ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016318	TGAA	3	570	580	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016318	CT	6	961	972	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016318	AAGC	3	2213	2223	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016318	TA	6	2558	2568	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016318	TA	6	2742	2752	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016318	TACC	3	3363	3374	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016318	TCTA	3	4639	4649	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016318	TC	6	5007	5017	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016318	ACTT	3	5169	5180	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016318	GGCAA	3	5233	5246	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016318	CT	7	5350	5362	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016318	TA	7	7099	7112	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016318	CTTT	3	7334	7346	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016318	TTGA	3	8019	8031	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016318	TTCG	3	10976	10986	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016318	CTTT	3	11193	11204	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016318	AAAAG	3	11314	11328	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016318	TTTC	3	11340	11350	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016318	AATT	3	12573	12585	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016318	CAAC	3	13859	13870	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016318	CAAG	4	14356	14370	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016318	AAGG	3	15100	15110	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016318	TAAA	4	15289	15304	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016318	CA	6	15328	15339	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016318	AAG	4	15621	15632	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016318	CTT	5	16472	16486	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016318	TGAA	3	17748	17758	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016318	TCTT	3	18129	18140	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016318	AC	7	18311	18323	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016318	GTA	4	19001	19011	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016318	TTC	4	19193	19203	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016318	AAAAG	3	20219	20234	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016318	GAA	4	20991	21001	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016318	AAAG	3	21402	21413	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016318	TAAC	3	21475	21486	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016318	GGACT	3	22086	22099	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016318	AATG	3	22393	22404	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016318	CTT	4	22904	22914	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016318	CTA	4	22990	23001	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016318	TA	6	23648	23658	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016318	TTAA	3	24263	24274	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016318	TCTT	3	24812	24824	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016318	AT	6	24942	24953	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016318	GAT	4	25660	25671	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016318	CTT	5	25896	25911	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016318	AGA	4	26407	26417	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016318	AAG	4	27092	27102	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016318	AAAG	3	27163	27173	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016318	AT	7	28728	28741	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016318	TCT	6	28956	28972	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016318	CTT	4	29293	29306	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016318	GTCT	4	29698	29712	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016318	TTTC	3	29725	29735	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016318	TTC	4	29822	29832	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016318	TAA	4	30064	30074	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016318	GAAA	3	30222	30233	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016318	AGG	4	31084	31096	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016318	TA	6	32730	32741	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016318	TA	6	32785	32796	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016318	AAATT	3	33135	33148	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016318	TA	6	33796	33807	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016318	AGA	4	34022	34033	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016318	CTTCT	3	36089	36103	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016318	TCCT	3	36227	36237	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016318	AGT	5	36379	36392	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016318	CAA	4	36962	36973	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016318	TA	6	37144	37154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016318	TTAT	3	39578	39589	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016318	CCT	4	39724	39735	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016318	CCT	4	39745	39756	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016318	TGCT	3	39780	39792	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016318	TA	6	40388	40401	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016318	AAAG	3	41269	41280	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016318	GAT	4	41294	41305	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016318	TC	6	41793	41803	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016318	TAG	4	42867	42878	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016318	A	12	45023	45034	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016318	AG	6	48293	48303	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016318	AT	8	48939	48953	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016318	TGAAT	3	49166	49179	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016318	TGG	4	49295	49306	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016318	CT	6	49604	49614	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016318	GA	6	50097	50107	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016318	AG	6	50160	50170	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016318	GTGA	5	50257	50275	19	25 %	25 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
86	NC_016318	CTTT	4	50385	50399	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016318	CTT	4	50408	50419	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016318	ATTT	3	50973	50984	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016318	TTGA	4	51379	51394	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016318	TATT	3	51442	51453	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016318	TA	6	52191	52201	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016318	AGA	4	52211	52223	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016318	AG	8	52513	52527	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016318	CT	6	53027	53037	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016318	ATAA	3	53176	53187	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016318	TCTA	3	54444	54454	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016318	CT	6	55206	55217	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016318	CTT	4	56007	56018	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016318	ATCCC	3	56378	56391	14	20 %	20 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016318	CT	6	56831	56842	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016318	GTT	4	57057	57067	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016318	TCTA	3	57653	57665	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016318	TCTT	3	57796	57807	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016318	AAAG	3	57843	57854	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016318	CTTT	3	58602	58613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016318	GAA	4	59556	59566	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016318	TA	6	60881	60891	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016318	TC	7	61622	61636	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016318	CT	9	62120	62137	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
110	NC_016318	TC	6	62522	62532	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016318	CTTC	3	62695	62706	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 105