ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 91

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016317	CAAA	3	533	545	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016317	GA	6	1504	1515	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016317	CT	6	1545	1555	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016317	GAAA	3	2043	2053	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016317	GAGGAA	3	2243	2261	19	50 %	0 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_016317	AGA	5	2283	2296	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016317	CTCTCA	3	2406	2423	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
8	NC_016317	AAAAGA	3	2596	2613	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016317	CAAA	3	3792	3802	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016317	CTT	4	4872	4884	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016317	AT	6	4885	4896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016317	TCT	5	5104	5118	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016317	AGAA	3	5564	5574	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016317	TA	6	5773	5784	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016317	CCT	4	6272	6282	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016317	CTC	4	6305	6316	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016317	TTCTT	3	6394	6408	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016317	CTTT	3	6538	6548	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016317	TC	6	6609	6619	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016317	TA	6	6647	6658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016317	AG	6	6933	6943	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016317	GA	7	6958	6970	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016317	GAGAG	3	7065	7079	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016317	AG	6	7108	7119	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016317	GA	7	7959	7971	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016317	AAAG	3	8234	8245	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016317	GAAA	4	8471	8487	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_016317	CCTT	3	8961	8971	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016317	CATA	3	9701	9712	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016317	CT	6	10200	10210	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016317	AG	6	12743	12753	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016317	AAGG	3	12778	12789	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016317	AATC	3	13087	13098	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016317	CT	6	13118	13128	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016317	GCTT	3	13138	13148	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016317	TAT	4	14048	14058	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016317	TTGC	3	15249	15260	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016317	CT	6	15311	15321	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016317	GCA	4	15631	15643	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016317	TA	6	17490	17501	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016317	AGC	4	18548	18559	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016317	TAGA	3	18677	18688	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016317	AT	6	19086	19097	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016317	AG	6	19504	19514	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016317	GTTTT	3	19547	19562	16	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016317	CT	6	20114	20125	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016317	CTTT	3	20292	20303	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016317	TAA	4	22069	22080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016317	AT	6	23541	23552	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016317	TACA	3	23827	23837	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016317	GGA	4	24717	24728	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016317	GGAA	3	24876	24887	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016317	GAA	4	25395	25406	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016317	CT	6	25746	25756	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016317	TC	6	26207	26217	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016317	AT	6	26746	26757	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016317	GAAG	3	27787	27798	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016317	TC	6	29295	29305	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016317	CT	6	31888	31899	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016317	CTAT	3	32564	32574	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016317	CTT	4	32956	32966	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016317	AGT	4	33979	33991	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016317	AG	6	34160	34170	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016317	AAAGG	3	35131	35146	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016317	CAAAA	3	35702	35715	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016317	TTGC	3	36035	36046	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016317	GAAA	3	36140	36151	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016317	CTT	4	36490	36502	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016317	AGTC	3	36706	36716	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016317	CTTTT	3	37863	37878	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016317	AGA	5	38037	38052	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016317	AG	7	39450	39462	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016317	AAAC	3	39843	39853	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016317	AAAG	4	40220	40234	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016317	TA	6	40512	40523	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016317	TCT	4	40609	40621	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016317	TAG	4	40868	40878	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016317	TAG	4	42881	42892	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016317	AT	7	43096	43109	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016317	TGAA	3	43638	43648	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016317	GAA	4	43718	43730	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016317	TTTG	3	43805	43817	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016317	TGAA	3	44445	44455	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016317	TTAG	3	44531	44541	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016317	CTTT	3	44555	44565	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016317	AG	7	45755	45769	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016317	GCAAA	3	46350	46363	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016317	TCTT	4	46731	46746	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016317	GAAGAG	3	46755	46772	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_016317	GAGAG	3	47340	47355	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016317	AGTC	3	47487	47498	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016317	AG	6	47948	47958	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016317	TCTT	3	48090	48100	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016317	AAGGAG	3	48303	48319	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_016317	TGAA	3	48652	48662	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016317	AGA	4	49234	49244	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016317	AAGT	3	49431	49441	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016317	CTTT	3	49444	49454	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016317	CG	7	50591	50604	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016317	GA	6	50602	50612	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016317	GAG	4	50739	50749	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016317	GCTT	3	51501	51512	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016317	GTCA	3	51966	51978	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016317	TAG	4	52516	52526	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016317	TC	6	52911	52921	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016317	TC	7	53181	53193	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016317	CTTT	3	53686	53696	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016317	AT	6	54065	54076	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016317	TA	6	54671	54681	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016317	CG	6	54686	54697	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016317	TCCTTC	3	54857	54873	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
112	NC_016317	AGAA	3	55376	55387	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016317	CTTT	3	55429	55440	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016317	GAA	4	56392	56403	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016317	AGA	4	57760	57772	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016317	GA	7	58419	58431	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016317	CG	7	58472	58485	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016317	GAGG	3	58928	58940	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016317	AGCT	3	59166	59176	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016317	AAAG	3	59210	59221	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016317	AGA	4	59373	59383	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016317	GAAA	3	59475	59487	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016317	CTTT	3	59505	59515	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016317	AAAG	3	59974	59985	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016317	GAT	4	60580	60590	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35796727
126	NC_016317	AATCT	3	61461	61474	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	35796727
127	NC_016317	CTTT	4	61626	61640	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016317	TC	6	62465	62475	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016317	CTTT	4	62910	62924	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
130	NC_016317	GAA	4	63892	63903	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016317	AAG	4	64571	64581	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016317	GAG	4	64794	64805	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016317	TGAA	3	64851	64861	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016317	GA	7	64888	64900	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016317	GGA	4	64982	64993	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016317	GAG	4	65011	65022	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016317	TGAA	3	65055	65065	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016317	CAT	4	66473	66484	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016317	GGA	4	67446	67456	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016317	CGAG	3	67466	67478	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016317	AG	7	67776	67788	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016317	CT	6	67985	67995	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016317	CT	6	68000	68010	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016317	GAAA	3	68165	68175	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016317	GAA	4	68314	68325	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016317	TC	6	68839	68849	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016317	CT	7	68966	68978	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
148	NC_016317	CCT	4	69148	69158	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 91