31479	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016319	TTCC	3	32630	32640	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016319	CT	6	32750	32760	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016319	TCC	4	32874	32885	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016319	CTTTT	3	33226	33240	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016319	TAGA	3	33989	33999	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016319	TA	6	35134	35145	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016319	AAG	4	35246	35258	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016319	GAA	4	35291	35301	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016319	CTT	4	35932	35944	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016319	AGGAG	4	36184	36204	21	40 %	0 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016319	TGAA	3	36388	36398	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016319	GGA	4	36617	36628	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016319	TCTT	3	36766	36777	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016319	TGAA	3	37057	37067	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016319	GAG	4	37139	37150	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016319	CTT	5	37465	37479	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016319	TTTTC	3	37743	37757	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016319	CAAAG	3	37993	38006	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016319	TGAA	3	38063	38073	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016319	AG	6	38786	38796	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016319	TTTG	3	40031	40041	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016319	GGA	4	40423	40434	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016319	GGA	4	41079	41090	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016319	TGAA	3	41115	41125	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016319	AG	6	41151	41161	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016319	GACT	3	41558	41568	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016319	TA	7	41953	41965	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016319	TGAA	3	42269	42279	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016319	GAG	4	42372	42382	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016319	AAGT	3	43028	43039	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016319	CTAT	3	43371	43382	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016319	GA	6	45054	45064	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016319	GA	6	45310	45320	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016319	CAG	4	47629	47639	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016319	AGA	4	48224	48234	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016319	AAGC	3	48286	48297	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016319	AAAG	3	48467	48478	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016319	AAG	4	49838	49848	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016319	CTT	4	51409	51419	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016319	CAAA	3	52868	52878	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016319	TCTT	3	54519	54529	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016319	CCCT	3	55325	55335	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016319	CTAC	3	56003	56014	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016319	AAGT	3	56149	56160	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016319	TAG	4	56408	56419	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016319	CGG	4	56986	56996	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016319	AG	6	57198	57208	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016319	TTTTA	3	57748	57762	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016319	AAGA	3	58194	58206	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016319	AAG	4	58210	58220	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016319	AT	6	58460	58470	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016319	CT	7	58828	58840	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016319	AAAG	3	60039	60050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016319	GAG	4	60364	60375	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016319	AG	6	60376	60386	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016319	AAAG	3	60516	60527	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016319	AG	6	60547	60558	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016319	AG	7	60873	60885	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016319	AAAG	3	61587	61598	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016319	CT	6	61966	61976	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016319	CTA	4	62162	62172	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016319	TA	6	62339	62349	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016319	GAAT	3	62871	62881	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016319	ATT	4	64278	64288	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016319	AAAG	3	65111	65121	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 100