ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 29

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016314	CGC	4	409	419	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016314	CT	6	2159	2169	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016314	TA	8	3319	3333	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016314	GTA	4	3840	3851	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016314	GAC	4	4530	4541	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016314	AT	6	5859	5869	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016314	CTTC	3	6800	6810	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016314	GTTT	3	7112	7122	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016314	AGC	4	7879	7889	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016314	TAAG	3	9683	9693	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016314	TTTGGA	3	11024	11040	17	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016314	GAA	4	11182	11194	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016314	AAG	4	12008	12019	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016314	CTTA	3	12246	12261	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016314	GCT	4	12818	12828	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016314	AATT	3	13816	13828	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016314	CCTTCT	3	15291	15307	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
18	NC_016314	GATCA	3	17765	17779	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016314	TA	7	18496	18508	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016314	TG	6	19525	19535	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016314	ATG	4	19568	19579	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016314	TA	7	22043	22055	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016314	GA	6	23095	23105	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016314	GA	8	23396	23410	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016314	TTGG	3	23501	23512	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016314	TTTC	3	23729	23739	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016314	TA	6	24251	24262	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016314	GA	6	24459	24469	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016314	TCT	4	25067	25077	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016314	AGA	5	26130	26144	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016314	GACAA	3	26607	26620	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016314	GACAA	3	26737	26750	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016314	TC	6	26861	26871	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016314	GTC	4	27443	27453	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016314	AGA	4	28988	28999	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016314	CT	6	29912	29922	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016314	TCTT	4	30816	30831	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016314	ACT	4	31499	31511	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016314	AATA	3	32544	32554	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016314	CTT	4	32917	32928	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016314	TGAA	3	33449	33459	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016314	AGA	4	34002	34012	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016314	AG	6	34562	34573	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016314	CTT	5	34697	34711	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016314	CTTGG	3	34982	34995	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016314	AAGT	3	38455	38465	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016314	AATAA	3	38685	38698	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016314	TTC	4	39390	39401	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016314	CGAA	3	41425	41435	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016314	TTTG	3	41483	41493	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016314	CTATAA	3	43263	43279	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
52	NC_016314	AAAG	3	43419	43429	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016314	CTTT	3	44991	45001	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016314	TA	7	45078	45091	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016314	TAC	4	45418	45429	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016314	TGAA	3	46685	46696	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016314	AG	6	47141	47152	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016314	AAAG	3	47650	47661	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016314	TCTT	3	47856	47866	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016314	CTT	4	47881	47893	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016314	CTT	4	48527	48538	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016314	CT	6	49124	49134	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016314	CTT	4	49417	49427	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016314	CTGCT	3	49667	49681	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016314	GAGAG	3	49856	49871	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016314	AT	6	50593	50604	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016314	GA	6	50647	50657	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016314	GAG	4	50707	50718	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016314	GAG	4	50986	50997	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016314	CTTT	3	51119	51130	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016314	TC	6	51359	51369	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016314	GA	6	52224	52234	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016314	AAG	4	52442	52453	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016314	CTTGA	3	53200	53214	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016314	AAG	4	53425	53435	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016314	CTT	4	53599	53610	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016314	AAG	4	53771	53782	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016314	CT	12	54416	54438	23	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016314	CTC	4	54659	54669	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016314	AGGC	3	55105	55116	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016314	GAA	4	55849	55860	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016314	CT	6	55873	55883	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016314	TAAGAA	3	56299	56316	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016314	AGA	4	56654	56664	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016314	AAGAA	3	57510	57523	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016314	TAGT	3	57763	57774	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016314	CT	6	58231	58241	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016314	TTCT	3	58558	58569	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016314	TCT	4	59509	59521	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016314	TCA	4	59884	59895	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016314	TCTCC	3	59986	60001	16	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016314	TCT	4	60164	60174	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016314	TCC	4	61269	61280	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016314	TA	6	61905	61916	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016314	TCT	4	62479	62490	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016314	ATAG	3	63324	63334	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016314	GA	6	63737	63747	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016314	GA	6	63942	63952	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016314	TTC	4	64334	64345	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016314	CTT	4	64584	64595	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016314	CCTT	3	65010	65020	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016314	AT	6	66423	66433	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016314	GAGAG	3	66496	66511	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016314	TTC	4	66589	66600	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016314	AT	6	67913	67924	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016314	CCT	4	68601	68611	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016314	TCTCCT	3	68633	68649	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016314	TCT	4	68955	68966	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016314	GA	6	69250	69260	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016314	GA	6	69366	69376	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016314	GAG	4	69431	69442	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016314	CTTT	3	69686	69697	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016314	TC	7	69714	69726	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016314	CT	8	69803	69817	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016314	TTTG	3	70373	70383	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016314	AGTC	3	70609	70619	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016314	CTTT	3	70627	70637	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016314	AT	6	71923	71934	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016314	TCCT	3	72629	72640	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016314	GCGG	3	73556	73566	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016314	CTT	4	75687	75698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016314	CTG	4	75890	75900	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016314	GA	6	76100	76111	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016314	TAG	4	76132	76142	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016314	AG	6	76148	76158	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016314	TA	7	76350	76362	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016314	ACT	4	76675	76685	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016314	TCT	4	76711	76722	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016314	TGGC	3	77093	77104	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016314	TC	6	77153	77163	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016314	GCAA	3	77259	77270	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016314	AG	6	77688	77698	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016314	GCCC	3	77951	77961	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016314	AAAC	3	77983	77995	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016314	AAAG	3	78304	78315	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016314	CTG	4	78557	78567	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016314	AGA	4	79394	79404	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016314	TCTT	3	80131	80141	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016314	AAAG	3	80695	80706	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016314	CTT	5	80844	80857	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016314	AT	6	82212	82223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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171	NC_016314	TC	6	102972	102982	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
172	NC_016314	TC	6	103051	103061	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 29