ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 89

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016316	AGGAG	4	185	205	21	40 %	0 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016316	TGAA	3	274	284	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016316	GA	6	573	583	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016316	CG	6	775	786	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016316	GAAA	5	832	851	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_016316	TTGACT	3	1000	1018	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
7	NC_016316	AAGA	3	1141	1152	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016316	ACAA	3	1168	1178	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016316	TCT	4	2185	2197	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016316	AGGA	3	2476	2487	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016316	TA	7	3757	3770	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016316	CTT	4	5041	5051	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016316	AGC	4	6492	6503	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016316	TAC	4	7976	7987	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016316	CTGGT	3	8681	8694	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016316	AG	6	9385	9396	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016316	TA	6	9467	9477	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016316	GA	6	9561	9571	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016316	AT	6	11089	11099	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016316	CTA	4	11258	11268	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016316	CTG	4	11826	11837	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016316	TAG	4	12152	12163	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016316	TTG	4	13147	13157	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016316	TC	6	14566	14576	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016316	AT	7	15634	15647	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016316	TA	8	15667	15682	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016316	GAAT	3	16384	16394	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016316	TA	11	17554	17574	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016316	GGGT	3	18516	18527	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016316	TA	12	19449	19470	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016316	AAGA	3	19825	19836	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016316	ACT	4	20611	20622	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016316	GTA	5	21374	21387	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016316	AAAG	3	21566	21576	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016316	CGCT	3	22219	22230	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016316	AGAA	4	23960	23975	16	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016316	AGTA	3	25017	25028	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016316	TTTTC	3	25390	25404	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016316	TCTG	4	25888	25902	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016316	CTCTT	3	25921	25935	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016316	CTT	4	26245	26256	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016316	CCT	4	26338	26348	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016316	TTAC	3	26767	26779	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016316	GA	6	26929	26939	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016316	CTTT	3	27320	27331	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016316	CCTT	3	28087	28098	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016316	CT	6	29103	29113	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016316	GAA	4	29964	29975	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016316	CTTT	3	31574	31585	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016316	TAG	4	31976	31987	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016316	ATC	4	34185	34195	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016316	ATG	5	34289	34303	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016316	TAAG	3	35211	35221	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016316	CA	6	36044	36054	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016316	AAAG	4	36260	36274	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016316	AAAG	3	36384	36394	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016316	GAA	4	37111	37122	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016316	ACT	4	38689	38699	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016316	TCAA	3	39942	39953	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016316	TCA	4	40081	40092	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016316	TCT	4	40499	40510	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016316	TCC	4	42261	42273	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016316	TCT	4	43747	43758	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016316	CTTT	3	43769	43779	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016316	TTTC	3	44223	44233	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016316	GAG	4	44522	44533	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016316	AAAG	3	44756	44766	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016316	AG	6	44871	44882	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016316	CTTG	4	45736	45752	17	0 %	50 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
70	NC_016316	CTC	4	45851	45862	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016316	CCT	4	45913	45924	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016316	CT	7	46159	46173	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016316	AAAG	3	46658	46670	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016316	GAAT	3	46832	46842	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016316	CTT	4	48143	48155	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016316	CTT	4	48573	48585	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016316	TAC	4	49148	49159	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016316	CTT	4	49338	49348	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016316	TTC	4	49497	49507	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016316	AGA	4	50683	50693	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016316	GA	8	51712	51726	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016316	TCT	4	52826	52836	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016316	CTTT	3	52871	52883	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016316	GGA	4	53505	53516	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016316	AGA	4	53530	53541	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016316	TTTG	3	53784	53796	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016316	GA	6	53869	53879	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016316	CG	6	54183	54194	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016316	TCT	4	54263	54275	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016316	GTAG	3	54327	54338	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016316	GA	6	54938	54948	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016316	GA	7	55051	55063	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016316	TC	6	55201	55211	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016316	GAAA	3	55244	55254	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016316	AAAC	3	55268	55278	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016316	CTT	4	56574	56584	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016316	GAA	4	56717	56728	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016316	CCAA	3	56843	56854	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016316	TC	6	56896	56907	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016316	GA	6	57578	57588	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016316	CTT	4	57942	57952	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016316	TGAA	3	59071	59081	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016316	GA	6	59085	59095	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016316	CTTT	3	59504	59519	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016316	TCTT	3	59904	59915	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016316	CT	6	60265	60275	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016316	AGTT	3	60443	60453	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016316	TTA	4	62194	62204	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016316	AT	6	63144	63154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016316	AT	6	63300	63311	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016316	AAG	4	64891	64902	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016316	AT	6	65112	65123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016316	GA	6	66779	66789	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016316	CG	6	66959	66970	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016316	TGAA	3	67292	67302	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016316	TTC	4	67565	67576	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016316	AAG	4	67955	67966	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016316	ACA	4	68028	68038	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016316	GTTT	3	68932	68943	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016316	TCAAG	3	68979	68992	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016316	TC	7	69363	69375	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016316	AT	6	69971	69981	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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