ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016315	A	13	858	870	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016315	CTT	4	1921	1932	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016315	TTCG	3	2122	2132	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016315	TTATT	3	4859	4872	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016315	ACTT	3	5092	5102	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016315	TAT	4	6890	6900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016315	GGAA	3	8059	8069	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016315	GCCAA	3	8561	8574	14	40 %	0 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016315	CT	6	8984	8995	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016315	CAA	4	9518	9528	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016315	TCT	4	9545	9555	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016315	CT	6	10018	10028	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016315	TA	7	10338	10351	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016315	AAG	4	10629	10640	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016315	TATT	3	11003	11013	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016315	AGT	4	12046	12058	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016315	AAGA	4	12726	12741	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016315	CTT	4	14083	14095	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016315	TC	11	14494	14513	20	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
20	NC_016315	TCT	4	14671	14682	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016315	TCT	4	14965	14976	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016315	TA	6	15333	15343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016315	CTA	4	15394	15405	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016315	TCG	4	16559	16570	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016315	ATG	4	16622	16632	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016315	CCT	4	18253	18264	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016315	TAG	4	18520	18531	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016315	TGCTT	3	18544	18557	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016315	CTA	4	19362	19373	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016315	AAGTA	3	19807	19821	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016315	AAGCA	3	21110	21125	16	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016315	CGA	4	21392	21403	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016315	TA	8	21518	21532	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016315	TCT	4	23184	23195	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016315	CA	7	23270	23282	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016315	TAG	4	23470	23480	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016315	GTTG	3	24128	24138	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016315	CTTT	3	24369	24381	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016315	ATGAGC	3	24547	24564	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016315	GTCA	3	24714	24725	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016315	AGA	5	25958	25972	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016315	AG	6	26545	26555	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016315	TCTT	3	27477	27488	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016315	ACT	5	28141	28155	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016315	TA	7	28920	28932	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016315	CTTA	3	30436	30447	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016315	TA	7	31631	31643	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016315	AAG	5	31860	31874	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016315	TC	6	33128	33139	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016315	AG	6	33487	33497	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016315	AG	7	33997	34010	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016315	TTC	4	34032	34043	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016315	TA	6	34408	34419	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016315	CTT	4	34421	34431	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016315	CCTTT	3	34557	34571	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016315	CTTA	3	35503	35514	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016315	TGC	4	36849	36861	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016315	ACTG	3	37294	37304	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016315	TAC	4	37339	37350	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016315	CTT	4	39476	39487	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016315	CT	6	40363	40374	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016315	AATAT	3	40522	40536	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016315	TTCA	3	40819	40830	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016315	ATGG	3	40944	40956	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016315	CTG	4	41576	41587	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016315	CTG	4	42035	42045	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016315	AGT	4	42088	42098	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016315	AT	6	42427	42438	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 128